alphafold3 使用教程

首先，进入alphafold3 官网 AlphaFold Protein Structure Databas

诺贝尔奖

🚀 引入篇：AlphaFold3简介与优势 AlphaFold3，作为AI预测领域的新星，以其卓越的预测精度和速度，成为了科研和医疗领域的新宠。它不仅在蛋白质结构预测上表现优异，还在核酸和配体互作预测上展现出显著的优势。接下来，让我们一起探索AlphaFold3的使用教程，看看它是如何帮助我们解决科学问题的！🌈

alphafold3 功能：

阿尔法fold3使用教程

🌟 AlphaFold3使用教程：从入门到精通 🌟

🔍 使用教程：详细步骤

1. 准备工具：
   • 确保你有科学上网工具和谷歌账号。
   • 推荐使用谷歌浏览器进行操作。
2. 访问AlphaFold3服务器：
   • 打开谷歌浏览器，登录你的谷歌账号。
   • 访问[AlphaFold3服务器](https://alphafoldserver.com/)。
3. 上传序列数据：
   • 在服务器的序列输入区，点击“Add Entity”添加你的序列数据。
   • 根据你的数据类型（蛋白质、DNA、RNA等），选择相应的序列输入格式。
4. 提交预测请求：
   • 完成数据上传后，点击“Continue and Preview Job”查看预测结果。
   • 确认无误后，提交作业。
5. 结果下载与可视化：
   • 预测完成后，下载.cif格式的文件，使用分子可视化软件如PyMOL查看蛋白质的三维结构。

📝 总结与风险提示 AlphaFold3的强大功能使其在多个科学领域都有广泛的应用前景。然而，使用前请确保你的网络环境符合要求，并准备好处理可能出现的数据上传和结果解读问题。此外，由于模型的复杂性，建议定期更新你的数据和软件，以获得最佳的预测效果。🌟

🚨 风险提示：请注意，AI预测并非百分百准确，特别是在处理复杂的生物分子结构时。建议结合实验数据和传统方法一起使用，以确保研究的准确性和可靠性。🧐

通过以上教程，希望你能快速掌握AlphaFold3的使用，开启你的科学探索之旅！🌍💼

task:

预测适配体24*5的结构 进入AlphaFold Server

Google登入

使用AlphaFoldServer对适配体进行预测，并且它给出了protein、DNA、RNA、ligand、ion这几个选项，依据我们的任务应该选择“ligand”。适配体是与靶标具有高亲和力和特异性的单链DNA或RNA分子，它们可以被视为与蛋白质或其他分子结合的配体。因此，在这种情况下，适配体最合适的分类是“ligand”。

阿尔法fold3对接教程

2.2 输入信息

• 在AlphaFold3的界面中，将您想要预测的蛋白质的氨基酸序列粘贴到相应的输入框中。
• 如果您想要预测的是蛋白-蛋白对接，确保将两个蛋白质的序列分别粘贴到对应的输入框中。
• 如果有特定的配体或修饰信息，也可以在这里输入。

2.3 查看与下载结果

• 提交信息后，AlphaFold3将开始预测过程。这可能需要一些时间，具体取决于您输入的序列长度和复杂性。
• 预测完成后，您可以在界面中找到详细的预测结果，包括对接得分、预测的蛋白质结构等。

3. 注意事项

• AlphaFold3每天每个账号只能运行10次任务，因此请合理规划您的使用。
• 由于AlphaFold3是一个相对较新的工具，其预测结果的准确性和可靠性仍在不断提升中。

通过以上步骤，您可以开始使用AlphaFold3进行蛋白质对接的预测。请注意，由于工具的开放性和更新性，建议关注官方发布的最新指南和教程以获得最佳使用体验。

AlphaFold3开源链接

地址：https://github.com/google-deepmind/alphafold3

申请获取模型参数：

https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSfWZAgo1aYk0O4MuAXZj8xRQ8DafeFJnldNOnh_13qAx2ceZw/viewform

参考资料：

11—Alphafold3简介与使用教程

关于AlphaFold3，你想要的都整理在这里了。模型预测性能和使用操作教程。

Alphafold3服务器用前必读，一文看懂Alphafold3应用范围及使用方法！

AlphaFold3最新官方使用教程

超详细！保姆级！AlphaFold3在线版使用教程

利用AlphaFold3进行分子对接分析蛋白互作实操

Alphafold 3使用教程分享

11—Alphafold3简介与使用教程

CNS导读AlphaFold3终开源

⭐️Alphafold3 及分子对接介绍｜技术面对面03期讲座录播_哔哩哔哩_bilibili

感谢官方