为了方便大家体验分子 3D 稳定构象生成工具,Conf-GEM 已在 Bohrium Apps 上线:(https://bohrium.dp.tech/apps/conf-gem-web)。目前,Conf-GEM 限时免收取 license 费用。下面,我们简单介绍一下 Conf-GEM 的使用流程:
1.登录 Bohrium 账号,并进入网页中的预测工具(https://bohrium.dp.tech/apps/conf-gem-web)
2.上传需要生成分子稳定 3D 构象的分子文件,包括两种输入形式:
a.输入上传单个分子。可以直接输入单个分子的简化分子线性输入规范(SMILES)字符串。
b.输入批量分子的文件。可以以文本文件的格式列出多个分子的 SMILES 结构,同时为每个分子自定义命名。
3.选择要生成的构象数(最大支持50个构象)
4.点击提交按钮进行在线生成
5.查看生成结果
选中 1 2 号分子进行叠合
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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