ggPlantmap | 动植物图片轻松转成ggplot2对象，数值映射真的很简单...

前言

我们的数据可视化课程已经上线啦！！目前课程的主要方向是 科研、统计、地理相关的学术性图形绘制方法，后续也会增加商务插图、机器学等、数据分析等方面的课程。课程免费新增，这点绝对良心！

我们第一个数据可视化交流圈子也已经上线了，主要以我的第一本书籍《科研论文配图绘制指南-基于Python》为基础进行拓展，提供「课堂式」教学视频，还有更多拓展内容，可视化技巧远超书籍本身，书籍修正和新增都会分享到圈子里面~~

参与课程或者圈子的你将获取到：学员答疑、可视化资源分享、可视化技巧补充、可视化业务代做(学员和甲方对接)、副业交流、提升认知等等。

「ggmsa」-专为多序列比对设计的可视化神器

在准备我们的R语言数据可视化课程的拓展内容时，发现了很多有意思的可视化工具包~~

今天给大家介绍的可视化工具是-「ggPlantmap」，一个可以一键将图片对象转换成ggplot2绘图对象的好用工具，让数值映射变得超简单~~

• 「ggPlantmap」工具介绍

ggPlantmap 是一个开源R软件包，目的是方便从植物图像生成信息丰富的ggplot绘图对象，以探索特定细胞类型的定量数据。ggPlantmap也可以结合外部定量数据，实现植物不同部位/细胞空间剖面的可视化显示。

可使用如下语法进行该工具的安装：

##install devtools (if you haven't already)
install.packages("devtools")
library(devtools)

## Installing from a github respository
install_github("leonardojo/ggPlantmap")

我们先看一下ggPlantmap工具的工作流程，可视化展示如下：

将外部定量数据叠加到 ggPlantmap 绘图对象中：

可视化绘制过程如下：

library(ggPlantmap)
ggPlantmap.plot(ggPm.At.earlyembryogenesis.devseries,Cell)

颜色数值映射可视化案例如下：

实际数据可视化案例(这些官网都提供了详细的教程代码，这里就直接给大姐列出绘图结果哈)：

案例01

案例01

案例03

案例04

好了，更多关于ggPlantmap包的使用语法和可视化操纵案例，大家可参考ggPlantmap官网[1]

可视化学习圈子是干什么的？

可视化学习圈子是书籍「科研论文配图绘制指南-基于Python」一书的学下圈子：主要通过以下几个方面，给大家带来比纸质书籍更丰富的学习内容：

• 视频教学，和读者零距离互动交流
• 及时修正勘误和定期新增绘制知识点
• 拓展衍生，绘图知识点远超书籍本身
• 直播视频+拓展资料+答疑，学习更高效

「PS」：我们直播教学内容为课堂式教学，原作者带着大家对书籍一章、一节、一页的进行教学。而且直播的视频都会通过剪辑后整理成课程，圈子中的同学可以免费、反复观看。当然，新增内容和定期答疑，直播也是如此。

• 为何会有这个书籍学习社群？无门槛的微信群难免会鱼龙混杂，问题和质量都无法得到保证，而且一些关键问题经常被淹没，且没有沉淀价值。
• 随着添加我微信的人日益增多，向我提问的人也越来越多，随便回答一下就太不负责任了；不回答也不是很好；如果都仔细回答，我也有自己的工作并且确实很忙，真的有点心有余而力不足！所以我才会建立这么一个渠道来沉淀我的可视化技巧和分享经验，以及给大家提供一个坚持学习的平台。

参考资料

[1]

ggPlantmap官网: https://github.com/leonardojo/ggPlantmap?tab=readme-ov-file。