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R语言】因子在临床分组应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R因子(factor) 今天我们来结合具体例子给大家讲解一下因子在临床分组应用。 我们还是以TCGA数据CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据下载可以参考 ☞如何TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期四个组合并成两个组,并转换成因子 方法一、使用gsub函数 前面也给大家介绍过☞R替换函数...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾...参考资料: ☞【R语言】R因子(factor) ☞如何TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表

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【深度学习】R-CNNMask R-CNN思维跃迁

发现之前写R-CNN系列文章,侧重于结构设计层面的,比较零散,我写一个侧重于R-CNNMask R-CNN设计思路是如何演变,对R-CNN、Fast R-CNN、Faster R-CNN和Mask...现在看,先检测后分割思路似乎非常简单,但是在Mask R-CNN出现之前,实例分割大多数都是bottom-up思路,而Mask R-CNN是top-down思路,在当时如何在检测框架简洁优雅嵌入实例分割是很困难...从上图可以清清楚楚看出R-CNNMask R-CNN框架是如何演变。 可以分成两个支线看:训练流程和推理框架。...传统视觉深度学习,RGB简单直接应用CNN构造了R-CNN检测器,开启基于深度学习目标检测新时代;R-CNNFast R-CNN、Faster R-CNN通过实验观察和思考,发现问题,解决问题...(ps:R-CNN文章,看起来粗糙,实则干货满满;现在文章都一个模子刻出来一样,看起来精致,实则同质化严重) 最后,我想说是计算机视觉R-CNNMask R-CNN思维跃迁是我最爱看

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【疑惑】如何 Spark DataFrame 取出具体某一行?

如何 Spark DataFrame 取出具体某一行?...Koalas 不是真正 DataFrame」 确实可以运行,但却看到一句话,大意是数据会被放到一个分区来执行,这正是因为数据本身之间并不保证顺序,因此只能把数据收集一起,排序,再调用 shift。...我们可以明确一个前提:Spark DataFrame 是 RDD 扩展,限于其分布式与弹性内存特性,我们没法直接进行类似 df.iloc(r, c) 操作来取出其某一行。...1/3排序后select再collect collect 是将 DataFrame 转换为数组放到内存来。但是 Spark 处理数据一般都很大,直接转为数组,会爆内存。...给每一行加索引列,0开始计数,然后把矩阵转置,新列名就用索引列来做。 之后再取第 i 个数,就 df(i.toString) 就行。 这个方法似乎靠谱。

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Struts2JSON问题——后台返回JSON字符串前台

笔者目前仍是一名大二学生吗,后台框架完全是毫无任何基础,零学,现学现用。   由此贴出在前后台用JSON字符串进行前后台交互中所出现问题。...前台ExtJs不用多说直接在proxy代理里面写上Actionurl即可。最为关键则是在struts.xml配置文件。...由于再开完全不明白完全不懂,所以在struts.xml配置没有单独将json-default和struts-default写入两个package,而是直接写在了同一个package,和同伴百度无数仍然没有人给出详细办法...故试着直接传递对象(即struts.xml配置文件title),OK成功。简单粗暴。是否能将List直接传呢?类比ExtJs,应该是可以。OK果然成果。简单粗暴。   ...所以最为简单粗暴办法就是:在将从数据库得到数据放到对象过后,直接将对象传递,因为在json-default中会进行转换,后来发现先转成JSON字符再传递也是可以(会贴出源代码浅析,主要参考:http

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卷积神经网络在图像分割进化史:R-CNNMask R-CNN

作者在文章写道: 我们观察,Fast R- CNN网络里区域检测器所使用卷积特征图谱,也可用于生成区域建议,从而把区域建议运算量几乎降为0。...该模型输入和输出分别为: 输入:图像(不需要带有区域建议)。 输出:图像对象类别和边界框坐标。 如何生成区域 接下来我们来看下Faster R-CNN如何CNN特征中生成这些区域建议。...该边界框图像作为对象可能性用输出分值表示。 然后,我们只将每个可能是目标对象边界框传递Fast R-CNN,以实现对象分类和缩紧边界框。...到目前为止,我们已经了解如何能够以许多有趣方式使用CNN特征,来有效地用边界框定位图像不同对象。 我们可以进一步扩展这些技术,定位每个对象精确像素,而不是仅限于边框吗?...让我感到特别兴奋是,R-CNN网络进化Mask R-CNN网络,一共只用了三年时间。随着更多资金、更多关注和更多支持,计算机视觉在三年后会有怎样进展呢?让我们拭目以待。

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【Java 进阶篇】Java对象JSON:Jackson魔法之旅

在现代软件开发,处理数据能力是至关重要。而当我们谈及数据格式时,JSON(JavaScript Object Notation)通常是首选。...为了在Java轻松地将对象转换为JSON,我们需要一种强大而灵活工具。这时,Jackson就闪亮登场了。 前言 众所周知,Java是一种强类型语言,而JSON是一种弱类型数据交换格式。...这种类型之间不匹配可能使得在它们之间进行转换变得复杂。Jackson库通过提供丰富注解和灵活配置选项,使得Java对象JSON转换变得简单而高效。...Jackson是一个强大Java库,用于处理JSON格式数据。它提供了一组注解和一些核心类,使得在Java对象与JSON之间进行相互转换变得十分容易。...":"Alice","age":30},{"name":"Bob","age":28},{"name":"Charlie","age":35}]} Map转JSON 除了列表,有时我们还需要将Java

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异常处理:生活插曲代码挑战

异常:生活与代码无奈 2. 异常体系结构:错误与异常 3. 异常处理:抓取异常,保障稳定 3.1 throw 和 throws 3.2 try...catch 3.3 finally 4....自定义异常:灵活应对特定问题 结语 在人类日常生活和编程世界,异常都是无法绕过存在。...异常:生活与代码无奈 异常,顾名思义,就是一种与正常情况不符事件或情况。在生活,我们时常遇到各种异常,比如拉肚子、被狗咬等。...而在编程,异常则是指在程序执行过程遇到问题,如空指针、数组越界、类型转换异常等。就如同生活我们会感到不适,需要采取相应措施治疗,代码异常也需要得到妥善处理,以确保程序正常运行。 2....编译时异常:需要在代码编写阶段处理异常,例如IO异常等。 运行时异常:在程序运行过程可能发生异常,如空指针、数组越界等。 3.

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R语言入门精通:Day2-R和RStudio运行视频教程

本来想着R语言虽然重要,但是肯花心思学习的人可能还是少数,大家可要持之以恒哟。今天,我们就开始进入R语言入门精通》第二节:R和RStudio使用。...上节课程,我们讲解了R和RStudio安装,(错过朋友,可以直接点击这里 ? )R语言入门精通:Day1-R语言安装,本节内容我们来学习如何使用他们。...总之,在RRGui运行代码相对是比较简单,写一行命令直接回车即可。...如下图红框所示:点击软件左上方一个绿色+按钮,点击R Script即可新建一个R代码。 ? 而后,我们就进入这样一个界面布局当中,也是我们最常见布局: ?...我们发现,我们书写过代码,全部还都保存在代码编辑页面,如果我们想保存这个代码怎么办呢?很简单,如下图所示,点击File-Save,填上你要保存文件名即可(注意:R代码后缀名都是.R)。 ?

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深度 | 用于图像分割卷积神经网络:R-CNNMark R-CNN

如何生成区域 让我们花点时间看看 Faster R-CNN 如何 CNN 特征生成这些区域提案。...考虑这些锚点框,我们来看看区域提案网络输入和输出: 输入:CNN 特征图。 输出:每个锚点边界框。分值表征边界框图像作为目标的可能性。...当运行没有修改原始 Faster R-CNN 架构时,Mask R-CNN 作者意识 RoIPool 选择特征图区域与原始图像区域略不对齐。...想象一下,我们想要是与原始图像左上方 15x15 像素对应区域(见上文)。我们如何特征图选择这些像素? 我们知道原始图像每个像素对应于原始图像〜25/128 像素。...展望 在过去短短 3 年里,我们看到研究界如何 Krizhevsky 等人最初结果发展为 R-CNN,最后一路成为 Mask R-CNN 强大结果。

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TS 0 1 - TypeScript 各种符号

非空断言操作符会编译生成 JavaScript 代码移除,所以在实际使用过程,需要注意。 # 确定赋值断言 允许在实例属性或变量声明后面放置一个 !...可选链运算行为被局限在属性访问、调用以及元素访问——不会延伸到后续表达式。 # ?? 空值合并 ??...移除了可选属性 ?,使得属性可选变为必选。 # & 合并 在 TypeScript 交叉类型是将多个类型合并为一个类型。...# | 分隔 在 TypeScript 中联合类型表示取值可以为多种类型一种,联合类型使用 | 分隔每个类型。...Stranger"); } else { console.log(`Hello, ${name.toUpperCase()}`); } }; 字面量类型 // 用来约束取值只能是某几个值一个

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Androidactivity创建显示基本介绍

前言 说道AndroidActivity,如果你做过iOS开发的话,Activity类似于iOSViewController(视图控制器)。在应用能看到东西都是放在活动。...iOSViewController也是有自己生命周期,了解Activity或者ViewController生命周期是很有必要,本文将详细给大家介绍关于Androidactivity创建显示相关内容...Activity创建 Activity创建以及初始化过程是在ActivityThread#performLaunchActivity方法,在这个方法,有以下几个关键点, 创建Activity...方法,很关键一点就是初始化Window,从这里就能看到,Window实现类,是PhoneWindow。...方法,会进行初始化DecorView,并将我们设置布局加载到contentparent

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OCaml并行编程:线程协程

图片OCaml是一种函数式编程语言,它支持多种并行编程方式。本文将介绍OCaml几种并行编程方法,以及它们优缺点。...线程OCaml标准库Thread模块提供了基于操作系统线程支持,类似于CPythonthreading模块。...这意味着线程不能用来提高计算密集型任务性能,而只能用来实现并发。事件循环在OCaml 5.0.0之前版本,要写并行代码,可以使用第三方库,如Lwt和Async。...它们允许在单个线程执行多个协作任务,并且能够高效地管理I/O操作。这些库还提供了一些有用工具,如协作式多任务处理、异步I/O等。...子进程优点是可以充分利用多核处理器性能,但是缺点是需要处理进程间通信和同步问题,以及可能消耗更多资源和开销。协程在OCaml 5.0.0,OCaml引入了一个新多线程库,称为Fiber。

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R15R17,一文看懂5G技术创新

被寄予厚望5G,经历了诞生成熟发展历程,正在不断改变着我们工作和生活,也颠覆了整个社会运作模式。 那么问题来了,在5G不断演进过程,到底涌现了哪些革命性技术创新?...在这些技术创新背后,又潜藏着怎样逻辑思路?R15R17,各阶段作用,究竟是什么? 今天这篇文章,小枣君将带领大家找到答案。...R16在R15基础上,进一步完善了uRLLC和mMTC场景标准规范,从而贡献了第一个5G完整标准,也是第一个5G演进标准。 本质上来说,实现对垂直行业支持和赋能,是R16最重要使命。...我们还是频谱开始说起。 R17对5G毫米波进行了频谱扩展,定义了一个被称为FR2-2全新独特频率范围,将毫米波频谱上限,推高到了71 GHz。...█ 结语 曾经有人说,5GR15R17发展过程,就像一个盖房子过程: R15版本是5G技术标准“毛坯房”,搭建了基础和框架。

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妈妈再也不用担心我忘记pandas操作了

) # Excel文件导入数据 pd.read_sql(query, connection_object) # SQL表/库导入数据 pd.read_json(json_string) # JSON...() pd.DataFrame(dict) # 字典对象导入数据,Key是列名,Value是数据 导出数据: df.to_csv(filename) # 导出数据CSV文件 df.to_excel(...filename) # 导出数据Excel文件 df.to_sql(table_name, connection_object) # 导出数据SQL表 df.to_json(filename) #...以Json格式导出数据文本文件 创建测试对象: pd.DataFrame(np.random.rand(20,5)) # 创建20行5列随机数组成DataFrame对象 pd.Series(my_list...df.groupby(col1).agg(np.mean) # 返回按列col1分组所有列均值 data.apply(np.mean) # 对DataFrame每一列应用函数np.mean data.apply

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​迁移学习在NLP演化:基础前沿

,迁移学习在NLP任务应用也越来越广泛。...NLP应用。...这一步骤可以学习目标任务主要特征,且可以在相对较小目标训练集上完成。为了取得更好微调效果,作者分别采用分层微调和斜三角学习率策略,在目标任务数据集上得到语言模型参数。 分类器微调。...BERT BERT(Bidirectional Encoder Representation fromTransformers)模型将双向Transformer用于语言模型,传统模型是左向右输入一个文本序列...Next Sentence Prediction:即NSP问题,在BERT训练过程,模型接收成对句子作为输入,其中只有50%输入对在原始文档是前后对应关系,通过预测第二个句子是否在原始文档也是第一个句子后续语句

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Python0100(三):Python变量介绍

刚才我们提到过程序是指令集合,写程序就是将一系列指令按照某种方式组织一起,然后通过这些指令去控制计算机做我们想让它做事情。...,变量作用域是指变量可以被访问范围。...Python不同作用域: 全局作用域(global scope):定义在模块层次变量或函数,可以在模块任何地方被访问。...局部作用域(local scope):定义在函数或类方法变量,只能在函数或类方法中被访问。 在Python,变量作用域是由它所在代码块(block)决定。...可以通过访问该变量来获得Python内置函数列表。 package:这个变量包含当前模块包名,如果模块不在包,则该变量值为None。 删除变量 在Python删除变量可以使用del关键字。

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