在Julia中使用LightGraphs加载图(xml.gz)时出错
在Julia中使用LightGraphs加载图(xml.gz)时出错
提问于 2020-10-11 10:32:31
我试图使用xml.gz以GraphIO的格式加载朱莉娅格式的网络。守则如下：
using LightGraphs
using GraphIO
D = loadgraphs("test.xml.gz", GraphMLFormat())我得到了以下错误：
┌ Warning: `GraphIO.GraphMLFormat` has been moved to submodule `GraphIO.GraphML` and needs `EzXML.jl` to be imported first. I.e. use
│ using EzXML
│ GraphIO.GraphML.GraphMLFormat()
│ caller = top-level scope at test.jl:3
└ @ Core ~/File/Code/test_graph/test.jl:3
ERROR: LoadError: UndefVarError: GraphML not defined然后，我尝试导入EzXML并执行以下操作：
using LightGraphs
using GraphIO
using EzXML
r = GraphIO.GraphML.GraphMLFormat()
D = loadgraphs("test.xml.gz", r)我得到以下错误，我不知道如何修复它
┌ Warning: `GraphIO.GraphMLFormat` has been moved to submodule `GraphIO.GraphML` and needs `EzXML.jl` to be imported first. I.e. use
│ using EzXML
│ GraphIO.GraphML.GraphMLFormat()
│ caller = top-level scope at test.jl:5
└ @ Core ~/File/Code/test_graph/test.jl:5
ERROR: LoadError: MethodError: no method matching bytesavailable(::Inflate.InflateGzipStream)
Closest candidates are:
bytesavailable(!Matched::Base.SecretBuffer) at secretbuffer.jl:153
bytesavailable(!Matched::Base.Filesystem.File) at filesystem.jl:198
bytesavailable(!Matched::Base.BufferStream) at stream.jl:1243
...回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2020-10-11 14:02:36
解压缩似乎有问题-我不能告诉你为什么，但我也可以复制其他压缩图表。
考虑解压缩图形(例如，在linux上使用gzip )：
gzip -c -d test.xml.gz > test.xml那么您应该能够用
D = loadgraph("test.xml", GraphIO.GraphML.GraphMLFormat())页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/64303011
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