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R语言ggplot2作图如何去掉图例中的NA

遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候,我想给进化树的枝分组映射颜色,对应的推文是跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的,如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例的线更改的粗一点...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python

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    填补Excel中每日的日期并将缺失日期的属性值设置为0:Python

    现在有一个.csv格式文件,其第一列表示日期,用2021001这样的格式记录每一天的日期;其后面几列则是这一日期对应的数据。如下图所示。   ...接下来,我们使用pd.to_datetime方法将df中的时间列转换为日期时间格式,并使用set_index方法将时间列设置为DataFrame的索引。   ...随后,计算需要填补的日期范围——我们将字符串'2021001'转换为日期时间格式并作为结束日期,将字符串'2021365'转换为日期时间格式并作为结束日期,使用pd.date_range方法生成完整的日期范围...随后,即可将修改后的DataFrame保存到输出文件中,使用to_csv方法,并设置index=False以避免保存索引列。   运行上述代码,即可得到如下图所示的结果文件。   ...可以看到,此时文件中已经是逐日的数据了,且对于那些新增日期的数据,都是0来填充的。   至此,大功告成。

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    Python中获取当前日期的格式

    :%S”)## 12小时格式 示例 一个获取当天日期和时间的简单python程序 #!...%M 十时制表示的分钟数 %n 新行符 %p 本地的AM或PM的等价显示 %r 12小时的时间 %R 显示小时和分钟:hh:mm %S 十进制的秒数 %t 水平制表符 %T 显示时分秒:hh:mm:ss...%u 每周的第几天,星期一为第一天 (值从0到6,星期一为0) %U 第年的第几周,把星期日做为第一天(值从0到53) %V 每年的第几周,使用基于周的年 %w 十进制表示的星期几(值从0到6,星期天为.../usr/bin/python import datetime i = datetime.datetime.now() print (“当前的日期和时间是 %s” % i) print (“ISO格式的日期和时间是...格式的日期和时间 = 2013–10-11T19:38:19.4545 当前的年份 2013 当前的月份 10 当前的日期 11 dd/mm/yyyy 格式是 11/10/2013 当前小时是 0

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    Python中获取当前日期的格式

    "%I:%M:%S")## 12小时格式 示例 一个获取当天日期和时间的简单python程序 1 2 3 4 5 6 7 #!...%M 十时制表示的分钟数 %n 新行符 %p 本地的AM或PM的等价显示 %r 12小时的时间 %R 显示小时和分钟:hh:mm %S 十进制的秒数 %t 水平制表符 %T 显示时分秒:hh:mm:ss...%u 每周的第几天,星期一为第一天 (值从0到6,星期一为0) %U 第年的第几周,把星期日做为第一天(值从0到53) %V 每年的第几周,使用基于周的年 %w 十进制表示的星期几(值从0到6,星期天为.../usr/bin/python import datetime i = datetime.datetime.now() print ("当前的日期和时间是 %s" % i) print ("ISO格式的日期和时间是...-10-11 19:38:19.4545 ISO格式的日期和时间 = 2013-10-11T19:38:19.4545 当前的年份 2013 当前的月份 10 当前的日期  11 dd/mm/yyyy

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    R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

    image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和热图的拼接,右侧的热图可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色,按照一定的数值来映射大小...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 将图例放到右上角 通过 legend.justification 参数来实现 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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    使用Python中的igraph为绘图添加标题和图例

    在 `igraph` 中,可以通过添加标题和图例来增强图形的可读性和表达能力。我们可以使用 `igraph.plot` 函数进行绘图,并通过它的参数来指定标题和图例。...**1、问题背景**在python中的igraph库中,能否为绘图添加图例和标题?在手册或教程中都没有提到这个功能,但是在R中是可以的。...**2、解决方案**R本身提供了一个相当高级的绘图系统,而R接口只是对其进行了利用,因此可以在R中轻松创建绘图标题和图例。...igraph的plot函数在后台创建了一个Plot对象,将要绘制的图形添加到绘图中,为其创建一个合适的Cairo表面,然后开始在Cairo表面上绘制图形。...你可以使用标准的Cairo调用在图例周围绘制一个盒子。你还可以使用igraph.drawing.shapes中的节点绘制器类,如果你想绘制与igraph在绘制图形时类似的节点形状。

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    「R」魔性的ggplot2,多个图例时顺序会变?

    今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题,图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了,正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题,数据结构一样,然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档,默认使用了某种“秘密魔法”?!...下面是一个例子: dat <- data.frame(x = LETTERS[1:3], y = 1) p ggplot(dat, aes(x, y, fill = x, colour = 1:3...如果我们要改变图例顺序,按下面的操作,将color变成1,然后fill使用默认排序: # And we can reverse the order p + guides( color = guide_colorbar...当然,如果你理解了上面的英文文档,怎么设定怎么排都是可以的。

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    R语言可视化——ggplot图表中的线条

    今天跟大家分享的是ggplot图表中的一类重要元素——线条。...R语言中ggplot函数系统中涉及到线条的地方有很多,最常见的场景就是我们做geom_line()(折线图)、geom_path()(路径图),以及图表的绘图区(panel)、图表区、网格系统(grid...今天以一个折线图为例,简要说明ggplot函数中关于线条的主要参数及其效果。...以上依次使用的线条粗度值为1,2,3,4,5,6,大家可以通过图表感受到ggplot图表中线条的粗度变化规律。...除了折线图(以及路径图,等图层中的线条之外),在theme系统中存在大量的关于线条的属性设置(网格系统、图表边框、轴线、图例系统),均可以参照以上参数进行设置。

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    R语言可视化——ggplot图表系统中的形状

    今天跟大家分享ggplot图表系统中形状。 在ggplot函数系统中,形状是一类重要的映射属性,如同颜色一样,它可以被赋予给变量,当然也可以直接指定实际的形状类别。...ggplot函数的图层理念中,修改局部图层的元素,需要在局部图层内进行设定,这里需要在geom_point()函数内部进行形状设定。 R绘图系统中存储着的形状符号多达25种: ?...颜色变量是所有属性中为数不多的既可以使用离散型变量、又可以使用连续性变量进行映射的属性 二、关于制定属性映射时shape、size、colour(fill)的位置问题。...作用于单个图层的映射属性要放在对应图层中,(比如作用于线条的属性要放在geom_line()内,作用于形状的属性要放在geom_point()内),作用于全局的属性要放在全局系统函数层内【ggplot(...(比如本例中同时作用于折线图和散点图的数据集、x轴y轴变量以及分组变量等) 以上是个人学习ggplot函数过程中所获得的一些体会和心得,希望能够帮助大家在学习R语言可视化过程中少走一些弯路,限于个人能力和水平

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    Overleaf中设置表格中的字体为Times New Roman

    在Overleaf中设置表格中的字体为Times New Roman需要有这个字体包 使用 `\usepackage{times}` 宏包- 在文档的导言区添加 `\usepackage{times}`...宏包,这将把整个文档的字体设置为Times New Roman,包括表格中的字体。...`fontspec` 宏包(通常用于XeLaTeX或LuaLaTeX),可以在导言区添加 `\setmainfont{Times New Roman}` 命令来设置文档的主字体为Times New Roman...- 如果只想将表格中的字体设置为Times New Roman,而不影响文档其他部分的字体,可以在表格环境前添加相应的字体设置命令。...通过以上方法,你可以在Overleaf中根据自己的需求设置表格中的字体为Times New Roman。同时,不同的方法可能适用于不同的LaTeX编译引擎和文档场景,需要根据具体情况进行选择和调整。

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    在iis中如何设置站点的编码格式?

    一、环境:win7,iis6.0 二、步骤        打开iis,选择一个站点,在右侧的asp.net区域里,找到‘.NET全球化’项。   双击打开后。   ...分别选择‘请求’,‘文件’,响应‘,’响应头‘的编码格式。按照站点所需情况选择gb2312或utf-8。一般要保持一致。   然后点击右上角的‘应用’按钮。保存修改。配置完成。   ...配置保存后,iis在站点跟目录下,也就是物理路径指向的文件夹下,会新建或修改web-config文件。   打开文件,可看到刚才的设置内容。   刚才是视图化的设置。...我们也可以直接在站点下新建一个web-config文件,增加如果上图中的内容,保存即可。 三、完成        再到.net全球化设置中,可以看到,设置已经修改了。

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