ggrepel解决标签之间重叠问题
ggrepel解决标签之间重叠问题
生信编程日常
发布于 2020-12-16 18:10:50
发布于 2020-12-16 18:10:50
代码可运行
运行总次数：0
代码可运行
有时候画图需要给样本添加标签，当样本比较多，在图形中添加标签容易出现标签遮盖的问题，这个时候可以用ggrepel包的geom_text_repel()解决样本标签重叠问题。 当用geom_text()添加标签时会出现重叠现象：
ggplot(mtcars)+ geom_point(aes(wt, mpg), color="blue")+
geom_text(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))+
theme_classic(base_size = 16)
用geom_text_repel()代替geom_text()时则不会重叠：
library(ggrepel)
ggplot(mtcars)+ geom_point(aes(wt, mpg), color="blue")+
geom_text_repel(aes(wt, mpg, label=rownames(mtcars)))+
theme_classic(base_size = 16)
在用seurat分析单细胞数据时也常出现标签覆盖问题， 可以通过设置repel = TRUE来解决。
DimPlot(brain.integrated, reduction = "umap", group.by = "orig.ident", label = TRUE) + NoLegend()
DimPlot(brain.integrated, reduction = "umap", group.by = "orig.ident", label = TRUE, repel = TRUE) + NoLegend() 
本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划，分享自作者个人站点/博客。
如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
评论
登录后参与评论
推荐阅读
腾讯云开发者
