区区7个肿瘤病人单细胞样品就近20万细胞吗

看到了一个新鲜出炉的肿瘤病人单细胞图谱文章：《Single-cell sequencing reveals the role of IL-33+ endothelial subsets in promoting early gastric cancer progression》，因为是国产科研成果所以单细胞测序数据在：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/HRA010477

可以看到， 仅仅是7个病人，但是文章写到：We constructed a single-cell atlas for 184,426 high-quality cells from gastric mucosa biopsies and surgical samples.

HRI1192261 Sample1 male HRS1569305 Sample1 Patients with early gastric cancer
HRI1192262 Sample2 male HRS1569306 Sample2 Patients with early gastric cancer
HRI1192263 Sample3 male HRS1569307 Sample3 Patients with early gastric cancer
HRI1192264 Sample4 male HRS1569308 Sample4 Patients with early gastric cancer
HRI1192265 Sample5 male HRS1569309 Sample5 Patients with early gastric cancer
HRI1192266 Sample6 male HRS1569310 Sample6 Patients with early gastric cancer
HRI1192267 Sample7 male HRS1569311 Sample7 Patients with early gastric cancer

关于胃癌疾病进展

胃癌的疾病进展通常遵循一定的病理过程，从慢性非萎缩性胃炎（Non Atrophic Gastritis, NAG）发展到慢性萎缩性胃炎（Chronic Atrophic Gastritis, CAG），然后可能发展为肠上皮化生（Intestinal Metaplasia, IM）。

肠上皮化生根据其严重程度可以分为轻度（IM-W）和重度（IM-S）。随后可能出现低级别上皮内瘤变（Low Grade Dysplasia, LGD）和高级别上皮内瘤变（High Grade Dysplasia, HGD），最终可能发展为早期胃癌（Early Gastric Cancer, EGC）。

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正常胃黏膜到胃癌的一系列病理变化

这一过程被称为Correa级联反应，它描述了从正常胃黏膜到胃癌的一系列病理变化。

课题自测数据很单调

但是作者善于结合公共数据资源，比如GSE134520：

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GSE134520

以及GSE183904：

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GSE183904

所以，不要在抱怨自己手上的资源少了，有可能是自己还没有用心整理这个领域的知识啊！

这个文章另外的值得一提的优点是图表很漂亮，提供全部的绘图代码，以及表格很齐全，很多信息大家做单细胞的都用得上！