能用鼠标解决的事,绝对不用代码!
只想用生信分析注释个基因,找找lncRNA,做个火山图图来展示结果,还不想学习写代码,怎么办?
Easy Tools v1.1 可以满足你的要求,下面网址是入口:
www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2/
站长知道大家更喜欢点点鼠标,就得到结果!
为了帮助这绝大多数人,站长开发了这套套网站工具,
今天重点介绍如何用这个网站画漂亮的火山图:
使用教程:
需要注意的事:
一、输入的表格要求:
至少要有三列:分别是
基因名(Gene Symbol),倍数(log2FlodChange),p值(padj)
二、如果geneID是ENSG,内置注释功能,当然筛选lncRNA做火山图也只能在这种情况下使用。
三、更改完参数,刷新要等待10-20秒。这个速度站长也忍不了,以后会优化,敬请关注!
当然这个工具还可以实现
1、基因信息查询
2、基因注释ENSG to gene name,这个来源可是TCGA,Xena,还有自己的测序结果。
3、可以注释EntrezID和提取LncRNA
以上注释结果都可以下载到本地。
这个工具是夸平台的,
手机,平板,电脑都可以,
只要在浏览器输入下面这个网址:
www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2