1.软件管理Miniconda,相当于App store,最方便快捷的软件下载器
知识星球 conda是大Boss,最初为管理python包而建立,它是一个大的涵盖许多领域的软件包管理器。 anaconda是总管,职务比conda低,但干的活不少,也是个有内涵的家伙 miniconda是区域经理,说白了就是干事的,而且比较专一,主要负责生信领域
1.创建biosoft(mkdir biosoft),然后进入biosoft(cd biosoft)
2.从某链接下载软件:wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
生信星球:sh是脚本(就是一个程序,后台的代码)文件的后缀,也就是说其实这是一个下载的脚本。 chatgpt:wget 是一个命令行工具,它用于从网络上下载文件。全称是 "Web Get"。它支持通过HTTP、HTTPS和FTP协议下载文件。wget 非常强大,可以通过各种方式来下载文件,包括在后台下载、断点续传、批量下载等。
然后出现这个界面:
3.下载完成后,运行 :bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
,然后开始安装过程
4.激活:source ~/.bashrc
(注意空格)
生信星球:激活不成功就将miniconda这个目录删除,rm miniconda
5.添加镜像:从镜像网站下载,可以加快下载速度。
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
生信星球
1.查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
2.安装软件 conda install fastqc -y
或conda install fastqc=0.11.7 -y
3.确认fastqc软件是否安装成功 fastqc --help
注意:在安装软件的时候一定等彻底安装好再下一步,要不然会出现乱码!!!
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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