AI for Science 企业动态速览——
* 上交大团队发布开源 3D 医学大模型 SAT,支持 497 类器官,性能超越 72 个 nnU-Nets
* Sam Altman 孵化 AI 医疗新公司,打造 AI 健身教练
* 英矽智能向复星医药交付第二款临床前候选化合物
* 哈佛 DeepMind 在世界模拟器中训练 AI 老鼠,开辟虚拟神经科学
* 哥德堡大学开发 AI 模型 Candycrunch :搜寻癌症线索速度远超以往
* Open AI 宣布与洛斯阿拉莫斯国家实验室合作:首次实际实验室环境中测试多模态 AI
* AI 制药初创公司 PolyModels Hub 获 110 万英镑种子轮融资
上交大团队发布开源 3D 医学大模型 SAT,支持 497 类器官,性能超越 72 个 nnU-Nets
近日,上海交通大学与上海人工智能实验室联合团队发布 3D 医学图像分割大模型 SAT (Segment Anything in radiology scans, driven by Text prompts)。该研究首次探索将人体解剖学知识注入文本编码器,构建了第一个包含 6K+ 人体解剖学概念的多模态医疗知识图谱。
同时,该研究还构建了当前最大规模的 3D 医学图像分割数据集,名为 SAT-DS。它汇集了 72 个公开数据集,来自 CT、MR 和 PET 三种模态的 22K+ 图像, 302K+ 分割标注,涵盖了人体 8 个主要部位中的 497 个分割目标,实现了通过文本提示的放射学影像通用医疗分割模型。
相关研究以「One Model to Rule them All: Towards Universal Segmentation for Medical Images with Text Prompts」为题,发表在学术平台 arXiv.org 上。所有数据和代码、模型均已开源。
论文地址: https://arxiv.org/abs/2312.17183
数据链接: https://hyper.ai/datasets/32867
Sam Altman 孵化 AI 医疗新公司,打造 AI 健身教练
近日,OpenAI 首席执行官 Sam Altman 在《时代》杂志上官宣了 Thrive AI Health 的成立。该公司由 OpenAI Startup Fund 和 AI 医疗企业 Thrive Global 共同孵化,聘请谷歌前高管 DeCarlos Love 担任 CEO,旨在打造定制化 AI 健康教练。
沃尔玛联合创始人 Helen Walton 的 Alice L. Walton 基金会是 Thrive AI Health 的战略投资者;Alice L. Walton 医学院是 Thrive AI Health 最初的健康合作伙伴之一。
据介绍,这款应用将以用户的生物特征和生活习惯为参考,从而提供个性化的健康建议,推动用户在社交、睡眠、健身、压力管理和饮食五大领域养成良好的长期习惯。
英矽智能向复星医药交付第二款临床前候选化合物
近日,由生成式 AI 驱动的临床阶段生物科技公司英矽智能宣布,公司在今年 6 月向研发合作伙伴复星医药交付了第二款临床前候选化合物 (PCC)。
这是一款靶向合成致死策略用于实体瘤治疗的潜在创新疗法,英矽智能期待在 2024 年第四季度向国家药品监督管理局药品审评中心 (CDE) 提交该候选药物的 pre-IND 沟通和申请。
此次提名的 PCC 靶向在 DNA 损伤修复机制中发挥关键作用。通过 AI 靶点识别引擎 PandaOmics,结合 AI 驱动的机器人实验室 Life Star 1,英矽智能的研发团队对该靶点进行了充分的分析和验证。
据悉,英矽智能于 2022 年 1 月与复星医药达成战略合作,在全球范围内开展生成式 AI 驱动的药物发现项目。达成合作仅一个月后,英矽智能高效交付了合作项目的首个临床前候选化合物,该靶向 QPCTL 的候选药物正在中国开展 I 期临床试验,并于近期完成首例患者给药用于晚期恶性肿瘤治疗。
哈佛 DeepMind 在世界模拟器中训练 AI 老鼠,开辟虚拟神经科学
近日,哈佛大学与谷歌 DeepMind 人工智能实验室利用从真实老鼠身上记录的高分辨率数据,训练了一个人工神经网络,并在 Deepminds MuJoCo 模拟器中创建了虚拟老鼠,神经网络充当虚拟老鼠的「大脑」,在物理模拟器中控制老鼠的身体。
这只搭载 AI 大脑的「虚拟大鼠」,不仅能够模仿真实啮齿动物的所有动作,还能够做出其他一些没有被明确训练过的行为。这一技术将有助于理解大脑如何产生复杂动作,以及机器人控制系统的设计改进。
相关研究以「A virtual rodent predicts the structure of neural activity across behaviors」为题,发表在 Nature 期刊上。
论文地址: https://www.nature.com/articles/s41586-024-07633-4
哥德堡大学开发 AI 模型 Candycrunch :搜寻癌症线索速度远超以往
近日,哥德堡大学的研究人员开发了一种 AI 模型,通过糖分析增加了检测癌症的可能性。与目前的半手动方法相比,该 AI 模型能够更快、更好地发现异常,每次测试只需几秒钟就能完成。
团队使用超过 50 万个不同的片段和糖分子相关结构的数据库,对 AI 模型进行了训练。这种训练使 Candycrunch 能在 90% 的案例中,极其快速准确地计算出样本中糖的精确结构。Candycrunch 也能识别由于低浓度而经常被人类分析遗漏的结构。因此,该模型可帮助科学家找到新的基于聚糖的生物标志物。
据悉,聚糖或糖分子的结构普遍存在于人体细胞中,可通过质谱仪测量。这些结构的一个重要的用途就是可指示细胞中不同形式的癌症。然而,从质谱仪测量的数据必须由人来仔细分析,这一过程可能需要数小时至数天,且只能由少数专家进行。
相关研究以「Predicting glycan structure from tandem mass spectrometry via deep learning」为题发表在 Nature Methods 上。
论文链接: https://www.nature.com/articles/s41592-024-02314-6
Open AI 宣布与洛斯阿拉莫斯国家实验室合作:首次实际实验室环境中测试多模态 AI
近日,Open AI 宣布与洛斯阿拉莫斯国家实验室 (LANL) 建立生物科学研究伙伴关系。该合作研究将是首个在实验室环境中测试多模态前沿模型的实验,评估专家和新手在执行和排除安全协议方面的能力,这些协议包括标准的实验室实验任务。
这些任务旨在作为更复杂任务的替代,具有双重用途的担忧。任务可能包括转化(例如,将外源基因物质引入宿主生物);细胞培养(例如,体外维持和繁殖细胞);和细胞分离(例如,通过离心)。
据悉,洛斯阿拉莫斯国家实验室是美国承担核子武器设计工作的两个国家实验室之一,也是世界上最大的科学和技术研究机构之一,在国家安全、太空探索、 可再生能源、医药、纳米技术和超级计算机等多个学科领域开展研究。
AI 制药初创公司 PolyModels Hub 获 110 万英镑种子轮融资
近日,英国生物技术软件平台研发商 PolyModels Hub 宣布获得 Marathon Venture Capital 的种子轮融资。此次融资将用于进一步研发其平台,以加速药物开发过程。
PolyModels Hub 成立于 2023 年,致力于借助AI工具,通过建模、仿真和数据等技术手段加速药物开发。