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Nature子刊 | 使用非侵入式超高密度记录方法绘制大脑中央沟图谱

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脑机接口社区
发布于 2024-04-26 09:53:57
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文章被收录于专栏:脑机接口脑机接口
绘制人类皮层图对于理解大脑功能和识别与行为和疾病相关的区域至关重要。目前有多种技术可用于进行皮质映射,包括皮质电图(ECoG)、脑电图(EEG)、功能性磁共振成像(fMRI)、电磁成像(MEG)、近红外光谱(NIRS)和立体脑电图 (SEEG)。ECoG、SEEG和EEG提供高时间分辨率,这是临床神经生理学中测量大脑活动的诊断工具的显着优势。然而,使用ECoG或SEEG方法的侵入性皮质记录仅适用于手术植入后,并且它们的使用不可避免地与患者的风险和一般成本的增加有关。相比之下,脑电图技术成本低廉,易于在简单的实验室设置中实施。因此,研究人员和临床医生对克服脑电图的限制因素感兴趣,例如低空间分辨率和对通常源于运动和肌电图(EMG)活动的伪影的敏感性。

01

研究方法

本文评估了使用带有镀金电极点的柔性印刷电路板(PCB)的超高密度脑电图(uHD EEG)系统。电极间距离为8.6mm,电极直径为5.9mm,电极密度高于市场上市售的脑电图系统。图1a描绘了标准化的电极定位系统。10-20系统中的21个标准位置是深灰色的。图1a还包括另外两个系统:10-10系统(标记为填充的浅灰色圆圈)和扩展的10-10系统(标记为浅灰色圆圈)。本文中的uHD脑电图系统由图1a中的小黑圈和图1b,c中的填充小黑圆圈表示。使用MATLAB(R2019b)的EEGLAB工具箱对收集到的数据进行预处理。我们采用平均去除法进行基线去除,并对0.5~40Hz的数据进行时域变换。用标记“1”分为“试验×通道×时间样本”格式。

图 1 超高密度脑电图系统(uHD EEG)的电极分布图

根据MRI数据进行电极共配准

地形图是使用所有五名受试者的解剖MRI扫描生成的大脑模型创建的。使用T1加权MRI数据在FreeSurfer重建大脑和头骨。对于所有受试者,使用配备MRI标记的标准10-20帽进行MRI扫描,并将产生的MRI伪影用于配准和电极网格放置。

信号处理流程

信号处理在MATLAB(The MathWorks,Inc.,Natick,MA,USA)中实现,如图2所示,包括(a)预处理和(b)提取SSEP迹线,(c)归一化SSEP以进行(d)峰值检测和(e)通道分类。一般而言,所有滤波器都向前和向后应用于数据,以防止使用MATLAB filtfilt函数进行相移。

首先,去除了预放大脑电图的增益因子。其次,使用50Hz级联陷波滤波器(二阶巴特沃斯)滤波数据,以去除电源线噪声。第三,数据是通用平均参考,并使用0.5至30Hz(二阶巴特沃斯)的带通滤波器进行滤波,以检测不良信道。第四,通过减去各自的均值,通过每个时间样本的平方计算功率,并计算随时间变化的平均功率来计算每个通道的平均功率。第五,对平均信道功率进行对数变换以提高高斯性和z变换。第六,z分数大于6的通道被认为是坏的。使用此程序发现的不良通道从陷波滤波的脑电图数据中删除,然后以普通平均值为参考。

引用SSEP记录是必不可少的,并在文献中进行了广泛讨论。乳突、耳垂、FZ或FPZ通常推荐作为参考传感器位置。然而,平均参考方法也是有效的。Tsuchimoto等人表明,在提取感觉运动活动时,共同平均参考(CAR)的使用优于其他7种参考方法。从电极阵列到参比电极的阻抗不匹配可能很大。因此,两个电极中噪声的表示不同,因此不能用传统的参考减法完全消除。本研究使用了 CAR,因为uHD EEG系统没有在感兴趣区域的网格旁边提供额外的电极放置。

图 2 EEG信号处理流程图

如文献所发现,测试了不同的过滤方法来预处理数据。根据国际术间神经生理学会(International Society of Interoperative Neurophysiology)为头皮(皮质和皮质下)SSEP记录得出的SSEP迹线和建议,选择了20-300Hz带通。经过上述处理后,数据被划入试验,触发前时间为100ms,触发后窗口为300ms,因为这些bin包含SSEP分析所需的所有信息。对前臂施加300个刺激脉冲,导致300次试验用于平均。计算并绘制了每个通道的平均值,如图5b中的SSEP迹线所示。图3中的图显示了从MNS到对象S1右手的SSEP迹线。

值得注意的是,通过目视检查,与靠近运动和感觉皮层的电极相比,位于中央沟上方的电极的相位反转不那么明显。然而,无论迹线的清晰度如何,所有SSEP迹线都用于分类。还进行了独立成分分析(ICA)以检测上述管道的增产伪影。由于300Hz的低通滤波、使用CAR重新参照以及交替的单极性MNS,因此从用于进一步处理的数据中消除了伪影。因此,无需从数据中去除任何成分即可进行进一步分析。

分类性能

我们根据真实情况计算了正确分类的前通道和后通道的数量。我们计算了真实类和预测类的混淆矩阵。然后使用真阳性(TP)、真阴性(TN)、假阳性(FP)和假阴性(FN)来确定方程(4)中定义的准确性:

02

研究结论

表 1 利用光谱聚类和峰值检测方法进行分类结果

额叶上的SSEP可以与顶叶上的SSEP分开。表1列出了应用光谱聚类和峰检测方法获得的分类结果。该表显示了从中央沟前部或后部分类的通道获得的精度。平均而言,使用光谱聚类方法对前路和后路进行分类的准确率为95.2%。受试者S5和S4的准确率分别为90.6% 至97.2%。峰值检测方法的平均准确率为91.9%,其中S3和S1的平均准确率分别为86.6%和96.6%。

表 2 所有受试者前后电极分类电极的SEEP潜伏期

表2记录了峰值检测方法分类为Ant和Pst的通道的SSEP延迟,该表以ms为单位显示了每位受试者的平均值和标准差,其中包含第一个正(1st P)和第二个负(2nd N)峰的通道,以及第一个负(1st N)和第二个正(2nd P)峰的后验分类通道。

使用峰值检测和频谱聚类进行信道进行信道分类的最终结果如图3所示。图3(a)描述了受试者S1–S5的头部模型和地面实况的通道分布。解剖学上正确的运动和感觉区域(M1和S1)在MRI皮层上用红色和蓝色表示,中央沟以粗体黑色突出显示以将它们分开。模型上总共256个信道由小球体表示,红色和蓝色球体分别表示前后信道位置,灰色球体表示信号质量较差的信道。图3(b)显示了峰值检测方法的结果,该结果在头皮上插值,并按从蓝色(最大感觉峰值)到红色(最小运动峰值)的等级着色,排除了不良通道,值范围从−1到1。第三行(图(c))显示了光谱聚类分类的结果,每个通道在感觉(蓝色)或运动(红色)之间做出决定。分类问题是二元的,因此,对于每个相应通道的预测,仅导致1和−1决策。

图 3 表示SSEP分类的脑地形图和热点图

参考文献

Schreiner, L., Jordan, M., Sieghartsleitner, S.et al. Mapping of the central sulcus using non-invasive ultra-high-density brain recordings. Sci Rep 14, 6527 (2024). https://doi.org/10.1038/s41598-024-57167-y

—— End ——

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国外研究团队对EEG+fNIRS的脑机接口在执行运动想象任务时的性能表现的相关研究
深度学习+EEG:一种采用单通道EEG检测被试注意力状态的卷积神经网络构架
脑机接口(BCI)系统可以记录并处理大脑信号并将其转换为输出命令,其可用于各种应用场景,如辅助技术,神经康复和认知增强等。在各种用于脑信号记录的技术中,脑电图(EEG)是BCI研究中研究最多的方法。而基于EEG的认知BCI,旨在评估和增强诸如注意力等认知功能。 之前的研究更多的关注于选取合适的特征,以将其用来对注意力程度进行分类。用于监视专注精神状态的现有技术方法主要与EEG频带中的特定频段有关。大量的研究调查了注意力引起的beta,alpha 和不同频段之间能量比值的变化。总体而言,很多研究认为像beta这样的高频段活动增加是一种注意唤醒的指标,另外一些研究表明θ和β的能量比值、α和θ能量的降低也表明较高的专注程度。 深度学习近年来在语音识别及图像识别领域取得了非常突出的表现,因其可以自动提取相关特征用于分类任务,近年来将深度学习技术应用于EEG数据的研究也逐渐增多。但是深度学习技术应用于认知BCI的研究目前还较少。近期,来自新加坡的研究团队在Journal of Neural Engineering杂志发表题目为《Inter-subject transfer learning with end-to-end deep convolutional neural network for EEG-based BCI》研究论文,其提出了一种深度学习框架,利用单通道EEG信号来检测被试的注意力状态,可以显著提高被试间注意力检测任务的准确性。 材料与方法 1.数据
悦影科技
2021/01/24
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深度学习+EEG:一种采用单通道EEG检测被试注意力状态的卷积神经网络构架
PNAS:大脑区域间耦合的增加和减少会相应增加和减少人类大脑中的振荡活动
大脑中振荡活动的起源目前仍有争议,但许多假说都认为它们反映了大脑区域之间的相互作用。本文中,我们通过控制两个人类大脑区域之间的耦合强度来检验这种可能性,这两个区域是腹侧前运动皮层(ventral premotor cortex, PMv)和初级运动皮质(primary motor cortex, M1),并且检测其对运动系统中可测得(基于脑电图)的振荡活动的影响。我们增加或降低耦合强度,同时保持对通路中每个组分区域的影响不变。这是通过使用两种不同模式的经颅磁刺激PMv和M1成对脉冲刺激来实现的,其中只有一种方式增加了PMv对M1的影响。虽然刺激方案的时间模式不同,但它们由相同数量的M1和PMv脉冲组成。在一项运动任务中,我们测量了参与者做一个事先准备好的动作(Go)或不做(No-Go)时,对α、β和θ波段活动的影响。通过激发PMv - M1通路的同步突触前和突触后活动,增强了PMv和M1之间的皮层连接,分别增强了Go和No-Go试验中的β和θ振荡节律。α节律几乎没有变化。相比之下,在Go和No-Go试验中,PMv对M1影响的减弱分别降低了β和θ振荡节律。这表明PMv-M1通路中的皮质-皮质交流频率可以按照Hebbian棘波时间依赖可塑性被调节。本文发表在PNAS杂志。
用户1279583
2022/02/28
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PNAS:大脑区域间耦合的增加和减少会相应增加和减少人类大脑中的振荡活动
比较脑磁图与高密度脑电图的内在功能连通性
脑磁图(MEG)与基于限带功率包络相关的静息状态功能连接(rsFC)联合使用,可以研究人类大脑内在网络所组成的静息状态网络(RSNs)。然而,目前MEG系统的可用性有限,阻碍了电生理rsFC的临床应用。在这里,我们直接比较了已知的RSNs以及全脑rsFC连接体及其状态动力学,这些数据来源于同时记录的MEG和高密度头皮脑电图(EEG)静息状态数据。通过比较头部边界模型和头部有限元模型的结果,研究了头部模型精度对脑电rsFC估计的影响。结果显示,除额顶叶网络外,MEG和EEG获得的RSN图大部分相似。在连接体水平,与脑电图相比,MEG对额部rsFC的敏感性较低,而对顶枕部rsFC的敏感性较高。这主要是由于脑磁图传感器相对于头皮位置的不均匀性,当考虑相对脑磁图传感器位置时,显著的脑磁图差异消失了。在区分灰质和白质的脑电图中,默认网络是唯一需要高级头部建模的RSN。重要的是,rsFC状态动力学的比较证明了MEG和头皮脑电图之间的较差的对应关系,表明了对瞬态神经功能整合的不同成分的敏感性。因此,这项研究表明,基于人脑连接体的静态rsFC研究可以以类似于MEG的方式在头皮脑电图中进行,为rsFC分析的广泛临床应用开辟了道路。本文发表在NeuroImage杂志。。
用户1279583
2022/02/28
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比较脑磁图与高密度脑电图的内在功能连通性
NeuroImage:警觉性水平对脑电微状态序列调制的证据
大脑的瞬时整体功能状态反映在其电场构型中,聚类分析方法显示了四种构型,称为脑电微状态类A到D。微状态参数的变化与许多神经精神障碍、任务表现和精神状态相关,这确立了它们与认知的相关性。然而,使用闭眼休息状态数据来评估微状态参数的时间动态的常见做法可能会导致与警觉性相关的系统性混淆。研究人员研究了两个独立数据集中的微状态参数的动态变化,结果表明,微状态参数与通过脑电功率分析和fMRI全局信号评估的警觉性水平有很强的相关性。微状态C的持续时间和贡献,以及向微状态C过渡的概率与警觉性正相关,而微状态A和微状态B则相反。此外,在寻找微状态与警觉性水平之间对应关系的来源时,研究发现警觉性水平对微状态序列参数的格兰杰因果效应。总而言之,本研究的发现表明,微状态的持续时间和发生具有不同的起源,可能反映了不同的生理过程。最后,本研究结果表明,在静息态EEG研究中需要考虑警觉性水平。
悦影科技
2021/02/18
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NeuroImage:警觉性水平对脑电微状态序列调制的证据
HAPPE+ER软件:标准化事件相关电位ERP的预处理的pipeline
事件相关电位(ERP)设计是一种用脑电图(EEG)评估神经认知功能的常用方法。然而,传统的ERP数据预处理方法是手动、主观、耗时的过程,许多自动化处理方法也很少有针对ERP分析有优化(特别是在发展或临床人群中)。本文提出并验证了HAPPE+事件相关(HAPPE+ER)软件,标准化和自动化预处理过程,且优化了整个生命周期的ERP分析。HAPPE+ER通过预处理和事件相关电位数据的统计分析来处理原始数据。HAPPE+ER还包括数据质量和处理质量指标的事后报告,标准化对数据处理的评估和报告。最后,HAPPE+ER包括后处理脚本,以方便验证HAPPE+ER的性能或与其他预处理方法的性能进行比较。本文用模拟和真实的ERP数据介绍了多种方法,HAPPE+ER软件可在https://www.gnu.org/licenses/#GPL的GNU通用公共许可证条款下免费获得。
悦影科技
2022/10/10
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一种用于干式脑电图的高密度256通道电极帽
高密度脑电图(HD-EEG)目前仅限于实验室环境,因为最先进的电极帽需要熟练的工作人员和大量的准备工作。我们提出并评估了一种带干式多针电极的256通道脑电图帽。本文介绍了以聚氨酯为原料,涂覆Ag/AgCl的干电极的设计。在一项有30名志愿者参与的研究中,我们将新型干式hd-脑电图帽与传统的凝胶型脑电图帽进行电极皮肤阻抗、静息状态脑电图和视觉诱发电位(VEP)的比较。我们用8个电极在真实的人体和人造皮肤上模拟帽子应用进行佩戴测试。256个干电极中的252个平均阻抗低于900 kΩ,就可以用最先进的脑电图放大器进行记录。对于干式脑电图帽,我们获得了84%的通道可靠性和减少69%的准备时间。在排除平均16%(干性)和3%(凝胶性)坏通道后,静息状态EEG、alpha活动和模式逆转VEP可以在所有比较的信号特征指标中记录到小于5%的显著差异。志愿者报告说,在EEG记录之前和之后,干帽的佩戴舒适度分别为3.6±1.5和4.0±1.8,凝胶帽的佩戴舒适度分别为2.5±1.0和3.0±1.1(1-10分)。试验表明,干电极的使用可达3200次。256通道的HD-EEG干电极帽克服了HD-EEG在制备复杂性方面的主要限制,允许未经医学培训的人员快速应用,从而实现了HD-EEG的新用例。
悦影科技
2022/07/04
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