miniconda
原创miniconda
原创
用户11076492
发布于 2024-04-15 19:24:06
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一、下载
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/复制最新版本链接（64位）
登录linux服务器
cd ~/biosoftwget 链接二、安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 安装成功可见：
Thank you for installing Miniconda3!
三、激活
source ~/.bashrc验证激活：
conda输出信息则证明激活成果
若激活失败，删除目录，从 二、安装 步骤开始重新进行
四、添加镜像网站
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes五、使用
1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda list2、安装fastqc软件
conda install fastqc -y安装指定版本
conda install fastqc=0.11.7 -y验证fastqc软件是否安装成功
fastqc --help输出内容，则安装成功
3、conda environment
查看：
conda info --envs建立新环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y激活新环境
conda activate rna-seq验证新环境
fastqc输出信息，则证明已激活
注意：
1、左键复制，右键粘贴（windows）
2、Tab可用于补齐
3、q ——quit 跳过
4、在代码后加 -y 可用于回答运行中所有的yes or no，提高效率
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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