问在Android中，有没有办法在应用程序级别禁用hosts文件？

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是否有应用程序属性或TCP设置允许我这样做？

不是的。对于您自己的IP地址(例如HTTP请求)，欢迎您找到一些Java DNS解析库并使用它，而不是系统的解析库，但您的应用程序中无法拦截来自第三方代码的其他请求。

或者，是否存在应用程序级别的

钩子？

不是的。请参见上面的。

基本上，如果人们不喜欢广告，就不要使用我的应用程序，但我不想成为一个混蛋，让应用程序无法运行。

然后，您应该修复(或与您的广告网络修复)的原因，为什么您的应用程序不能运行时，用户安装了一个“广告拦截主机文件自定义ROM”。广告横幅不应该因为它不能解析DNS而崩溃，因为有可能失败的原因与“广告阻止主机文件自定义ROM”无关(例如，具有连接的DNS服务器)。

由于您没有解释“不运行”在此上下文中的含义，因此很难为您提供更具体的建议。