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xlsx的OutOfMemoryError

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生信编程日常

发布于 2020-04-01 08:15:57

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文章被收录于专栏：生物信息学、python、R、linux生物信息学、python、R、linux

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将数据读入或者导出到xlsx文件的时候，常常需要循环写出，如 res <- read.xlsx("edgeR_DEgenes.xlsx",1) write.xlsx(data_vitro_down, file="edgeR_DEgenes.xlsx", sheetName = i, append=TRUE, row.names=FALSE) 可能会出现内存不足的报错： Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space 一般只需要重启R或者Rstudio，然后再读入R包前加上options( java.parameters = "-Xmx5000m")就可以，但是一定要在library之前加，如果library之后加是没有用的。

options( java.parameters = "-Xmx5000m")
library(xlsx)

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