从.NET核心2.2升级到3.1时，无法禁用默认应用编程接口版本

的原因是在.NET Core 3.0之后，官方不再支持手动禁用默认的API版本。这是因为.NET Core团队将API设计和版本管理作为了一个重要的发展方向，并且在.NET Core 3.0中引入了一些重大的API更改和新功能。

在.NET Core 2.2及之前的版本中，开发人员可以通过在项目文件的csproj中指定<RestorePackagesWithLockFile>true</RestorePackagesWithLockFile>来禁用默认的API版本。但是从.NET Core 3.0开始，此选项已经被移除，并且默认情况下，项目将使用当前版本的.NET Core所支持的最新API。

这个变化的目的是为了确保开发者能够始终使用最新的API，并避免因为禁用默认API版本而错过一些重要的更新和改进。同时，.NET Core团队鼓励开发者及时升级到新的版本，以便享受最新的功能和性能提升。

对于升级到.NET Core 3.1的项目，建议开发者进行以下操作来处理相关的API版本问题：

1. 首先，通过使用.NET Core 3.1版本的SDK来更新项目，确保项目可以成功编译和运行在.NET Core 3.1环境中。
2. 然后，使用.NET Core 3.1的兼容性分析工具（例如Microsoft.DotNet.ApiCompatibility.Analyzers）来分析项目中使用的API是否存在变化或已过时。根据分析结果，开发者可以相应地修改代码，以适应新版本的API。
3. 如果遇到某些特定的API无法直接替换或修复，可以查阅相关的官方文档或资源，了解新版本中的替代方案或解决方法。

总之，尽管无法直接禁用默认的API版本，但通过升级到.NET Core 3.1，并进行相应的API适配和代码修改，开发者仍然可以顺利迁移项目，并享受到.NET Core 3.1带来的新功能和性能优化。