问使用Sweave编写大型文档。有没有可能像LaTeX那样做？

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以下是对我非常有效的方法：

我有一个主文件("master.Rnw")，它没有文本，只是用来收集最终形成文档的文件(章节、章节)。

然后我有一个包含R代码的文件，它在各种其他文件中被重用("func.Rnw")。在这里，我有很多命名的块

<<my_fun_1,eval=FALSE,echo=FALSE>>=
# code:
c <- a * b
@

在master.Rnw中，我在\begin{document}之后做的第一件事是

\SweaveInput{func.Rnw}

从那里，我有我的命名块可用。在我现在可以拥有的文件"chap1.Rnw“中

<<echo=FALSE>>=
a <- 10
b <- 25
<<my_fun_1>>
c
@

当然，我必须

\SweaveInput{chap1.Rnw})

进入master.Rnw。

我只需要对生成的master.tex文件执行\Sweave{master.Rnw}，然后再对其进行处理，而不需要复制/粘贴或处理多个文件。

我正在写一篇由大约25个表格和图形组成的60+页面，到目前为止一切都运行得很好。

希望这对你有帮助，雷纳

我正在用斯威夫写一本书，大约有16章。我同意将makefile与多个Rnw文件一起使用是一个好主意。关于这种方法的另一个好处是make可以并行运行(我认为是-p)，因此根据章节的对象相互依赖的方式，你可以同时运行很多代码。

对我来说有所不同的是缓存。我的几个代码块可以运行几天，但在写这本书的过程中没有变化。有一些包允许您在运行结果时保存结果，并且仅在块所依赖的对象发生更改时才重新运行块。

有几个包可以做到这一点。请参见：

http://cran.r-project.org/web/views/ReproducibleResearch.html

我使用Bioconductor的weaver包。

当我在大脑转储的时候...如果你有多个作者，我发现一个共享的Dropbox帐户是维护项目的一个很好的方式。

最大值

我推荐使用RStudio (http://www.rstudio.com/ide/)而不是WinEdt。Sweave很好地集成到了集成开发环境中，与WinEdt一样，您可以将一个文件设置为主文件。在主文件中，可以使用以下命令包含子文件

\SweaveInput{Child.Rnw}

您可以通过包含以下指令将子文件链接回主文件

% !Rnw root = Master.Rnw

在子文件中。这样，在处理子文件和排版时，RStudio就知道排版主文件。

有关详细信息，请参阅http://www.rstudio.com/ide/docs/authoring/multiple_rnw_files上的RStudio文档

最好的特性是，即使在处理多文件文档时，Synctex和TeX错误日志导航仍然有效。