Day6_鸭鸭

学习R包

一、安装和加载R包

1.镜像设置

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")

2. 安装

看来自于哪个网站？

• CRAN网站：install.packages("stringr")
• Bioconductor：BiocManager::install("limma")

3. 加载

library或require函数

二、dplyr包的五个基础函数

1. mutate()

功能：新增列

上传失败：Cannot read properties of undefined (reading 'url')

2. 按列筛选

（1）按行号筛选

（2）按列名筛选

筛一列

筛两列以上

3. filter()

功能：筛选行

4.arrange()

功能：按某1列或某几列对整个表格进行排序

5. summarise()

功能：对数据进行汇总操作，结合group_by使用实用性强

三、dplyr两个实用技能

1. 管道操作%>%(快捷键：cmd/ctr+shift+M)

功能：同上

test %>% 
  group_by(Species) %>% 
  summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

2. count统计某列的unique值

count(test,Species)

四、dplyr处理关系数据

1. 内连inner_join，取交集

2.左连left_join

3.全连full_join

4. 半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join

5. 反连接：返回无法与y表匹配的x表所有记录anti_join

6. 简单合并

五、函数和R包该怎么学习

作者写的网页版教程，不是每个R包都有的

browseVignettes("limma")