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Sci. Adv. | 治疗性遗传靶点的全表型识别

今天为大家介绍的是来自Dimitrios Vitsios团队的一篇论文。人类基因组数据集的持续扩展推动了治疗靶点的识别,然而,从基因注释中提取基因-疾病关联仍然具有挑战性。在这里,作者介绍了Mantis-ML 2.0这一框架,它整合了阿斯利康的生物学洞察力知识图谱与多个表格数据集,评估了整个表型组的基因-疾病概率。作者使用图神经网络,捕捉图的整体结构,并在数百个平衡数据集上通过一个鲁棒的半监督学习框架进行训练,以提供人类外显子组的基因-疾病概率。Mantis-ML 2.0结合了自然语言处理,自动化数千种疾病的疾病相关特征选择。改进的模型展示了平均6.9%的分类能力提升,实现了在5220种来自人类表型本体、OpenTargets和英国基因组学的疾病上的中位接收者操作特征(ROC)曲线下面积(AUC)得分为0.90。值得注意的是,Mantis-ML 2.0优先考虑了来自独立的英国生物库表型广泛关联研究(PheWAS)的关联,提供了一种更强的分选方式,并减轻了PheWAS关联的不足。

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DNS 劫持恶意软件 Roaming Mantis 升级,针对全球 iOS、Android 和桌面用户

据外媒报道, 卡巴斯基实验室发现针对 Android 设备的路由器 的 DNS 劫持恶意软件 Roaming Mantis 现在已升级到了针对 iOS 设备以及桌面用户。最初该恶意软件被发现在上个月劫持了网络路由器,目的旨在散布窃取用户登录凭证和双重身份验证密码的 Android 银行恶意软件。而目前根据卡巴斯基实验室的安全研究人员的说法,通过增加针对 iOS 设备的钓鱼攻击以及针对 PC 用户的加密货币挖掘脚本,Roaming Mantis 活动背后的犯罪集团已经扩大了他们的目标。此外,尽管最初的袭击旨在针对来自东南亚的用户 ,但目前该新活动已经演变到支持 27 种语言,以扩大在欧洲和中东地区的业务范围。

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Jenkins Subversion Plugin与本地Subversion Command不兼容

使用Jenkins时Jenkins Subversion Plugin与本地Subversion Command不兼容 1、使用场景 在使用jenkins时,先使用Jenkins Subversion Plugin执行checkout或update操作,然后经过一些列操作后在batch命令行调用svn update命令行 2、错误详情 在batch命令行调用svn update命令行时,出现如下错误: svn: E155036: Please see the 'svn upgrade' command svn: E155036: The working copy at 'xxx' is too old (format 8) to work with client version '1.8.10 (r1615264)' (expects format 31). You need to upgrade the working copy first. 3、软件环境 Jenkins ver. 1.592 TortoiseSVN 1.8.8(Subversion 1.8.10,安装TortoiseSVN同时安装了Subversion Command) Jenkins Subversion Plugin 1.54(Jenkins ver. 1.592自带) 4、错误分析 错误很明显,是Jenkins Subversion Plugin与本地Subversion Command不兼容 Jenkins Subversion Plugin 1.54不支持svn 1.8,主要表现在不支持1.8版本的working copy 5、解决问题 只要让TortoiseSVN和Jenkins Subversion Plugin支持的svn版本保持一致即可解决问题 或者降低TortoiseSVN的版本,或者升级Jenkins Subversion Plugin到支持svn 1.8的版本,或者只用其中某一个 (1)降低TortoiseSVN的版本 如果降低TortoiseSVN的版本,应该将其降为1.7还是1.6呢? 先看看Jenkins Subversion Plugin 1.54是基于1.6还是1.7开发的。 通过查看Jenkins Subversion Plugin 1.54的源码(https://github.com/jenkinsci/subversion-plugin/releases/tag/subversion-1.54) 在pom.xml中看到svnkit相关的dependency信息如下: <dependency>            <groupId>org.jenkins-ci.svnkit</groupId>            <artifactId>svnkit</artifactId>            <version>1.7.10-jenkins-1</version> </dependency> 从中得出,SVNKIT的版本是1.7.10 在SVNKIT官网相关页面(http://svnkit.com/download.php)得知: SVNKit 1.8.7 is compatible both with Subversion 1.8 and Subversion 1.7 working copy formats. No upgrade is required for working copies in 1.7 format. SVNKit 1.7.13 is NOT compatible with Subversion 1.8 working copy format. It is compatible with Subversion 1.8 servers. Both SVNKit 1.7.13 and 1.8.7 support 1.6 and older working copy formats without need to upgrade. 查看SVNKIT1.7.13的changelog(http://svn.svnkit.com/repos/svnkit/tags/1.7.13/CHANGES.txt) 可以看出SVNKIT从1.7.8版本开始支持svn 1.6,SVNKIT1.7.10应该既支持svn 1.7又支持svn1.6。

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