本文是本学期第一篇,聊一聊什么是好的R包。这个问题源于年前一个同学,她在学习R语言,然后拿着一张总结的一些R包的图片问我:还有没有更好的包?当时就把我问蒙了,问她什么是更好的包?...她说是新更新的或者被大家所公认的包。我说你发的图里面的都是啊。。。然后就结束了对话。 ? 就是这张图 其实在她问我之前我从来也没想过什么算是“好”的包。...一直以来都是需要什么功能,找到有这个功能的包就直接用了,因为我觉得虽然有不同的包可以做同样的事情,但是核心的计算结果肯定是相同的,差别也就在命令参数和结果展示的差异。...那么什么是好的R包呢,对于我们这些只需要用R来做生信分析的人来说,如果功力没有那么深厚,看不懂R包的源代码,确实需要找到一些普遍都在使用且坚持更新的包,不仅仅不容易出错,而且网上这些包的学习资料也更多。...其实每个月生信类的杂志都会出很多新的R包的文章,但是大部分都没什么人用。能在网上留下痕迹的都是经过大家检验的。
-p,是映射宿主端口和容器端口,换句话说,就是将容器的对应端口服务公开给外界访问,而 EXPOSE 仅仅是声明容器打算使用什么端口而已,并不会自动在宿主进行端口映射。...> "CMD>" 那么有了 CMD 后,为什么还要有 ENTRYPOINT 呢?...这种 “CMD>“ 有什么好处么?让我们来看几个场景。...这些准备工作是和容器 CMD 无关的,无论 CMD 是什么,都需要事先进行一个预处理的工作。...比如: CMD echo $HOME 在实际执行中,会将其变更为: CMD [ "sh", "-c", "echo $HOME" ] 这就是为什么我们可以使用环境变量的原因,因为这些环境变量会被 shell
答案显而易见,平均数是(2+3+1)/3 = 2 如果整个过程没有任何外力干预,那么我们可以说仓鼠流感的基本传染数(R0)是2。 2这个数字看起来不大,但是千万不能小看它。...艾滋病:2~5 腮腺炎:4~7 SARS:2~3 麻疹:12~18 至于新型冠状肺炎,从疫情爆发开始到现在,各路专家分析的R0值不尽相同,所以暂时还没有定论,但一定比SARS的R0要高得多。...1.感染周期 所谓感染周期,是指一个病人从被感染到痊愈,或者从被感染到死亡的时间跨度。显然,疾病的感染周期越长,患者接触健康人的机会就越多,R0也就越高。...1.隔离 这里所说的隔离,是一个广义的概念。 首先可以是对患者的隔离。把患病者隔离开来,能够减少甚至杜绝了患者和健康人的接触。 其次是对人群聚集的限制。...此外,人类发明的特效药基本是针对细菌的(抗生素),对于病毒几乎无能为力。 因此,面对新冠肺炎疫情,要想降低R值,隔离才是我们最重要的措施。 相关阅读: 漫画:“新型冠状病毒”是什么鬼?
CMD 容器启动命令 Docker不是虚拟机,容器就是进程。既然是进 程,那么在启动容器的时候,需要指定所运行的程序及参数。 CMD指令就是用于 指定默认的容器主进程的启动命令的。...RUN,CMD和ENTRYPOINT都能够用于执行命令,下面是三者的主要用途 RUN命令执行命令并创建新的镜像层,通常用于安装软件包 CMD命令设置容器启动后默认执行的命令及其参数,但CMD设置的命令能够被...-p是 映射宿主端口和容器端口,换句话说,就是将容器的对应端口服务公开给外界访 问,而EXPOSE仅仅是声明容器打算使用什么端口而已,并不会自动在宿主进行 端口映射。...ONBUILD 命令格式 ONBUILD 首先我们创建一个Dockerfile,我们的目的是创建一个文件夹mydir FROM nginx ONBUILD RUN mkdir mydir...docker@default:~/mynginx$ docker build -t nginx_mydir .
项目部署 步骤总结 ---- Dockerfile 什么是Dockerfile Dockerfile可以认为是Docker镜像的描述文件,是由一系列命令和参数构成的脚本。...那么什么是上下文呢? 首先我们要理解 docker build 的工作原理。Docker 在运行时分为 Docker 引擎(也就是服务端守护进程)和客户端工具。...下面解释一下什么是匿名卷 具名挂载和匿名挂载 ---- CMD 命令 — 容器启动命令 首先思考一个问题,为什么我们下载一个tomcat镜像后,通过docker run 命令就可以直接运行一个tomcat...> "CMD>" 那么有了 CMD 后,为什么还要有 ENTRYPOINT 呢?...这些准备工作是和容器 CMD 无关的,无论 CMD 为什么,都需要事先进行一个预处理的工作。
QT的项目工程默认使用的是qmake,这本来也没什么问题。但是由于要用到vcpkg这个工具来管理第三方库,好像这个 vcpkg工具只能在cmake的项目中才能使用。...于是这里记录下QT的cmake工程配置,需要注意的是需要额外配置个项: -DCMAKE_PREFIX_PATH=D:\Qt\Qt5.10.0\5.10.0\msvc2015\lib\cmake -DCMAKE_TOOLCHAIN_FILE...=F:\vcpkg\scripts\buildsystems\vcpkg.cmake -Wno-dev 另外需要注意的是,在QT的环境中可以直接运行能出来界面没问题。...预定义变量 PROJECT_NAME项目名称 PROJECT_SOURCE_DIR工程的根目录 PROJECT_BINARY_DIR 执行cmake命令的目录 PROJECT_BINARY_DIR 执行...add_library(lib1 SHARED library.c library.h)指定生成的库文件,SHARED是生成动态库,STATIC后生成静态库 add_compile_options()
5:USER 6:WORKDIR 7:RUN 7.1 shell执行 7.2 exec执行 8:CMD 9:ENTRYPOINT 总结 ---- 前言 Dockerfile是一个包含用于组合映像的命令的文本文档...为了指定基本映像,第一条指令必须是FROM。一个声明以#字符开头则被视为注释。可以在Docker文件中使用RUN,CMD,FROM,EXPOSE,ENV等指令。...""] 用于支持包含空格的路径 示例: ADD hom* /mydir/ # 添加所有以"hom"开头的文件 ADD hom?.txt /mydir/ # ?...["-c"] 注:ENTRYPOINT与CMD非常类似,不同的是通过docker run执行的命令不会覆盖ENTRYPOINT,而docker run命令中指定的任何参数,都会被当做参数再次传递给ENTRYPOINT...总结 关键字 作用 FROM 指定基础镜像 MAINTAINER 作者的信息 RUN 执行什么命令 EXPOSE 容器对外暴露的端口 WORKDIR 进入到容器后进入到哪个目录 ENV 配置环境变量 ADD
可以使用docker build --no-cache来禁用缓存。 使用ADD和COPY指令也可以禁用RUN缓存。 CMD CMD和RUN是不同的。...txt /mydir/ 是绝对路径,或者WORKDIR的相对路径。...txt /mydir/ 是绝对路径,或者WORKDIR的相对路径。...R+ 08:25 0:00 ps aux top -b -H,其中top -b是ENTRYPOINT设置的,-H是docker命令行参数,添加到了ENTRYPOINT后面,覆盖了CMD的-c。...status初始化是starting。无论健康检查什么时候通过,它都会变为healthy(无论之前是什么状态)。在一定数量的连续失败后,它会变为unhealthy。
这对调试非常有帮助:可以基于该镜像运行一个具备交互功能的容器,使用最后创建的镜像对为什么你的指令会失败进行调试。 Dockerfile也支持注释。...以#开头的行都会被认为是注释,# Version: 0.0.1这就是个注释。 Dockerfile指令 1. FROM 指定基础镜像,必须为第一个命令。...["-c"] 注: ENTRYPOINT与CMD非常类似,不同的是通过docker run执行的命令不会覆盖ENTRYPOINT,而docker run命令中指定的任何参数,都会被当做参数再次传递给...所以可以指定ENTERYPOINT和CMD组合使用 通过ENTERYPOINT指定命令,CMD指定命令的参数 7. CMD 指定容器运行时的命令。...在使用docker run运行容器时,可以通过-w参数覆盖构建时所设置的工作目录。 12. USER 镜像由什么用户执行,如果不指定默认以root用户执行。
是指定构建镜像的上下文路径(不要理解为当前路径),由于docker运行时是使用 c/s 模式,当在命令行执行 docker build,实际是执行远程调用,通知 docker 引擎完成实际任务,请求时会把上下文路径下的文件打包发给服务端...f $ docker build -t nginx:v3 . docker build 可以直接指定 git rep 构建、tar包构建,等; 一般来说,使用 Dockerfile 构建镜像时最好是将...txt /mydir/ 可以是容器内的绝对路径,也可以是相对于 WORKDIR 指令设置的工作路径,不需要事先创建,如果目录不存在会在复制文件前先行创建缺失目录。...是可执行的) # cmd 设置,运行时带参数 echo xxx,实际运行命令: echo xxx 在运行镜像时,如果跟着其他参数,cmd就会被覆盖,而如果想覆盖 entrypoint 需要指定 --entrypoint...如果有 entrypoint,cmd 会作为默认参数传递给 entrypoint 作为执行参数;运行时传入参数,cmd 就会被覆盖,入口依然是entrypoint 如果没有 entrypoint,cmd
英文原文链接地址: Engine reference–>Dockerfile reference 推荐大家直接看官方英文文档就好了 以下内容会帮助大家了解什么是Dockerfile,以及如何编写Dockerfile...什么是Dockerfile文件 Dockerfile是一种可以用于创建镜像的文件,类似于makefile,它是一个包含了所有用于创建镜像的命令的有序序列的文本文件。...使用 Dockerfile的方法是: $ > docker build -t 'ubuntu:git' ..../something /something,因为创建镜像build的第一步是将buid的环境目录内容发送给 docker daemon进程。...以下是示例: COPY hom* /mydir/ # adds all files starting with "hom" COPY hom?.txt /mydir/ # ?
此数组形式是首选格式CMD。...在很多时候,CMD给出的是一个交互式shell,比如bash,Python等,比如CMD [“perl”, “-de0”],CMD [“python”],或 CMD [“php”, “-a”]。...例如,要添加一个名为的文件arr[0].txt,请使用以下命令: ADD arr[[]0].txt /mydir/ # copy a file named "arr[0].txt" to /mydir...3164 0% 0% top -b 该指令最恰当的用户是社会镜像的主要命令,允许该镜像像该命令一样运行,然后使用CMD作为默认标志 ENTRYPOINT ["s3cmd"] CMD ["--help...ARG ARG [=] 该ARG指令定义了用户可以docker build使用该–build-arg = 标志使用命令在构建时传递给构建器的变量。
当指定了 ENTRYPOINT 且使用的是 exec 格式时,CMD 的含义就发生了改变,不再是直接的运行其命令,而是将 CMD 的内容作为参数传给 ENTRYPOINT 指令,换句话说实际执行时,将变为...这些准备工作是和容器 CMD 无关的,无论 CMD 为什么,都需要事先进行一个预处理的工作。...Dockerfile 中的 ARG 指令是定义参数名称,以及定义其默认值。该默认值可以在构建命令 docker build 中用 --build-arg = 来覆盖。...-p,是映射宿主端口和容器端口,换句话说,就是将容器的对应端口服务公开给外界访问,而 EXPOSE 仅仅是声明容器打算使用什么端口而已,并不会自动在宿主进行端口映射。...WORKDIR 是改变工作目录,USER 则是改变之后层的执行 RUN, CMD 以及 ENTRYPOINT 这类命令的身份。
每运行一条指令,就会为镜像添加新的一层并提交,注:一个镜像最多不允许超过127层。最后时CMD指令,是指定运行容器时的操作指令。...ADD --chown=55:mygroup files* /mydir/ ADD --chown=bin files* /mydir/ ADD --chown=1 files* /mydir/ ADD...Dockerfile 中的 ARG 指令是定义参数名称,以及定义其默认值。该默认值可以在构建命令 docker build 中用 --build-arg = 来覆盖。...上面执行的命令是ENTRYPOINT和CMD指令拼接而成. ENTRYPOINT和CMD同时存在时, docker把CMD的命令拼接到ENTRYPOINT命令之后, 拼接后的命令才是最终执行的命令....WORKDIR 是改变工作目录,USER 则是改变之后层的执行 RUN, CMD 以及 ENTRYPOINT 这类命令的身份。
,如: 1 2 COPY hom* /mydir/ COPY hom?....txt /mydir/ 目标路径可以是容器内的绝对路径,也可以是相对与工作目录的相对路径,目标路径不需要事先创建,不存在会自行创建,另外使用COPY指令进行复制,源文件的各种元数据都会保留,比如读、写...在COPY和ADD指令中选择的时候,可以遵循这样的原则,所有的文件复制均使用COPY,只有需要自动解压缩的场合使用ADD CMD容器启动命令 Docker不是虚拟机,容器就是进程,既然是进程,那么在容器启动的时候...[选项] <上下文路径/URL/-> 这里我们要说下什么是上下文路径?...有时我们的指令中会包含一些ADD和COPY指令,它们需要将本地文件复制进镜像,而docker的架构实际上是C/S架构,我们做的docker build操作实际上是在服务端,所以我们如果要想让服务端获得本地文件
目录 什么是 Dockerfile?...ONBUILD LABEL 什么是 Dockerfile?...代表本次执行的上下文路径,下一节会介绍。 $ docker build -t nginx:v3 . 以上显示,说明已经构建成功。 上下文路径 . 是上下文路径,那么什么是上下文路径呢?...CMD 类似于 RUN 指令,用于运行程序,但二者运行的时间点不同: CMD 在docker run 时运行。 RUN 是在 docker build。...可以搭配 CMD 命令使用:一般是变参才会使用 CMD ,这里的 CMD 等于是在给 ENTRYPOINT 传参,以下示例会提到。
我给你的建议就是:先学习R语言 专注于一种语言 在说明为什么你应该学习R语言之前,我想强调的是,在开始学习数据科学时,你应该学习一种语言。 有些人问我是否应该学习在学R语言的同时学习Python。...事实证明,R语言是最佳的选择。 学习R语言 我建议你将R语言作为你的第一个“数据科学编程语言”。虽然也有例外,比如特定的项目需要。...随着世界转变为数据流时,学术科学与面向商业的数据科学之间的界线会变得模糊。 通过R语言学习“数据科学的技能”是最简单的 然而,R语言的普及性并不是学习R语言的唯一原因。...以下是在学习R语言之后,你可以考虑学习的语言: Python Python是一种值得考虑的多用途编程语言。在O'Reilly最近的调查中,Python是数据科学家中第二受欢迎的编程语言。...总结:学习R语言,并集中精力 如果你是初学者,R语言是很好的选择。同时需要专注于学习数据科学的技能。 在学习过程中,你可能会看到很多新技术和新工具,或者一些令人眼花缭乱的数据可视化。
什么是 Dockerfile? Dockerfile 是一个用来构建镜像的文本文件,文本内容包含了一条条构建镜像所需的指令和说明。...是上下文路径,那么什么是上下文路径呢? $ docker build -t nginx:v3 ....上下文路径,是指 docker 在构建镜像,有时候想要使用到本机的文件(比如复制),docker build 命令得知这个路径后,会将路径下的所有内容打包。...CMD 类似于 RUN 指令,用于运行程序,但二者运行的时间点不同: CMD 在docker run 时运行。 RUN 是在 docker build。...可以搭配 CMD 命令使用:一般是变参才会使用 CMD ,这里的 CMD 等于是在给 ENTRYPOINT 传参,以下示例会提到。
什么是dockerfile? Dockerfile是一个包含用于组合映像的命令的文本文档。可以使用在命令行中调用任何命令。 Docker通过读取Dockerfile中的指令自动生成映像。...docker build命令用于从Dockerfile构建映像。可以在docker build命令中使用-f标志指向文件系统中任何位置的Dockerfile。...""] 用于支持包含空格的路径 示例: ADD hom* /mydir/ # 添加所有以"hom"开头的文件 ADD hom?....txt /mydir/ # ?...["-c"] 注: ENTRYPOINT与CMD非常类似,不同的是通过docker run执行的命令不会覆盖ENTRYPOINT,而docker run命令中指定的任何参数,都会被当做参数再次传递给
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 前言 Dockerfile 是一个用来构建镜像的文本文件,文本内容包含了一条条构建镜像所需的指令和说明。...Dockerfile简介 Dockerfile是用来构建Docker镜像的构建文件,是由一系列命令和参数构成的脚本。...可以搭配 CMD 命令使用:一般是变参才会使用 CMD ,这里的 CMD 等于是在给 ENTRYPOINT 传参,以下示例会提到。...(WORKDIR 指定的工作目录,必须是提前创建好的)。 docker build 构建镜像过程中的,每一个 RUN 命令都是新建的一层。只有通过 WORKDIR 创建的目录才会一直存在。...当有新的 Dockerfile 使用了之前构建的镜像 FROM test-build ,这是执行新镜像的 Dockerfile 构建时候,会执行 test-build 的 Dockerfile 里的 ONBUILD
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