Mark~PNAS全球海洋沉积物微生物多样性

PNAS今年出了一篇文章研究全球海洋沉积物中微生物多样性。

全文：

https://sci-hub.se/downloads/2020-10-20//e2/10.1073@pnas.1919139117.pdf

已经有了全文翻译，正好省事了，见 微生态 公众号：

科研 | PNAS: 全球海洋沉积物中微生物群落的多样性特征

本文总结一下几点有用的东西。

1. 文章分析方法非常简单。

最后阶段用五种不同的SAR模型估计了全球海洋沉积物中微生物的物种数。关键是貌似其中几种还不是很常用。

参考材料：

https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2020/10/13/1919139117.DCSupplemental/pnas.1919139117.sapp.pdf

2.另外作者还提到了Locey and Lennon的尺度定律。至于为什么不用尺度定律而用SAR的方法，作者引用了Willis的文章。这部分关于尺度定律的讨论之前已经介绍过，见：

1. PNAS(2016)-尺度定律预测全球微生物多样性

2. Scaling law的争论~

2中第一篇就是Willis的文章。

3. 作者同时利用以上五种SAR方法估计了其他生境中古菌和细菌多样性，包括表层土（topsoil）,海水（seawater）,海底（subseafloor）,海洋（ocean），结果可作为参考数据使用。稀释的方法采用rtk，之前介绍过：

RTK：针对大数据的稀释曲线

作者发现测序深度和是否去除污染物对使用SAR方法估计多样性差别不大。