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肺癌:流行病学和生信病理

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芒果先生聊生信
发布2020-08-05 23:46:10
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发布2020-08-05 23:46:10
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文章被收录于专栏:芒果先生聊生信

根据国家癌症中心最新发布的《2015年中国恶性肿瘤流行情况分析》,肺癌高居恶性肿瘤发病率榜首,在392.9万例新发恶性肿瘤病例中,约有1/5都是肺癌患者(全球发病率为11.6%,死亡率18.4%)。肺癌多发生于40岁以后,高峰发病年龄在70~79岁之间。男性患者多于女性,在我国男、女性比例为2.13:1。

在第九版《内科学》关于肺癌的描述如下,仍然适用。

知识点1:低剂量螺旋CT是肺癌体检首选

低剂量螺旋CT是目前筛查肺癌最主要的手段,80%以上的早期肺癌都能够被识别。重度吸烟、有职业暴露、有家族遗传史、有慢性肺部疾病等高危人群,最好从45岁开始,每年进行一次低剂量螺旋CT检查。低风险人群则可以适当降低筛查频率,每两三年进行一次低剂量螺旋CT检查即可。(希望从事肺癌工作的医生们,可以把时间再精确些;也希望我们国家的工程师可以把CT仪器做得更好,不要总是依靠进口)。

知识点2:女性肺癌发病率飙升(肺腺癌)

一直以来,普遍认为男性患肺癌的风险更高,但越来越多数据显示,女性肺癌发病率正在飙升。中国医学科学院肿瘤医院胸外科主任薛奇教授解释说,从病理类型上,肺癌主要分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌两大类型,后者占90%左右。肺鳞癌和肺腺癌均属于非小细胞癌,男性以鳞癌为主,女性以腺癌为主。近年来,腺癌患者比例明显升高,这与女性肺癌数量增加有关。

造成女性肺癌发病率快速升高的原因还不是非常明确,有专家提出了几个可能因素,包括:女性吸烟人数增加;女性接触二手烟、厨房油烟的概率大;空气污染等。

知识点3:肺部结节不等于肺癌

肺结节是一个影像学概念。肺部影像出现圆形或类圆形不正常的阴影,直径大于3厘米称肿物,而小于3厘米称为结节,其中小于1厘米通常称为小结节。但肺部结节不等于肺癌。

根据影像学特征,结节可以分为良性结节和恶性结节。其中80%-90%的小结节都是良性的,只有不到20%的小结节是恶性的。

若发现肺部存在结节,要去正规医院找医生就诊。医生会给出诊断建议或治疗建议。如无法明确诊断,医生有可能会给出随诊建议,动态观察结节变化情况,既使结节是恶性的,短期随诊一般也没问题,因此不必过分担心和惊慌。

肺癌的生信分析和组学研究,是在上述流行病学和病理学基础上的升华。km plotter数据库Pan-Cancer(数据源于RNA-seq分析)中,肺癌主要分为肺腺癌(代表非小细胞肺癌,肺鳞癌数据是缺失的)和肺小细胞癌。

但是,芒果发现,在PrognoScan数据库中,肺癌的生存数据更全面些,包括肺鳞癌和肺腺癌,但是矛盾点是还有非小细胞肺癌的资料,搞得有点混淆,这是上传数据的时候作者们命名混乱而导致的。我们能使用就可以,因为小细胞肺癌和其他类型肺癌比例非常低,研究的意义有限。

因此,在做生信分析时,我们只需要关注基因与非小细胞肺癌的关系即可,包括基因差异表达,生存分析和免疫浸润。

综合整理自第九版内科学教材和网络。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-08-05,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 芒果先生聊生信 微信公众号,前往查看

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