做科研，蛋白磷酸化修饰是研究的重点之一

蛋白修饰是蛋白质功能调控的重要机制，对于生物学研究和药物开发具有重要意义。以下是一些与蛋白修饰相关的数据库资源：

以下是21个与蛋白修饰相关的数据库的详细介绍：

灯塔索引（dotaindex）

类型：磷酸化、泛素化和乙酰化等蛋白修饰的综合性数据库。

特点：涵盖蛋白修饰和基因修饰的综合性数据库

PhosphoSitePlus®

类型：磷酸化、泛素化和乙酰化等修饰位点数据库。

特点：提供实验验证的蛋白质修饰位点，包括激酶和磷酸酶底物，以及相关的生物学数据。

dbPTM

类型：全面的蛋白质修饰数据库。

特点：收录了多种蛋白质修饰类型，包括磷酸化、糖基化、泛素化等，并提供修饰位点的详细信息。

UniProt

类型：蛋白质序列和功能数据库。

特点：虽然不是专门的修饰数据库，但提供蛋白质的序列信息，其中包含已知修饰位点的注释。

PubMed

类型：生物医学文献数据库。

特点：可以检索到大量关于蛋白质修饰的研究论文，是获取最新研究进展的重要资源。

Signor

类型：信号传导、分子相互作用和蛋白质修饰数据库。

特点：收集了信号通路中的分子相互作用和修饰事件，有助于理解细胞信号传导。

RESID

类型：蛋白质修饰残基数据库。

特点：提供蛋白质修饰残基的详细化学结构和相关的生物学信息。

MODbase

类型：蛋白质修饰位点数据库。

特点：专注于蛋白质修饰位点的收集和分类，包括实验验证的数据。

GlyConnect

类型：蛋白质糖基化修饰数据库。

特点：提供糖基化位点的详细信息，以及糖蛋白的生物学功能。

PepBank

类型：蛋白质磷酸化肽段数据库。

特点：收录了通过质谱鉴定的磷酸化肽段，用于磷酸化研究。

PHOSPHAT

类型：人类蛋白质磷酸化位点数据库。

特点：专注于人类蛋白质的磷酸化位点，提供实验验证的数据。

SysPTM

类型：系统蛋白质修饰数据库。

特点：整合了多种蛋白质修饰类型的数据，提供全面的PTM信息。

MIMP

类型：人类蛋白质甲基化修饰数据库。

特点：专注于人类蛋白质的甲基化修饰，提供位点信息和生物学功能。

O-GlycBase

类型：蛋白质O-连接糖基化数据库。

特点：提供O-连接糖基化位点的详细信息，以及相关的蛋白质序列和结构。

SNObase

类型：蛋白质硫酸化修饰数据库。

特点：收录了蛋白质硫酸化位点的数据，以及相关的生物学功能。

Amino Acid Modification Database (AAMD)

类型：蛋白质氨基酸修饰数据库。

特点：提供氨基酸修饰的类型、位置和生物学意义。

PDBsum

类型：蛋白质结构数据库。

特点：提供蛋白质的三维结构信息，包括修饰位点的具体位置。

PTMfunc

类型：蛋白质修饰功能分析数据库。

特点：分析蛋白质修饰的功能性后果，帮助理解修饰对蛋白质功能的影响。

PTMcode

类型：磷酸化修饰模式和代码数据库。

特点：研究磷酸化修饰的模式和代码，揭示磷酸化在信号传导中的作用。

KinasePhos

类型：人类激酶磷酸化位点数据库。

特点：专注于激酶介导的磷酸化位点，提供激酶底物信息。

NetPhos

类型：磷酸化位点预测工具和数据库。

特点：在线预测蛋白质序列中的磷酸化位点，并提供实验验证的数据。

这些数据库为研究者提供了强大的工具，可以帮助他们在蛋白质修饰领域进行深入的研究。在使用这些数据库时，研究者应该注意数据库的更新频率、数据质量、覆盖范围和用户界面等因素。