PHP的shell_exec函数是用于执行外部命令并返回输出结果的函数。然而，有时候当使用shell_exec执行某些a.out文件时，可能无法获取到预期的输出结果。这是因为a.out文件可能具有以下特点或问题：

1. 缺少可执行权限：a.out文件可能没有设置可执行权限，导致无法执行。在Linux系统中，可以使用chmod命令为文件添加可执行权限，例如：chmod +x a.out。
2. 缺少依赖库：a.out文件可能依赖于某些库文件，而这些库文件在执行环境中缺失或版本不匹配。这会导致a.out文件无法正常执行，从而无法输出结果。可以通过检查a.out文件所依赖的库文件，并确保这些库文件在执行环境中可用。
3. 输出被重定向：a.out文件可能将输出结果重定向到了其他地方，例如标准错误输出或文件中。shell_exec函数默认只返回标准输出结果，因此无法获取到被重定向的输出。可以尝试使用其他函数，如exec或system，来获取完整的输出结果。
4. 执行环境限制：有些执行环境可能对shell_exec函数进行了限制，例如禁止执行某些命令或访问某些文件。这可能导致无法执行a.out文件或获取输出结果。可以检查执行环境的相关配置，如PHP配置文件或服务器配置文件，以了解是否存在限制。

总结起来，当PHP的shell_exec无法输出某些a.out文件时，可能是由于文件权限、依赖库、输出重定向或执行环境限制等原因导致的。解决方法包括设置可执行权限、确保依赖库可用、尝试其他获取输出结果的函数，以及检查执行环境的限制。