数据结构

tips：

（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替

（2）在Console 控制台（左下）输入命令，相当于Linux的命令行，右上是脚本窗口

（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的

（4）显示工作路径 getwd()，设置工作路径setwd()

（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。

（6）表格在R语言中称为数据框

（7）函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究。

（8）数据类型（重点是向量和数据框）

向量

元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等，根据它可以区分两个词：

标量：一个元素组成的变量，标量可以是一个数字，或者一个字符串，字符串在引用的时候必须要加引号

向量：多个元素组成的变量，c()，依次排列的数字或字符串

在实际使用时，一般会给变量赋值:x=或者x<-

x<- c(1,2,3) 常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量

x<- 1:10 从1-10之间所有的整数

x<- seq(1,10,by = 0.5) 1-10之间每隔0.5取一个数 注意是逗号不是分号

x<- rep(1:3,times=2) 1-3 的所有数字重复2次

每次重新对x进行赋值时都会覆盖上一次的赋值，以最后一次为准

实操

从向量中提取元素

根据元素所在的位置

x4 向量x中第4个元素

x-4 排除法，向量x中除了第4个元素之外剩余的元素

x2:4 向量x中第2到4个元素

x-(2:4) 向量x中除了第2-4个元素

xc(1,5) 向量x中第1个和第5个元素

根据值

xx==10 向量x中等于10的元素

xx<0 向量x中小于0的元素

xx %in% c(1,2,5) 向量x中存在于向量c（1，2，5）中的元素

实操演示

数据框

一定要将示例数据放在工作目录下

建立新的.txt文档，存放，用X<-read.csv('文件名.txt')读取单引号双引号都可以

以示例文件"doudou.txt"和"huahua.txt"为例

读取本地数据

read.table(file='huahua.txt',sep="\t",header=T)

From bing and R-help

Sep()

R语言自带的sep()函数是用于设置输出多个值之间的分隔符的函数。它可以在将结果打印或写入文件时，控制多个值之间的间隔样式。

通常情况下，在R语言中打印多个值时，默认的分隔符是空格。但使用sep()函数，我们可以将分隔符修改为任何我们想要的字符或字符串。

当我们在R语言中使用sep()函数时，它可以接受一个参数来设置输出多个值之间的分隔符。这个参数可以是一个字符向量或字符串。

header()

R语言中并没有名为header的函数。R语言中的header参数通常用于读取数据时指定是否将首行作为列名。在R语言中常用的函数是read.table()或read.csv()等用于读取数据的函数，这些函数通常都有header参数用于控制是否读取首行作为列名。

例如，当我们使用read.table()函数读取一个文本文件时，可以通过设置header参数来控制是否读取首行作为列名。如果header参数为TRUE(默认值),则将首行视为列名；如果header参数为FALSE,则将首行视为数据的一部分。

查看行名和列名、行数和列数

colnames(a) 查看列名

rownames(a) 查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...

dim(a) 几行几列

数据框的导出

write.table(a,file="cheng.txt",sep="t",quote=F) quote=F：分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

write.table(a,file="cheng1.txt",sep="t")【如果不设置quote】

变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用，采用保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData") 保存当前所有变量

save(a,file="test.RData") 保存其中一个变量

load("test.RData") 再次使用RData时的加载命令

提取元素

从已经在R中运行的数据框提取出向量

• ax,y 第x行第y列
• ax, 第x行
• a,y 第y列
• ay 也是第y列
• aa:b 第a列到第b列
• ac(a,b) 第a列和第b列
• a$列名 也可以提取列（优秀写法，支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

直接使用数据框中的变量

iris是R语言的内置数据，可以直接使用。提取某两列作散点图：

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

将这行代码复制到一个新的R脚本中，然后保存到工作目录下，后缀是R

实操

作业：save(a,file="test.RData")，报错object a not found

没有为“a”赋值，或者选定的为“a”赋值的内容不正确，导致a在R语言中没有对应的内容