内容补充---空间转录组配受体共定位

作者，Evil Genius

这几天我们就要上课了，报名的链接在2025年单细胞空间系列课程​，也在公众号上准备了一些课前的内容，其中对于空间转录组的配受体共定位我发现大家很感兴趣，尤其是下面这张图是怎么来的，非常想知道。

这张图的来源出处是文章

文章给到的分析方法是stlearn，但是大家不要盲目跑代码，更要学会其中的分析思路。

stlearn官网提供了可视化的方法，Tutorials — stLearn 0.4.11 documentation, 不过细节需要调整一下。

其实还有很多其他的展示形式，比如下面

等等。

关于这个内容，其实早在23年就已经讲过一节课了，在空转第18课共定位绘图

不过现在几乎很少在用stlearn了，这里提供大家两种方法，一个python、一个R，供大家分析。

我们首先来看R版本

R版本采用的是SpaGene

也可以用Seurat

参考文章在

空间转录组共定位展示分析图

空间转录组细胞类型和配受体的空间定位图

10X空间转录组时空基因细胞动态（共定位）绘图

10X空间转录组分析之空间模式与共定位

python版本是

生活很好，有你更好，大家好好学习即可。