最近星球里面的小伙伴提到了一个问题,如何安装老版本的R3.6,Linux系统。...安装是可以的,但是安全的安装是值的推荐的,所谓安全的安装,就是不和系统已有的R语言和R包有冲突,不能把现有的系统搞崩了…… 所以,写篇博客,介绍一下。...3,不要直接用conda安装,新建一个conda环境(非常重要) conda create -p ~/R3.6 conda activate ~/R3.6/ 激活后,显示:R3.6: 4,安装R3.6...conda install r-base=3.6.0 -c pkgs/r 点击y之前,确保是R3.6 测试一下R语言: (/home/gwas/R3.6) [gwas@192 ~]$ R...Platform: x86_64-conda_cos6-linux-gnu
之前的R版本太旧,不少包装不上,需要安装新版本的R:R --versionR version 3.6.0 (2019-04-26) -- "Planting of a Tree"于是下载最新版R:因为没有证书.../configure --enable-R-shlib --prefix=/opt/R/R-4.2.2 --with-x=no...checking for readline/history.h......--with-blas...R is now configured for x86_64-pc-linux-gnu Source directory: ....--with-blas...R is now configured for x86_64-pc-linux-gnu Source directory: ....Code_Linux教程_Linux公社-Linux系统门户网站全网最全:新处理器安装R所出现的报错问题 - 简书linux服务器上装r,linux服务器安装R语言及Rstudio server_weixin
背景 使用服务器的R语言,安装poppr包过程中,报错: In file included from vendor/cigraph/src/community/optimal_modularity.c...^~~~~~~~ compilation terminated. make: *** [/data1/username/0030.software/python/3.8/envs/r-.../src/contrib/Rglpk_0.6-5.1.tar.gz tar xvf Rglpk_0.6-5.1.tar.gz 3.让R可以识别到依赖 因为我的R安装是使用conda安装的,所以我先激活了环境...移动文件,并设置变量,让R可以识别到依赖。...R CMD INSTALL Rglpk 安装完,Rglpk则可以正常使用,依赖于Rglpk的其他R包也可以正常安装了。 写在最后:有时间我们会努力更新的。
2、Linux上操作 用vi/vim命令打开脚本文件,输入“:set fileformat=unix”,回车,保存退出。 重新执行脚本,问题不在出现。
如果要使用新版本的R,除了直接安装,也可以直接拷贝R的文件夹。这样既可以保留原始的R版本和R包,也可以使用新版本的R和R包,R包存放在R目录下的library文件夹。...文件放路径 R: /usr/lib64/R llibrary: 系统R library目录:/usr/lib64/R/library ;个人家目录下默认的R library目录:~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library.../3.2,最后一个是R版本号 拷贝后的操作 将新版本R拷贝过来后,进入R/bin/,编辑R文件,将HOME_DIR路径改为你当前的新的R路径并保存。...此时可正常运行当前路径R。 ?...此时已经可以加载该R版本library文件夹下的R包,如果要添加新的R包,只需要将别的同R版本的R包文件夹比如data.table文件夹移动到新版本R包文件夹目录即可。
记录 在 Window 上编辑的脚本,上传到 Linux 上执行时一直报错,报错里有个 “\r”,每行后面都加了 “\r”,导致无法执行。...image.png 解决办法: vim -b filename image.png 执行: :%s/\r// 或者: :%s/^M//g image.png End....Copyright: 采用 知识共享署名4.0 国际许可协议进行许可 Links: https://lixj.fun/archives/linux去除rwindow中编辑的文本
为了大家有个清晰的认识,我将R比作武器,集成开发环境(IDE)就是操作台,而linux则是战场环境。一、R语言初识R 语言是一种专为统计分析、数据挖掘、图形可视化而设计的编程语言和环境。...首先考虑windows系统,我们从https://www.r-project.org/网站下载R,依次点击download、China通道后,选择你的操作系统点进Base下载R。...关与Linux的R安装,请参考我关于Conda的介绍。二、IDE的下载及使用由于直接使用R语言设计到包的安装,代码的储存及修改,图像的输出及保存等。因此,一个好的集成环境是必要的,这也就是IDE。...3、R的路径我们在左上角点击三个小点,打开终端,新建终端。输入which R,输出就是你R的路径。4、R的部署这里一共有三步。我们下载R插件,并在左下角的设置中打开设置,点击设置。...如果你要连接本地的R使用用户选项,连接服务器的R使用远程选项。a、在搜索框输入r.rterm,在linux框中输入你的R路径。使用Ctrl+S保存。
而在服务器(Linux系统)上,默认情况下,R会尝试从源代码编译安装包(除非你指定使用二进制包,但CRAN上Linux的二进制包相对较少)。编译过程需要系统中有相应的编译工具和依赖库。...问题描述 用户在安装 git2r 包的时候遇到报错,提示服务器的 libgit2 版本较低,不兼容。...export PKG_CONFIG_PATH="$HOME/.local/lib/pkgconfig:$PKG_CONFIG_PATH" 如果是在Rstudio中安装,则需要重启 Rsession,再安装R包...: 当然也可以在命令行打开R,再安装: 当然解决方法并不唯一,除了手动安装 libgit2,还可以使用 conda 构建环境来适配 git2r,或者安装 git2r 的旧版本以适配服务器环境等等。
1. cp -r 移动子目录和根目录到指定文件夹 将test文件夹 移动到video内 !cp -r ./test ./video 操作后 存在 ..../video/test 2. cp -r -d 移动所有子目录到指定文件夹 将所有子目录移动到指定位置 如structuring内存在 a,b,c,三个文件夹 ./structuring/a ....cp -r -d ./structuring/* ./ 则操作后 存在./a ./b .
的单引号变为双引号即可 awk 传入变量: 1 chrI="chr2";awk '/"'$chrI'"/{print $0}' clippointpos.csv #变量用$var表示,变量两边再加上"' R脚本传入变量
导语 GUIDE ╲ 你是否有过这样的困扰:想使用一个R包,但由于没有root权限而感到束手束脚? 别慌……你只需要用自己的账户重新安装一款R软件,进入到自己目录下的R就可以自由安装R包啦!...背景介绍 非Root权限的账户在linux上安装R时,会遇到各种各样的问题,小编作为资深“踩坑”专家,今天就好好为大家“排排坑”!...下载到目录/your/path下,执行: cd /your/path/ wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.6.2.tar.gz tar -...xzvf R-3.6.2.tar.gz cd /your/path/R-3.6.2 ....,就可以进入到自己路径下的R,去尽情安装你喜欢的R包啦。
1、uname -r : 显示操作系统的发行版号 2、uname -a :显示系统名、节点名称、操作系统的发行版号、内核版本等等。 ?...系统名: Linux 节点名称: iZ2zeeailqvwws5dcuivdbZ 操作系统的发行版号: 4.4.0-62-generic 内核版本: #83-Ubuntu SMP Wed Jan 18...14:10:15 UTC 2017 硬件平台: x86_64 机器硬件名: x86_64 系统处理器的体系结构: x86_64 操作系统: GNU/Linux
在Linux系统下一直用上下键查找以前输入的命令,这个找刚输入不久的命令还是很方便的,但是比较久远的命令,用上下键效率就不高了。...那个history命令也是个花架子,虽然功能多,但不好用,网上找了下,发现了用ctrl + r这个快捷键查找历史命令,研究了一下发现真是好用。
顺便重温下Linux挂载硬盘 [root@localhost ~]# fdisk -l Disk /dev/nvme0n1: 500.1 GB, 500107862016 bytes 64 heads...Start End Blocks Id System /dev/nvme0n1p1 1 476940 488386544 83 Linux...(17-May-2010) Discarding device blocks: done Filesystem label= OS type: Linux
远程Linux服务器安装 Matlab-2014a 基于 服务器远程安装Matlab2015, 推荐. 1....准备 Matlab_R2014A.iso 镜像 Matlab_R2014A Crack破解文件 2....Matlab_R2014A.iso /home/xxx/matlab Step3 - 安装目录及激活文件创建 sudo mkdir -p /usr/local/MATLAB/R2014a sudo mkdir...-p /usr/local/MATLAB/R2014a/etc 在 /usr/local/MATLAB/R2014a/etc 创建激活文件 activate.ini,内容如下: isSilent=true...MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libmwservices.so.bk sudo cp /path/to/Crack/Linux/libmwservices.so /usr/local
问题描述 前几天编写的shell小脚本,测试自动安装MySQL的,今天测试运行,然后出现如下错误 $’\r’:command not found, 问题分析 检查脚本,没有问题,只是有空行。...提示这个错误也不是代码本身错误,怀疑可能是编码格式等错误,:脚本是Linux下编辑完成测试。后期我又做了简单修改,是在在window下修改后完成,然后上传到Linux服务器的。...注意到:win下的换行是回车符+换行符,也就是\r\n,而unix下是换行符\n。 Linux下不识别\r为回车符,如果脚本有\r回车符那么会导致脚本编码执行出现问题。...处理问题 在linux上执行 dos2unix 脚本名,转换后,在执行该脚本。...在学习中尽量慢慢养成好的习惯,在Linux下编码 测试 更新等 结尾 在工作和学习中遇到的问题和大家分享,希望对大家有所帮助。
R studio/R 工具指南(十四:在Rstudio中使用python和conda) (qq.com) 前言 最近忽然发现linux 上装R 包让人叫苦不迭,各种蜜汁依赖或路径原因的报错,比如单单一个.../rhdf5/src' ERROR: compilation failed for package ‘rhdf5’ 开始我也比较天真,寻求网友们的帮助:installation error on linux...比如直接搜到了这个R 包的conda 安装方法:Bioconductor Rhdf5 :: Anaconda.org[3] conda create -n R4.1.2 -y r-base # 安装R环境...Rserver的诡计 比如免费版的Rserver,只能使用管理员配置的R。这也就意味着,你没法自由地驰骋在你的R环境里,包括安装R 包等等。...参考资料 [1] installation error on linux: Makevars:18: *** missing separator.
ntpdate SYNC_HWCLOCK=yes #此选项用于自动校准系统时钟与硬件时钟 OPTIONS="-x -u ntp:ntp -p /var/run/ntpd.pid" #注意理解Linux...在Linux系统中分为系统时钟和硬件时钟....#系统时钟指当前Linux kernel中的时钟,而硬件时钟指的是BIOS时钟,由主板电池供电的那个时钟 #当Linux启动时,硬件时钟会读取系统时钟的设置,之后系统时钟就独立于硬件时钟运作 [
Linux 运行 sh 脚本时可能报 \r 相关错误,本文记录解决方案。...问题复现 在 Windows 下建立脚本文件 test.sh echo "Hello World" echo "finish" 在 Linux 下运行 ..../test.sh: line 1: $'\r': command not found ./test.sh: line 2: $'\r': command not found Hello World ..../test.sh: line 5: $'\r': command not found finish 会报出 \r 的错误 syntax error near unexpected token '$'do...解决方案 核心目标为将 \r 删除掉 方法一:运行下面的语句 sudo sed -i 's/\r//' test.sh 方法二:运行下面的语句,然后再运行sudo bash test1215.
今天继续学习R语言基础的R包使用,以R包:dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败,解决方法https://mp.weixin.qq.com.../s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test R语言基础,你应该能够入门R了,渐渐的也要自己去学会看帮助文档,去搜报错,还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗? ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题,那么恭喜你,你的R应该没问题啦! 应该没问题了!!!!吧?