一个检测系谱数据是否正常的程序

大家好，我是邓飞。

最近有小伙伴问起如何检查系谱数据是否正常，这里，分享一个我之前写的一个R包，里面有函数check_pedigree，可以说是非常方便了。

命令行安装：

library(devtools)
install_github("dengfei2013/learnasreml")

本地安装包：（公众号回复：learnasreml）

功能介绍：

• 1，统计系谱个体数
• 2，统计父本个数
• 3，统计木本个数
• 4，统计个体重复数
• 5，统计父母本交叉个数

模拟一个数据：

运行程序检测代码：

library(learnasreml)
check_pedigree(ped)

结果：

可以看到，系谱是有问题的，父母本交叉个数1个，编号为2。

立一个Falg吧，这个包好久没有维护了，而自己又写了很多实用的函数，都可以打包进去，后面更新吧。

PS：话说函数输出中文的汇总结果是不是很666……