阿榜的生信笔记10—R语言综合运用2

哈喽，我是学习生物信息学的阿榜！非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。让我们一起加油，一起学习进步鸭🦆

一、apply()隐式循环

apply() 函数是一种隐式循环函数，可以在矩阵、数组、数据框等对象上进行操作。它的基本语法如下：

apply(X, MARGIN, FUN, ...)：对X的每一个维度（1对行、2对列）进行FUN函数操作

X ：需要操作的对象；

MARGIN： X 的哪个维度需要进行循环操作，1是行、2是列；

FUN 是用于操作的函数；

... 表示可以传入其他参数；

下面是一个例子，对矩阵 mat 的每一列进行求和操作：

mat <- matrix(1:9, 3, 3)
mat
apply(mat, 2, sum)

这里的 2 表示对 mat 矩阵的列进行操作， sum 表示对mat的每一列进行求和操作。

二、两个数据的连接

inner_join(x, y) : 返回x和y交集，即两个数据集中有相同值的行。

left_join(x, y) : 返回以x为基础的所有行，并将y中的匹配行合并到x中。如果y中没有匹配的行，则将其相应列填充为 NA 。

right_join(x, y) : 返回以y为基础的所有行，并将x中的匹配行合并到y中。如果x中没有匹配的行，则将其相应列填充为 NA 。

full_join(x, y) : 返回x和y的并集，并将两个数据集中的匹配行合并到一起。如果有匹配的行，则返回匹配行的交集。如果没有匹配的行，则将其相应列填充为 NA 。

semi_join(x, y) : 返回x中有匹配行的子集。

anti_join(x, y) : 返回x中没有匹配行的子集。

操作运行结果如下图所示：

三、以下是常见的问题以及解决办法：

1. "Error: object 'x' not found"错误 这种错误通常是因为没有正确加载或定义变量 x导致的。解决方法是检查变量名是否拼写正确，或者是否已经正确定义。 如果需要加载变量，则需要将数据导入到R中，可以使用 read.table() 、 read.csv() 等函数加载数据。
2. "Error in FUN(X[i], ...) : could not find function "x""错误 这种错误通常是因为没有正确加载需要的包或者函数 x无法识别导致的。解决方法是在代码中添加 library(x) 加载需要的包，或者使用 require(x) 加载包。
3. "Error in split.default(x, f) : first argument must be a data frame or a vector"错误 这种错误通常是因为使用的数据类型不正确导致的。解决方法是检查数据类型是否正确。
4. "Error in model.frame.default(formula = y ~ x, data = df) : invalid type (NULL) for variable 'y'"错误 这种错误通常是因为使用的数据集中缺少需要的列或者有空值 NA 导致的。解决方法是检查数据集中是否缺少需要的列或者是否存在 NA 值。
5. "Error: package or namespace load failed"错误 这种错误通常是因为加载的包损坏或者版本不匹配导致的。解决方法是重新安装或更新需要的包，并使用 library() 重新加载包。 以上是我这次在学习生物信息学过程中所整理的笔记。如果大家对这个领域也感兴趣，欢迎加我好友，我的qq号是1841113542。希望大家能够一起学习，共同进步。如果在笔记中有错误或者不足之处，欢迎大家指正，我们一起加油鸭🦆引用自生信技能树——小洁老师