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circos 可视化手册- fonts 篇

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生信修炼手册
发布2020-05-09 17:46:51
发布2020-05-09 17:46:51
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文章被收录于专栏:生信修炼手册生信修炼手册

circos中,fonts, colors, patterns这3个系统内置的block, 通过同一个配置文件引入,写法如下

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>

这个文件的内容如下:

通过include, 将color, fonts, patterns对应的3个配置文件分别引入。

本章看下fonts相关的内容,etc/fonts.conf的部分内容如下:

文件内容为key = value的形式,key代表字体的名字,value代表字体对应的文件。

对于字体文件,有以下两种格式

  1. TTF
  2. OTF

在软件安装目录的fonts目录下,可以看到对应的字体文件

代码语言:javascript
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├── modern
│   ├── Changes
│   ├── cmunbbx.otf
│   ├── cmunbi.otf
│   ├── cmunbl.otf
..............
│   ├── cmunui.otf
│   ├── cmunvi.otf
│   ├── cmunvt.otf
│   ├── FAQ
│   ├── Fontmap.CMU
│   ├── Fontmap.CMU.alias
│   ├── fonts.dir
│   ├── fonts.scale
│   ├── INSTALL
│   ├── LICENSE
│   ├── README
│   └── TODO
├── README.fonts
└── symbols
   ├── circossymbols.fog
   ├── circossymbols.otf
   └── circossymbols.png

内置字体的效果可以参考以下链接

http://circos.ca/documentation/tutorials/configuration/configuration_files/images

下面的示意图是从这个网站截取的

通常情况下,直接使用系统内置的字体就好。当想要自定义字体时,步骤如下

  1. 将字体文件拷贝到软件安装目录的fonts目录下
  2. fonts.conf文件中添加该字体的配置

示例如下, 首先在etc/fonts.conf中指定新增的字体的名字和字体文件的路径

mynewfont = /path/to/myfont.ttf

circos.conf文件中,

label_font = mynewfont

即可调用新字体了。

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原始发表:2018-05-10,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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