Docker
众多生物科学家将一些常用的例如:Bowtie、FATSAQC、SAMtools这类工具和实验环境都完整封装到Dorker镜像中。
构建好的Docker镜像可以在Docker Hub上注册,方便其他学者直接下载和运行这些镜像,无需编译或进行复杂的设置,即可获得可重复的结果,给大家带来很多便利
被限制访问的Docker
但是近期,Dockerhub镜像仓库出现了访问问题,用户在尝试访问时收到
“无法访问此网站”提示,
并显示超时错误:ERR_CONNECTION_TIMED_OUT。
通过Docker拉取常用镜像时也遇到同样的超时问题,导致无法成功拉取。
经过测试发现,这一问题是由于默认镜像站点的DNS被污染且SNI连接阻断导致的
解决方案
针对这一问题,“天意生信云”的技术团队上线了
天意云Docker镜像加速器
以解决Docker访问限制的问题,并且承诺本加速器对本平台所有科研人员免费
加速器地址:https://hub.dftianyi.top
配置镜像加速器【Ubuntu、Centos】
针对Docker客户端版本大于 1.10.0 的用户
您可以通过修改daemon配置文件/etc/docker/daemon.json来使用加速器
sudo mkdir -p /etc/docker
sudo tee /etc/docker/daemon.json <<-'EOF'
{
"registry-mirrors": ["https://hub.dftianyi.top"]
}
EOF
sudo systemctl daemon-reload
sudo systemctl restart docker
配置后效果如下:
大家又可以畅快的拉取使用docker镜像了!