如何使用选项-std=c99安装R包
我在安装plyr R包时遇到问题，并得到以下错误：
Installing package into '/home/mousavian/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2'
(as 'lib' is unspecified)
* installing *source* package 'plyr' ...
** package 'plyr' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -I/share/apps/R/lib64/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I"/home/mousavian/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/Rcpp/include" -fpic -g -O2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
gcc -I/share/apps/R/lib64/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I"/home/mousavian/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/Rcpp/include" -fpic -g -O2 -c loop_apply.c -o loop_apply.o
loop_apply.c: In function 'loop_apply':
loop_apply.c:15:3: error: 'for' loop initial declarations are only allowed in C99 or C11 mode
for(int i = 0; i < n1; i++) {
^
loop_apply.c:15:3: note: use option -std=c99, -std=gnu99, -std=c11 or -std=gnu11 to compile your code
make: *** [loop_apply.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'plyr'
* removing '/home/mousavian/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/plyr'
Warning message:
In install.packages("R packages/plyr_1.8.3.tar.gz", repos = NULL) :
installation of package 'R packages/plyr_1.8.3.tar.gz' had non-zero exit status尝试通过install.packages命令从源安装R包时，如何使用-std=c99选项？
谢谢
回答 4
Stack Overflow用户
发布于 2018-07-28 02:18:04
先试用C11
编译器错误告诉您选择C99或C11。因此，除非您有意编译遗留代码，否则请先尝试C11。如果遗留的C99不起作用，您可以随时尝试它。
使用withr::with_makevars
对于不直接从源代码编译的每个包，编辑单独的包Makevars或协调对include/lib目录的全局更改不是未来的好策略。别干那事!编辑R的make配置的一个很好的替代方法是使用withr::with_makevars仅针对安装命令操作Makevars：
library(withr)
with_makevars(c(PKG_CFLAGS = "-std=c11"),
install.packages("plyr", repos = NULL, type = "source"),
assignment = "+=")另外，您可能已经安装了withr，因为它是一个devtools依赖项。
Stack Overflow用户
发布于 2016-02-04 10:23:46
如果不存在，请在您的$HOME (在本例中为/home/mousavian/.R)中创建一个目录。在内部，创建一个Makevars文件(无扩展名)。使用您喜欢的编辑器编辑此文件，并编写：
CC = gcc -std=c99然后，保存它，在启动R之后，只需运行
install.packages("plyr", dependencies = TRUE)它应该使用gcc -std=c99进行编译。
Stack Overflow用户
发布于 2017-01-01 20:47:39
默认的/etc/R/Makeconf包括CC = gcc -std=gnu99 (R 3.3.2和可能最新的或所有其他最新版本，尽管我认为正在开发的版本会跳到21世纪)
公认的答案可能会很好地工作，但不是R的默认设置。如果不使用其他选项设置CC=gcc，则会删除此默认值，这也是出现此错误的另一个原因。最好不要使用默认值，除非你知道自己在做什么。
https://stackoverflow.com/questions/35198301
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