问为什么重定向操作符被解释为R的system()调用中的文件？

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跑步时

cat file1 > file2

您正依赖shell为您进行重定向。当您在linux机器上运行system()时，它将为您创建一个shell，但是当您在Windows上使用system()时，它不会运行完整的shell，它只是尝试执行命令。因此，您需要使用shell()代替。

shell(command = "cat file1 > file2")

这将在?system帮助页面的Note部分中进一步讨论。

(这个答案主要是作为MrFlick先生关于使用shell的建议的另一种通知。)

system2比system稍微差一些。稍微好一点的一种方法是，它允许使用stdout=和stderr=参数对参数进行重定向。你的命令是：

system2("cat", "file1", stdout = "file2")

不过，要小心，除了最简单的命令序列(或最偏执的命令序列)外，R的system命令对所有命令序列都是非常危险的。作为比较，

• system()接受一个字符串，使调用者处理任何引用；

• system2()允许您提供一个论点向量，在我看来，它将处理引用和类似的.但从它的来源来看：

命令<- env(c(shQuote(命令)，env，args)，折叠=“")

，它只保护命令本身，留下其余的args盲目地保留space-collapsed.。

另一种选择是使用processx包运行命令，因为它为您处理所有这些.还有其他一些安全措施和钟声。