还在为安装R包困扰吗，看看这个吧

R语言数据分析指南

发布于 2024-06-18 17:57:14

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官方网站

❝https://pak.r-lib.org/ ❞

举个例子：

❝如:安装Bioconductor上的DEseq2，但是对于初学者往往只知install.packages(),这样就会存在错误，现在可直接通过pkg_install()全部搞定。 ❞

BiocManager::install("DEseq2")
pak::pkg_install("DEseq2")

安装R包

library(tidyverse)

install.packages("pak")
library(pak)

pak::pkg_install("DEseq2")

pak::pkg_install("ggh4x@0.2.4") # 安装指定版本的包
pak::pkg_deps_tree("tibble") # 绘制依赖树

# 从URL安装R包
pak::pkg_install("url::https://cran.rstudio.com/src/contrib/ggh4x_0.2.8.tar.gz")

# 解释包之间依赖关系
pak::pkg_deps_explain("tibble","rlang")

开发版包安装

❝安装github上的包最主要的问题也许就是找到正确的安装命令，需要知道「作者名/包名」，但是往往初学者无法找到正确的官方网址，那么使用packagefinder包则可以正确找到网址。 ❞

install.packages("packagefinder",dependencies = TRUE)

library(packagefinder)

go("ggraph","website") # 打开ggraph网站，速度可能稍慢

pak::pkg_install("teunbrand/ggh4x")  # 安装github包
pak::pkg_deps("teunbrand/ggh4x") # 查看所需的依赖包

❝使用pak包安装会有数据缓存保留，有需要可以清理节省空间。 ❞

# 清理缓存
pak::meta_clean(force = TRUE)
pak::cache_clean()

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