前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >生信星球Day3 数据结构

生信星球Day3 数据结构

原创
作者头像
用户10664025
修改2023-07-20 13:21:13
1560
修改2023-07-20 13:21:13
举报
文章被收录于专栏:生信入门

今日学习内容:

  1. 什么是向量?如何赋值和实际运用?
  2. 什么是数据框?如何使用?
  3. 中途有事离开,怎么保存数据并且下一次重新加载?
  4. 问题:如果save(X,file="test.RData")报错的话,怎么办?

向量

向量(vector),是由多个元素组成的集合,且所有元素必须是同一类型。

用c()来创建,如c(1,2,3)。

赋值和修改

赋值<-是给变量下定义,指明这是个啥东西;

修改就是再一次赋值,多次赋值以最后一次为准。

从向量中提取元素

  1. 根据位置
代码语言:txt
复制
x<- c(1,2,4,5,6,7,9)
x[2:4]  #取第2到4个元素
x[-(2:4)]  #取反,除了第2-4个元素之外
x[c(2,4)]  #取第2和第4个元素
  1. 根据逻辑判断 除了==,<,>之外,还可以用%in%。
代码语言:txt
复制
a[a%in%b]  #左边向量的元素是否在右边向量中,返回布尔值
a[a %in% b]  #根据TRUE取
a[!(a %in% b)]  #根据FALSE取

关于%in%的更多用法:https://blog.csdn.net/dege857/article/details/123344362

数据框

数据框(Data frame),是二维表格。

赋值:从文件中读取

read.table() #从文件中读取数据,sep表示文件中的分隔符,header表示第一行是否为标题行

read.csv() #读取文件,默认sep为",",header为T

代码语言:txt
复制
X<-read.csv('doudou.txt')  
colnames(X)  #查看列名
rownames(X)  #查看行名,默认值的行名就是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet"  #有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep="	",header=T,row.names=1)  #重新赋值X,最后row.names的意思是修改第一列为行名

从数据框中提取元素

代码语言:txt
复制
X[x,y]  #第x行第y列
X[x,]  #第x行,注意逗号前为行,逗号后或无逗号为列
X[,y]  #第y列,等同于X[y] 
X[a:b]  #第a列到第b列
X[c(a,b)]  #第a列和第b列
X$列名  #也可以提取列,但只能提取一列

导出数据框

代码语言:txt
复制
write.table(X,file="yu.txt",sep=",",quote=F)  #quote表示字符串不加双引号(默认是加的)

变量的保存与重新加载

文件格式:RData

代码语言:txt
复制
save.image(file="文件名.RData")  #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")  #保存其中一个变量
load("test.RData")  #再次使用RData时的加载命令

其他

函数

?函数名 #获取帮助文档

seq() #从起点到终点取值,可设置步长by,或设置length.out返回值的长度

rep(x,…) #x的重复次数

解决问题

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?

答:要保存的对象X没有赋值,显示为不存在。所以检查赋值X<-的命令是否运行了。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 向量
    • 赋值和修改
      • 从向量中提取元素
      • 数据框
        • 赋值:从文件中读取
          • 从数据框中提取元素
            • 导出数据框
            • 变量的保存与重新加载
            • 其他
              • 函数
                • 解决问题
                领券
                问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档