科研打工人必知：曾让微生物基因注释超轻松的 Prokka

近来，大家都说生物信息学不行了。正所谓“青年人常思将来，老年人常思过往”。今天要介绍的这款软件，让我想起了生物信息学的黄金时代。

这就是微生物基因组一站式注释工具、打工人的摸鱼神器：Prokka。当年有了它，微生物基因注释工作就成了很喜欢干的活，因为一条命令就完成了。极少出错，极少返工，非常可靠。

现在虽然有了更好的替代产品，但今天还是让我们怀念一下曾经的经典。

Prokka简介

Prokka是一款基因结构注释软件，它可以对细菌、古菌和病毒基因组进行快速高效的注释。通过Prokka，你可以轻松获取基因、蛋白质、rRNA和tRNA等关键信息，为你的研究提供有力支持。

功能特点

1. 1. 一站式服务：Prokka集成了多种生物信息学工具，能够一次性完成基因预测、功能注释、非编码RNA识别等多个步骤，让你告别繁琐的操作流程。
2. 2. 高效准确：Prokka采用先进的算法，能够快速处理大规模基因组数据，同时保证注释结果的准确性和可靠性。在台式机上，Prokka可以在大约10分钟内完成细菌基因组草图的注释。
3. 3. 兼容性强：Prokka支持多种输入格式，如FASTA、GenBank等，同时输出格式也非常丰富，包括GFF3、EMBL、FASTA等，方便你与其他工具进行无缝对接。
4. 4. 友好易用：Prokka的命令行界面简洁明了，操作简便，即使你是初学者也能轻松上手。用户可以通过一系列的参数来定制注释过程。例如，用户可以指定基因组的类型（细菌、古生菌等），以及是否添加基因特征等。

Galaxy生信云平台上的Prokka

如果你觉得本地安装Prokka太麻烦，或者想要随时随地访问你的注释结果，那么Galaxy生信云平台(https://usegalaxy.cn/)是一个不错的选择。

你只需上传你的微生物基因组数据，选择Prokka进行注释，设置相关参数，然后点击运行，就能得到详细的注释结果。