Loading [MathJax]/jax/output/CommonHTML/config.js
前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >专栏 >Cancer-Mine: 基于文本挖掘的癌症数据库

Cancer-Mine: 基于文本挖掘的癌症数据库

作者头像
生信编程日常
发布于 2020-05-04 13:25:05
发布于 2020-05-04 13:25:05
7010
举报

CancerMine (http://bionlp.bcgsc.ca/cancermine/) 是一个基于文本挖掘的有关于驱动基因,致癌基因和抑癌基因数据库。2019年发表于Nature Methods上。

home page

可以直接查询某一个Gene在不同类型的癌症的分布情况:

查询某一种癌症中的基因情况:

提交一系列基因列表,查看与癌症的联系:

不同基因在不同类型的癌症中的重要性,越明亮越重要:

paper:https://www.nature.com/articles/s41592-019-0422-y

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自作者个人站点/博客。
如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 作者个人站点/博客 前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
暂无评论
推荐阅读
编辑精选文章
换一批
Anaconda——安装及基本使用
官网:https://www.anaconda.com/ 下载页面: https://www.anaconda.com/download (巨慢|还是访问tuna来下载吧) 清华大学开源软件镜像站:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/
思索
2024/08/15
1540
Anaconda——安装及基本使用
anaconda python更换清华源
在使用anaconda python环境过程中你会发现使用conda下载包的速度非常的慢,因为使用的是国外的服务器,所以这里要设置为国内的镜像。使用下面的配置命令即可:
py3study
2020/01/06
11.4K0
了解 Anaconda
Anaconda 是一个 Python 的科学计算发行版,有包含超过100个在数据科学中比较受欢迎的 Python, R, Scala 的分支,超过720个 package。Anaconda 提供了一个编译好的环境可以直接安装,可以为开发者省去很多编译出错、兼容性等的问题。补充一个官网上 Anaconda 的定义:
runzhliu
2020/08/05
1.2K0
万字长文:深度全面了解Conda的各种骚操作,强烈建议收藏
本文重点分享Python的包管理工具和环境管理工具:conda。 未来的日子中,期待和大家一起成长,一起分享高质量原创文章
小码匠
2022/06/16
3.3K0
万字长文:深度全面了解Conda的各种骚操作,强烈建议收藏
Evil Package
那如果我们安装packages是恶意的怎么办呢,我们根据手册编写如下恶意setup.py
Jumbo
2018/12/05
5400
Intro Guide to Dockerfile Best Practices
There are over one million Dockerfiles on GitHub today, but not all Dockerfiles are created equally. Efficiency is critical, and this blog series will cover five areas for Dockerfile best practices to help you write better Dockerfiles: incremental build time, image size, maintainability, security and repeatability. If you’re just beginning with Docker, this first blog post is for you! The next posts in the series will be more advanced.
追马
2020/07/06
8900
Python虚拟环境(pipenv、venv、conda一网打尽)[通俗易懂]
要搞清楚什么是虚拟环境,首先要清楚Python的环境指的是什么。当我们在执行python test.py时,思考如下问题:
全栈程序员站长
2022/09/27
51K0
Python虚拟环境(pipenv、venv、conda一网打尽)[通俗易懂]
python的环境,你再也不用愁
conda是一个包,依赖和环境管理工具,适用于多种语言,如: Python, R, Scala, Java, Javascript, C/ C++, FORTRAN。
用户10002156
2022/12/21
6210
Anaconda使用总结
1、Anaconda简介2、Anaconda安装(Linux和Windows)3、Conda的包管理与环境管理
用户7886150
2021/01/26
9220
Micro/Mamba 安装与注意事项
Mamba 可以使用 Mambaforge 方法和已有 Mini/conda 的方式安装,官方推荐的是前面一种,即使用 Mambaforge 进行全新安装。
章鱼猫先生
2023/09/17
6.7K0
Micro/Mamba 安装与注意事项
Ubuntu使用PlayOnLinux笔记
playonlinux官网:https://www.playonlinux.com/en/
zhangrelay
2019/01/23
2.2K0
Python 之 pip安装 及 使用详解
  pip 是 Python 的包安装程序。其实,pip 就是 Python 标准库(The Python Standard Library)中的一个包,只是这个包比较特殊,用它可以来管理 Python 标准库(The Python Standard Library)中其他的包。pip 支持从 PyPI,版本控制,本地项目以及直接从分发文件进行安装。pip 是一个命令行程序。 安装 pip 后,会向系统添加一个 pip 命令,该命令可以从命令提示符运行。   目前,pip 是 The Python Packaging Authority (PyPA) 推荐的 Python 包管理工具!英文比较好的同学可以直接去官网参看其用户手册
全栈程序员站长
2022/07/01
2.3K0
Python 之 pip安装 及 使用详解
Ubuntu翻译之man(8)apt-get
apt-get - APT package handling utility -- command-line interface
可学了些精致的淘气
2024/08/30
1290
conda install 下载慢 报错解决
如果清华大学镜像源里面没有这个库,那么还是会从原来的镜像https://repo.anaconda.com/pkgs/main/里面下载。
机器学习和大数据挖掘
2020/04/23
1.6K0
Python数据科学利器
Anaconda是一个python的科学计算发行版,其附带了一大批常用的数据科学包,不用再使用pip安装数据科学包,再也不用为各种数据科学包版本和依赖冲突发愁了,哈哈。
伊泽瑞尔
2022/05/31
4630
Python数据科学利器
Python第三方库管理Pip和Conda
在本机开发完程序后,需要把程序移植到服务器之类的目标机上运行,或者分发给其余同事,经常会遇到第三方库管理,或者是不同项目之间用到的第三方库版本不一致,例如有时候需要tensorflow 1版本,有的时候希望用最新的2.3版本,这样导致了运行环境的管理复杂度,对于第三方库管理推荐通过Anaconda来解决这个痛点,通过不同的env解决环境配置问题。
用户9925864
2022/07/27
1.4K0
Python第三方库管理Pip和Conda
手把手教你运行一个五子棋模型AlphaZero_Gomoku
项目地址GitHub - junxiaosong/AlphaZero_Gomoku:Gomoku的AlphaZero算法的实现(也称为Gobang或Five in a Row)
洛墨-天染-依然
2022/05/10
2.9K1
Anaconda安装使用
Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,支持 Linux, Mac, Windows系统,提供了包管理与环境管理的功能,可以很方便地解决多版本python并存、切换以及各种第三方包安装问题。Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理,并且已经包含了Python和相关的配套工具。所以conda 是开源包(packages)和虚拟环境(environment)的管理系统。
oriRNA
2018/05/29
4.8K4
Anaconda安装使用
Python - pip 常用命令
pip(Python Package Index)是一个以 Python 语言写成的软件包管理系統,使用 pip 可以非常方便的安装和管理 python 软件包
小菠萝测试笔记
2021/08/25
6060
python所遇到的坑
我是在ubuntu中,自带的有python2,python3有安装了anaconda套件,所以python的版本很多,曾经想删除过不用的python. 先执行 sudo apt remove python* 在想安装anaconda,结果悲剧了,xorg没有了,结果只能cmd玩耍了,一气之下重装ubuntu18系统了 dflx@dflx:~$ ps -t tty1 PID TTY TIME CMD 1889 tty1 00:00:00 gdm-x-session 1891
热心的社会主义接班人
2018/07/04
2.2K0
相关推荐
Anaconda——安装及基本使用
更多 >
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档