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社区首页 >问答首页 >如何加快创建对象和应用函数的重复任务?

如何加快创建对象和应用函数的重复任务?

提问于 2018-06-08 01:52:22
回答 1关注 0查看 168

我正在尝试加快以下任务:

代码语言:javascript
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# For retrieving Cancer Genome Atlas RNAseq data

library(RTCGA.rnaseq)



# Extract information from sample ID about what kind of samples are in the dataset. 01 means tumor, 06 means metastatic tumor, 10 means healthy etc.

SKCM_sampletype <- as.factor(substr(x = SKCM.rnaseq$bcr_patient_barcode, 14, 15))
summary(SKCM_sampletype)

  01  06 
   1 367 

# Other objects I like to apply this function are (I have 30some objects but showing few below:
# (ACC.rnaseq,BLCA.rnaseq,BRCA.rnaseq,CESC.rnaseq,CHOL.rnaseq,COAD.rnaseq)

我想要做的是拥有一段代码,它将通过一系列对象并执行substringsummary功能。我还想把所有的summary统计数据和图表合并成一个如下所示的图表:

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