转录组——背景介绍

#详细命令

```bash
# 进入到个人目录
cd ~

## 1.建立数据库目录：在数据库下建立参考基因组数据库，注意命名习惯：参考基因组版本信息
mkdir -p database/GRCh38.105  ##递归创建目录

## 2.建立项目分析目录
mkdir project
cd project
mkdir Human-16-Asthma-Trans # 注意项目命名习惯：物种-样本数-疾病-分析流程  使用英文、数字进行创建
cd Human-16-Asthma-Trans

# 建立数据存放目录
mkdir -p  data/rawdata  data/cleandata/trim_galore  data/cleandata/fastp
# 建立比对目录
mkdir -p Mapping/Hisat2  Mapping/Subjunc
# 建立定量目录
mkdir -p Expression/featureCounts  Expression/Salmon
# 查看整个分析目录准备结构
tree
├── data
│   ├── cleandata
│   	├── trim_galore
│   	└── fastp		
│   └── rawdata
├── Expression
│   ├── featureCounts
│   └── Salmon
└── Mapping
    ├── Hisat2
    └── Subjunc
``
# 建立数据存放目录
mkdir -p  data/rawdata  data/cleandata/trim_galore  data/cleandata/fastp
# 建立比对目录
mkdir -p Mapping/Hisat2  Mapping/Subjunc
# 建立定量目录
mkdir -p Expression/featureCounts  Expression/Salmon
# 查看整个分析目录准备结构
tree
├── data
│   ├── cleandata
│   	├── trim_galore
│   	└── fastp		
│   └── rawdata
├── Expression
│   ├── featureCounts
│   └── Salmon
└── Mapping
    ├── Hisat2
    └── Subjunc