Day2-召唤Linux- CG

1. 什么是Linux？什么是服务器？

Linux是什么？

Linux是一个操作系统，类似于MacOS和Windows。优点是开源、免费、安全、稳定。Linux系统在生信领域中非常重要。

Linux应用场景

我们可以将服务器叫做超级电脑，顾名思义服务器的电脑的配置，包括内核、内存、硬盘等配置远高于个人电脑。Linux系统允许多人同时在线使用，互不干扰。因此，Linux系统在服务器领域应用广泛，几乎占据全部服务器市场。

Linux权限控制

Linux允许多用户使用时，个人操作可以不干扰他人的使用。Linux在这个过程中实现互不干扰需要由权限控制来实现。

命令行

Windows和MacOS都是图形操作系统，通过窗口界面实现各种操作，而Linux系统是由命令行界面实现操作。

目录结构

不同于Windows的文件目录分为CDE盘，Linux的文件系统呈树状分枝结构。Linux可多用户使用，因此普通用户无法访问像Windows一样“我的电脑”这样级别的文件夹，每个用户可达到的最高级目录是宿主目录，就是用户登陆时所在的目录。宿主目录在Home目录下。

2.为什么学生信要用linux？

大多数生物信息学软件都是基于Linux开发的，不需要图形界面，因此有效节省资源。另外，命令行模式极大的方便批量、高效的处理文件，可以很好的满足数据处理的需求。

3.怎样召唤linux？--阿里云服务器

云服务器、共享服务器或实验室自由服务器。

4.怎样登录服务器--xshell和terminal？

Windows使用XShell；MacOS使用Terminal或iterms登陆。

练习 1

MacOS 上terminal登陆服务器。ssh user@ip方式登陆服务器-输入密码，成功后显示如下。

5. linux有哪些最基本的操作？

pwd

Print working directory，也就是显示当前路径。图片显示目前处于主目录下的tmp文件夹。

练习 2

mkdir

make directory -- 在当前目录下创建新目录。

bio09@ecm-cefa:~$ mkdir biosoft
bio09@ecm-cefa:~$ mkdir project
bio09@ecm-cefa:~$ mkdir tmp
bio09@ecm-cefa:~$ mkdir src

ls

ls 显示当前目录内容（目录和文件）。

练习 3

rm

删除对象，可以是文件、空目录和有内容的目录。

删除文件

rm xxx

删除目录

rmdir xxx

删除有内容目录

rm -r xxx

清空服务器所有内容（需要root权限）

rm -rf /#-r递归，多级目录一并删除，-f强制删除，无任何提示

cd

cd xxx 进入名为xxx目录。

cd -返回刚才的目录，类似于返回键。

cd进入你的主目录。

练习 4

vi

vi 新建脚本或文档，并编辑。

cat xxx 查看名为xxx文档并直接将文档内容展现在屏幕。若退出cat,点击q。

head xxx 查看文档内容前十行。

tail xxx 查看文档后10行。

tail -n 3 xxx查看文档后三行。

bio09@ecm-cefa:~/tmp$ vi hi_bin.txt
#点击i编辑；编辑完成后点击Esc退出，输入:x退出文档。

练习 5

cp

cp 复制文件。用法为cp file1 file2。

练习 6

mv

mv 将文件转移到新文件夹或重命名文件。

mv file 路径#转移文件到新路径 和 mv file1 file2#将file1重命名为file2

练习 7

登出Linux

exit 登出Linux账号。

练习 8

内容参考微信公众号 生信星球，自己总结。