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从R调用带有特定工作目录的shell skript

从R调用带有特定工作目录的shell脚本,可以使用R的系统调用函数system()或system2()来执行shell命令。这些函数允许我们在R中执行外部命令,并且可以指定工作目录。

在R中调用shell脚本的一般语法是:

代码语言:R
复制
system("shell脚本路径", intern = TRUE, ignore.stdout = FALSE, ignore.stderr = FALSE, wait = TRUE, input = NULL, show.output.on.console = TRUE, invisible = FALSE)

其中,"shell脚本路径"是指要执行的shell脚本的路径。

为了在调用shell脚本时指定特定的工作目录,我们可以使用以下方法:

  1. 在shell脚本中切换工作目录:在shell脚本的开头使用cd命令切换到特定的工作目录。例如,如果要切换到"/path/to/directory"目录,可以在shell脚本中添加以下命令:
代码语言:shell
复制
cd /path/to/directory

然后,在R中调用shell脚本时,会自动切换到指定的工作目录。

  1. 在R中使用setwd()函数切换工作目录:在R中,可以使用setwd()函数来切换工作目录。例如,如果要切换到"/path/to/directory"目录,可以在R中执行以下命令:
代码语言:R
复制
setwd("/path/to/directory")

然后,使用system()或system2()函数调用shell脚本时,R会在指定的工作目录中执行脚本。

需要注意的是,使用system()或system2()函数调用shell脚本时,应确保指定的工作目录存在,并且具有执行脚本的权限。

希望这个回答对您有帮助!如果您需要了解更多关于R、shell脚本或其他云计算相关的知识,请随时提问。

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