DAY4-白雪

总结引用于微信公众号生信星球

R语言

任务

1，安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）

2，了解R语言

3，基本操作

4，画图

先安装

1 查看电脑用户名是中文还是英文（要是中文的话会比较麻烦）

• 电脑桌面随便打开一个文件夹，看一下桌面（Desktop）的上一级就是用户名。经查看是Administrator，英文

2 假设是中文的话

引用于微信公众号，生信星球，强推

如果你的用户名不幸是中文的，那就必须改为英文，否则无法安装Rstudio,中文处理方法，参考

Rstudio杠上中文用户名

注意：很重要！所有自己的重要文件请保持云备份的习惯：坚果云、iCloud云盘都是非常好的双向同步云

3下载

• 在bing中直接搜索R,点进去，因为是国外的所以选择镜像下载更加快速一点
  

  Snipaste_2023-01-11_11-11-47.png
• 选择china的镜像网址，然后下载相应的

Snipaste_2023-01-11_11-11-47.png

• 下载Rstudio
  • 直接bing搜索，Rstudio

Snipaste_2023-01-11_11-11-47.png

选择免费版，默认是MAC，下拉选择windows对应的

• 下载完成后，要先安装R语言，但是此处要注意的是，不要改动任何东西，有一个message xxx选中的话会出现中文提示语，不选中的话就是英文的，其余都不要改动，直接下一步，下一步......完成
• 安装完R语言后，安装rstudio,点击下载的，然后不要改动，下一步，下一步......完成
• 更改权限（省的以后有各种提示）R语言的library,右键，属性，安全，编辑，选中完全控制，R.exe(bin文件夹)，和rstudio.exe也要改一下.

认识R和Rstudio

引用自微信公众号生信星球

R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。

R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。

RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。

Rstudio,打开长这样

引用自微信公众号生信星球

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• 作图学习
  • plot是R中的基本画图工具，直接plot(x)，x为一个数据集，就能画出图。
  • plot ()函数是R中基本的画x-y两个变量的函数，其用法如下为：plot (x, y,...)
  • runif（）R语言生成均匀分布随机数的函数是runif（） 句法是：runif (n,min=0,max=1) n表示生成的随机数数量，min表示均匀分布的下限，max表示均匀分布的上限；若省略参数min、max,则默认生成 0,1上的均匀分布随机数。
  • boxplot,箱线图绘制见一个教程

示例

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink")) #iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。

设置字体大小

引用自微信公众号生信星球

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R语言基本操作

• 用Rproject管理工作目录 所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。
• 创建参考 https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA 最后可以用getwd()查看一下，就会发现你的工作目录就是Rproject所在的目录啦

> dir()
[1] "Rproject.Rproj"
> list.files()
[1] "Rproject.Rproj"
> getwd()
[1] "E:/Rproject"

• 加减乘除

> 1+6
[1] 7
> 8+6
[1] 14
> 9+9
[1] 18
> 9*9
[1] 81
> 9/9
[1] 1
> 10^3
[1] 1000
> sqrt(8) #算数平方根
[1] 2.828427
> abs(-3) #绝对值
[1] 3
> abs(3)
[1] 3
> log10(2)
[1] 0.30103
> 

• 赋值

引用自微信公众号生信星球

赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号

x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里

直接输入x 回车，就会把x的值（3）打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个，不用管他。

> x <- 5*5
> x
[1] 25

• 删除变量

a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)  
rm(list = ls())#清空所有变量

代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab键补齐。

看一下这个报错原因

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• 列出历史命令

引用自微信公众号生信星球

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• 清空控制台

快捷键ctrl+l（注意是L键）

复习

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