为ggplot2背景使用rasterGrob R的水平渐变 - 腾讯云开发者社区

❝本节来介绍如何给图形添加渐变色背景，通过两个案例来进行展示；加载R包 library(tidyverse) library(grid) library(RColorBrewer) library(...interpolate = TRUE) h rasterGrob(blues9[1], width=unit(1,"npc"), height = unit(1,..."npc"), interpolate = TRUE) frasterGrob(brewer.pal(n = 8,name = "RdBu")[3:4], width=unit(1,"npc")...","#008080","#4b0082"))+ theme_void() 拼图 p1 %>% insert_left(p2,width = .4) 数据可视化-3 ❝上面是按分组分别进行了渐变色设置...，下面介绍一种直接简单粗暴添加背景色的方法 ❞ p1 <- ggplot(data=plot_data,mapping=aes(x=mean_exp_diff,y=group,colour = less

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

原英文：https://github.com/tidyverse/ggplot2/blob/HEAD/vignettes/ggplot2-in-packages.Rmd 这篇文章是为在包代码中使用ggplot2...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...将ggplot2列入Depends会让你的包在被加载/测试的同时加载ggplot2。这会让其他想要使用你包的人通过::使用你的函数而无需加载它。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...%+replace% ggplot2::theme(panel.background = ggplot2::element_blank()) } 通过，如果你为ggplot2的autoplot

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R语言ggplot2做柱形图并在指定的位置添加灰色背景

今天的推文介绍一下柱形图实现的代码 image.png 先介绍一个小知识点 ggplot2作图X轴默认坐标轴的刻度是朝下的，Y轴默认的刻度是朝左的，如果要改为朝上和朝右，该如何设置。...之前也有人问过这个问题 library(ggplot2) library(ggstar) ggplot()+ geom_star(aes(x=1,y=1), size=100...margin = margin(0,1.2,0,0,'cm') )) image.png 这里我们把axis.ticks.length.x = unit(-1,'cm')刻度线的长度调整为负数就可以了...这个R包安装直接使用命令install.packages("dslabs") 加载数据集 library(dslabs) data("nyc_regents_scores") 给数据集增加一列...", color = "black", fill = "#C4843C") image.png 指定位置添加背景 new_df %>% ggplot

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R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状

R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状如果想用其他形状，有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes...ggstar这个R包的整体结构暂时还看不明白，但是定义形状的部分自己能够修改。...在 primitive.R 代码中 plxy 就是一个形状的数据，第一列是x，第二列是y 比如上图中28的形状 square diamond 把中心掏出一正方形的空白 data.frame(x=c(0,...) source("ggstar02/geom_star.R") source("ggstar02/primitive.R") source("ggstar02/utilities.R") library...，就能够把这个形状用于ggplot2的散点图中

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善用图片-你将有不一样的可视化效果

引言今天在查找资料时发现了一个超酷的R语言第三方颜色包 R-ghibli，目前可以直接通过 CRAN 安装的。...数据处理由于现阶段主要做的是数据可视化部分，涉及到的数据处理代码又会给人繁琐感觉，这里我们直接给出处理过的数据类型，所需数据如下： ? 主要涉及到的为pandas常用的数据处理操作。...01. ggplot2 + ghibli 可视化展示借助于ggplot2 强大的绘图功能和ghibli 包的颜色设置，我们不需要自行定义颜色，这也算是我的第一篇ggplot2 可视化绘制教程哦 ?...、网格等大量图表属性的设置，大家可以去ggplot2官网查看哦。...总结在普通的数据可视化结果中适当的添加与之相关的图片，可以使可视化作品更加美观哦。本期推文分别使用Python-Seaborn和R-ggplot2 绘制同一个可视化作品。

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ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

R具有强大的统计计算功能和便捷的数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统：基础图形（base）、网格图形（grid）、lattice图形和ggplot2。...其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观，逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...书中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R包ggplot2实现的，充分展现了ggplot2生动、翔实的一面。...本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数（图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色）。...在修改分面变量水平时，各水平可以输入为数学表达式。

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「R」grid 图形对象 grobs

grobs 的创建通常使用以 Grob 作为后缀的函数们，包括circleGrob, linesGrob, polygonGrob, rasterGrob, rectGrob, segmentsGrob...下面是一个绘圆的示例： library(grid) my_circle r = 0.5,...而不同的对象有相同的一些参数设定，包括颜色、线型、大小等等，这通过 gpar 函数进行设定。再创建图形对象后，使用 grid.draw() 将图形绘制出来。...ggplot2 是基于 grid 系统构建的，所以它们可以比较好的进行整合。...我们可以使用 grid 提供的函数来修改 ggplot2 图形，首先我们需要先找到 ggplot 图像中的对象，然后使用 grid.edit() 进行修改。

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R语言ggplot2：单元格为方块的热图简单小例子-2

昨天公众号后台有人留言作图，示例图如下 image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色...基本的思路有了。...继续昨天推文的内容 R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置（点击蓝色字体直达昨天的推文）今天的推文记录一下如何实现这个热图首先构造一份数据集 set.seed("20200407...rownames(df)<-paste0("X",1:6) write.csv(df,file = "20210407_example.csv",quote = F) image.png 这样是宽格式数据，ggplot2...data.frame( x = -Inf, xend = Inf, y = seq(1.5,14.5,1), yend = seq(1.5,14.5,1) ) 画图 library(ggplot2

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基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（1）

简介在查阅文献的过程中，看到了几幅非常不错的出版图，今天就跟着小编一起学习下，他们是怎么使用 R 绘制出来的。...主要知识点学会如何导入图形，并将其并排展示；学会设置自定义主题，简化代码，统一主题，方便绘制其他图形使用；学会使用 ggplot2 包内置参数添加文字已经其他其他修饰图标。...绘图加载包首先加载一些需要使用到的包。...或者观看我在 B 站发布的《R 语言可视化教程》，里面也有一些简单主题设置介绍。...color="white") + geom_segment(aes(x=0.83,xend=0.95,y=0.03,yend=0.03),size = 2,color="white") 这时候得到的结果为

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R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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R语言ggplot2作图好玩的配色：使用NBA各球队logo的配色

最近在学习R语言包的开发流程，看了之前分享过的关于吉普力工作室电影的配色包的代码，觉得里面的代码并不复杂，没准我也可以搞一个。...模仿这个包的代码，我尝试把NBA各个球队logo配色整理成了R语言ggplot2包作图的时候可以使用的配色函数。...颜色来源于链接 https://usteamcolors.com/nba-colors/ 首先将颜色整理成为一个yml格式的文件，基本文件格式如下 image.png 这里颜色最多的是太阳队，有7个可选...(name = name,direction = direction),...) } scale_color_nbalogo_d<-scale_colour_nbalogo_d 使用这些颜色首先是读取颜色.../Rpackagedev/ggNBAlogo/",pattern = "*.R",full.names = T) lapply(x,source) 接下来使用太阳队和雷霆队的配色来举个例子 library

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R-ggplot2 基础图表绘制-柱形图

，横轴为绑定变量区间分隔的取值范围，纵轴则表示变量在不同变量区间上的频数。...这里我们不再比较ggplot2的默认主题的好坏了，直接给出美化后的代码(当然借助了我非常喜欢的hrbrthemes主题包)： flipper_hist 为我电脑里的字体，这样就可以使用了。...img_file) i1 rasterGrob(img, interpolate = T) 接下来使用ggplot2的annotation_custom() 方法设置具体位置即可：...总结以上就是R-ggplot2关于基础柱形图的绘制推文教程，太具体的原理性这里也没做过多介绍，感兴趣的可以自行查阅相关资料。接下来还有Python版本的哦！练习数据获取

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跟着Microbiome学作图：R语言ggplot2画堆积柱形图展示微生物门水平的相对丰度

encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome 本地文件Giloteaux2016_Article_ReducedDiversityAndAlteredComp.pdf 今天的推文我们来重复一下论文中的...https://www.nicholas-ollberding.com/post/introduction-to-the-statistical-analysis-of-microbiome-data-in-r/...,df4,by.x="variable",by.y="sample_id") -> final_df 接下来是用 final_df这个数据集来作图 library(ggplot2) ggplot(...axis.ticks.y = element_line())+ labs(x="CONTROLS", y="Relative Abundance (%)") 这个对应的是论文中对照的那个图

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跟着NatureGenetics学作图：R语言ggplot2做进化树图及添加不同形状的背景色块

image.png https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter4.html 和论文中比较像的布局是 dayight这个布局使用ggtree作图的时候 ggtree...close to the limit 我现在用的R是4.0.3 换成4.1版本的R就没有这个问题读取树文件 library(ggtree) library(ggplot2) library(ggforce...) vert.tree<-read.tree("data/20220725/tree01.nwk") 作图的时候最方便就是直接使用ggtree ggtree(vert.tree) ggtree(...ggforce包中的geom_mark_hull()函数，这里比较麻烦的是还需要自己手动计算色块的边界坐标，算这些坐标还挺费时间的，还有一个问题是如何给色块添加渐变色拼图 library(patchwork...公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！

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绘制让人眼前一亮的美图--你需要这个！

导语 GUIDE ╲ ggthemr为ggplot2提供了近20种主题，可以直接使用，也可以根据需要设置配色，或改变图表细节。...背景介绍在我们日常的科研绘图中，经常会使用到ggplot2绘图，这也给我们带来很大的方便，但是在设置主题的时候，要想得到一个完美的颜色，还是需要大量的代码去实现，要想实现自由搭配还是比较麻烦的，这时候小编要给大家介绍一个主题配置神器...R包的安装与常规的R包不同，ggthemr没有在发布在CRAN上，因此我们需要使用devtools中的install_github()从github上安装： devtools::install_github...define_palette（）定义调色板的所有元素，包括背景，文本，轴线，色板和渐变的颜色。...Type参数 Type参数主要分为内部和外部两种选择，设置为内部时，图的背景色不会超出图区域。设置为外部时，则会给整个图和背景着色。让我们对比一下看看效果吧！

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如何试用 R 语言绘制散点图

R语言绘制基因表达基因的“对称散点图转录组分析中，计算了两组间差异表达的基因后，通常怎样表示？您可能第一时间想到可以使用火山图。...接下来通过该示例文件，展示使用R语言绘制差异基因表达“对称散点图”过程。 2 数据预处理首先对数据做一些预处理。...我们使用ggplot2的方法绘制差异基因散点图。...因此另一种思路是，颜色代表p值，这样就可以在图中获得一个渐变梯度。同样使用ggplot2的方法绘制，和上述过程相比仅在颜色指定上存在区别。...', midpoint = 0.5) + #渐变色颜色指定 theme_bw() + #背景调整 labs(x = 'control group', y = 'treat group', color

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R语言绘图之ggplot2

那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离，并按图层作图。...日期和时间 scale_discrete 离散值 scale_gradient 两种颜色构建的渐变色 scale_gradient2 3中颜色构建的渐变色 scale_gradientn n种颜色构建的渐变色...一组连续数据可以映射到X轴坐标，也可以映射到一组连续的渐变色彩。...使用xlim()和ylim()来设置连续型坐标轴的最小值和最大值 coord_cartesian(xlim=c(0,100),ylim=c(0,100)) guides：调整所有的text。

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文献配套GitHub发表级别绘图03-条形图

下面来实现Fig.2a的条形图(barplots) 一、数据载入 rm(list = ls()) library(reshape2) library(ggplot2) library(RColorBrewer...cast 函数的作用除了还原数据外，还可以对数据进行整合。 dcast 输出数据框。公式的左边每个变量都会作为结果中的一列，而右边的变量被当成因子类型，每个水平都会在结果中产生一列。..., "Spectral"))(22)) + # 设置填充颜色 theme_bw() + # 空白背景 theme(axis.text = element_text(colour = 'black...详解RColorBrewer包 ggplot2画图时会自带配色设置，但一般比较难看。当想使用一些高级，现有的颜色搭配时，不妨考虑下RColorBrewer包。...cols赋值给colorRampPalette pal <- colorRampPalette(cols) image(volcano, col=pal(22)) # 数据集volcano，颜色设置为：

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基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（2）

简介在查阅文献的过程中，看到了几幅非常不错的出版图，今天就跟着小编一起学习下，他们是怎么使用 R 绘制出来的。今天主要介绍第二幅图（B) ，直观来看是由两幅图所构成的。...值得注意的是：x 轴数值使用不同图形进行描绘（小编不是很懂，作者想表达什么，不过这种技巧是第一次见，可以学习学习）。第一幅图的介绍可见：基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（1）。...绘图加载包首先加载一些需要使用到的包。...小编表示疑问：参数应该得通过参数估计的方式得到吧，但是这里作者直接给定了。并且函数设定来看，均值直接写在函数内部了，并没有赋值为 mu=log(6)。虽然结果相同，但是可读性不强。...) 添加子图；使用 ggforce 包中的 geom_regon() 函数绘制修饰图形；使用 expression() 函数添加带有特殊符号的公式。

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ggplot2优雅的给图形添加渐变背景

「R」ggplot2在R包开发中的使用

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