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社区首页 >问答首页 >运行VASP 5.4.1时分割故障

运行VASP 5.4.1时分割故障
EN

Stack Overflow用户
提问于 2016-06-22 00:52:21
回答 1查看 1.1K关注 0票数 0

因此,我们试图在Ubuntu14.04LTS上编译VASP 5.4.1。下面是这里描述的类似的安装步骤:如何使用GNU编译器为Linux编译VASP 5.4.1。但是,当测试vasp可执行文件(vasp_std等)时,程序终止时会出现分段错误--无效内存引用错误。

我们目前拥有的makefile.include是:

代码语言:javascript
运行
AI代码解释
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# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \
         -DCACHE_SIZE=4000 \
         -DMPI_BLOCK=8000 -DscaLAPACK -Duse_collective \
         -DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \
         -Duse_shmem -Dtbdyn

CPP        = gcc -E -P -C $*$(FUFFIX) >$*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC         = mpif90
FCL        = mpif90

FREE       = -ffree-form -ffree-line-length-none

FFLAGS     =
OFLAG      = -O2
OFLAG_IN   = $(OFLAG)
DEBUG      = -O0

LIBDIR     = /usr/lib/x86_64-linux-gnu
BLAS       = -L$(LIBDIR) -lblas
LAPACK     = -L$(LIBDIR) -llapack
BLACS      = -L$(LIBDIR) -lblacs-openmpi -lblacsCinit-openmpi
SCALAPACK  = -L$(LIBDIR) -lscalapack-openmpi $(BLACS)

OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o  fftw3d.o  fft3dlib.o \
         /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfftw3.a
INCS       =-I/usr/include

LLIBS      = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)

OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o chi.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB     = $(FC)
CC_LIB     = gcc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB   = $(FREE)

OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o

# Normally no need to change this
SRCDIR     = ../../src
BINDIR     = ../../bin

跑完后:

代码语言:javascript
运行
AI代码解释
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mpirun -np 8 /home/<user>/VASP/vasp.5.4.1/bin/vasp_std

该程序运行了一段时间,然后终止了一些分段错误消息(上次我运行它时给出了其中的8个!):

代码语言:javascript
运行
AI代码解释
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Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.

Backtrace for this error:
#0  0x7F62EE595777
#1  0x7F62EE595D7E
#2  0x7F62EDA95CAF
#3  0x4DE3EA in __nonl_MOD_spher
#4  0x637E84 in __msphpro_MOD_sphpro
#5  0xC1E013 in MAIN__ at main.f90:?

任何见解都将不胜感激。

EN

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2022-01-16 17:15:34

事实上,它应该与您的VASP编译无关,这取决于Linux系统中的某个设置。我不确定这是否有效,在命令行中的每个任务之前,请键入:

代码语言:javascript
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AI代码解释
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/37963051

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