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Day5生信入门——数据结构(!选修!直接使用数据框中的变量!没学!!)

显示工作路径 getwd() 向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。 表格在R语言中叫数据框 要理解其中的命令、函数的意思!...标量和向量的区分: 元素指的是数字或者字符串(用chr表示)等,根据它可以区分两个词: 1)标量:一个元素组成的变量 2)向量:多个元素组成的变量 图片赋值就是赋予这个变量一个数值(其实也不一定是数值,...用以下命令即可获得示例数据框:X<-read.csv('doudou.txt') 图片 2)设置行名和列名 X在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量...#再次使用RData时的加载命令 5)提取元素 X[x,y]#第x行第y列 X[x,]#第x行 X[,y]#第y列 -X[y] #也是第y列 X[a:b]#第a列到第b列 X[c(a,b)]#第a列和第...b列 X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)6)直接使用数据框中的变量!!!!!!

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这3个Seaborn函数可以搞定90%的可视化任务

我们可以使用displot函数创建直方图,kde图,ecdf图和rugplots。 直方图将数值变量的取值范围划分为离散的容器,并计算每个容器中的数据点(即行)的数量。...Catplot 使用catplot函数创建分类图,如箱形图、条形图、带状图、小提琴图等。总共有8个不同的分类图可以使用catplot函数生成。 箱形图用中位数和四分位数表示变量的分布。...“width”参数调整框的宽度。 以下是箱形图的结构: ? 中位数是所有点都排序后的中间点。Q1(第一或下四分位数)是下半部分的中位数,Q3(第三或上四分位数)是上半部分的中位数。...我们还可以创建一个条形图来检查不同产品线的单价。与使用方框不同,条形图用一个点表示每个数据点。因此,它就像数字和分类变量的散点图。 让我们为branch和total列创建一个条形图。...catplot功能下的另一种类型是小提琴图。这是一种plto和kde的组合。因此,它提供了一个变量分布的概述。 例如,我们可以为前面示例中的strip plot所使用的列创建小提琴图。

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    天天Get 新技能!!

    箱线图 箱线图(又称为盒须图)通过绘制连续型变量的五数总括,即最小数、下四分位数、中位数(第50百分数)、上四分位数(第75百分数)以及最大值,描述了连续型变量的分布。...并列箱线图进行跨组比较: 箱线图可以展示单个变量或分组变量,使用格式; boxplot(formula,data=dataframe) 其中formula是公式,dataframe是代表数据的数据框,...小提琴图基本上是核密度图以镜像方式在箱线图上的添加。在图中,白点是中位数,黑色盒型的范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须,外部形状即核密度估计。...可以使用dotchart()函数创建点图,格式为: dotchart(x,laberls=) 其中的x是一个数值向量,而labels是由每个点的标签组成的向量。...一个字符型向量(color)被添加到到了数据框 x中,根据cyl的值,它所含的值为"red"、"blue"或"darkgreen“,此外,各数据点的标签取自数据框的行名(车辆型号),数据点根据气缸数量进行分组

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    R语言之数值型描述分析

    在分析之前,先将数据集 birthwt 中的分类变量 low、race、smoke、ht 和 ui 转换成因子。...对于数值型变量,如 age、lwt、plt、ftv 和 bwt,函数 summary( )给出最小值、下四分位数、中位数、均值、上四分位数和最大值;对于分类变量,如 low、race、smoke、ht...epiDisplay 包的函数 summ( )作用于数据框可以得到另一种格式的汇总输出,它将变量按行排列,把最小值和最大值放在最后两列以方便查看数据的全距。...( )同时计算数据框中多个变量的指定统计量。...例如,计算数据框 cont.vars 中各个变量的样本标准差: sapply(cont.vars, sd) 基本包中没有提供计算偏度和峰度的函数,我们可以根据公式自己计算,也可以调用其他包里的函数计算,

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    在Python中进行探索式数据分析(EDA)

    以上结果表明,许多变量(例如发动机燃料类型,发动机HP,发动机汽缸,门数和市场类型)在数据中缺少值。 我们可以通过另一种方法检查数据类型: ? 打印数据集的列 ?...由于列的名称很长,让我们重命名它们。 重命名列 ? 删除列 ? 删除数据框不需要的列。数据中的所有列不一定都相关。在这个数据中,受欢迎程度、门的数量、车辆大小等列不太相关。...所以从数据集中删除这些变量。 缺失值: ? 上述结果表明,在12个变量中,Fuel_type、HP和cylinder这3个变量有缺失值。 让我们检查一下列中缺失数据的百分比 ?...我们将使用matplotlib和seaborn一起可视化一些变量 直方图(分布图) 直方图用于显示数值变量的形状和分布。对于类别变量,它显示变量中存在的类别计数。 ? ?...箱线图使用四分位数描述变量分布。它也被称为盒须图。 ? ? ? 以上所有箱线图显示,price和c_mpg变量中存在许多异常值。在Cylinders变量中,只有4个观测值是异常值。

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    R in action读书笔记(4)-第六章:基本图形(下)

    6.4核密度图 核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数的一种非参数方法。绘制密度图的方法(不叠加到另一幅图上方)为: plot(density(x)) 其中的x是一个数值型向量。...6.5箱线图 箱线图(又称盒须图)通过绘制连续型变量的五数总括,即最小值、下四分位数(第25百分 位数)、中位数(第50百分位数)、上四分位数(第75百分位数)以及最大值,描述了连续型变量 的分布。...箱线图能够显示出可能为离群点(范围±1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,即上 四分位数与下四分位数的差值)的观测。...使用格式为: boxplot(formula,data=data framel) 其中的formula是一个公式,dataframe代表提供数据的数据框(或列表)。...你可以使用dotchart()函数创建点图,格式为:dotchart(x,labels=)其中的x是一个数值向量,而labels则是由每个点的标签组成的向量。

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    Tableau基础知识1.文件与数据1.1 Tableau文件类型2.制表3.绘图

    :数值、日期、字符、逻辑 字符型变量:别名、数值拆分 数值型变量:数值分段(创建级) 创建:新变量(创建计算字段)、数据组 隐藏数据列 1.3 重复测量数据的记录方式 宽型:每一个个体被记录为一个Case...代表所有度量变量的集合 度量:对应连续变量,在图表中呈现为原始信息或汇总信息 数值变量默认设为度量 强行将字符串变量拖动为度量 记录数:代表符合筛选条件的案例数量 度量值:代表相应度量的汇总数值,常与度量名称联合使用...3.3 单个-数值变量 直方图 对数值进行分组频数汇总,呈现整个取值区间上的数据分布特征。 Tableau是通过对原始数据生成分段变量(数据图)来实现。 箱图 使用百分位数体系刻画整个取值区间。...箱体最中间的粗线为P50(中位数),方框上下界为P75和P25(四分位数)。 数据用散点的方式表示。...与四分位数(即方框上下界)的距离超过1.5倍四分位间距(即方框长度)的都会被定义为离群值,相应的界限在图中以线段表示。 所有数值均未超界时,该线段就是最大/最小值。

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    「R」R 的基本图形绘制

    数据已经包含在随vcd包分发的Arthritis数据框中。...在关节研究中,变量Improved记录了对每位接受了安慰剂或药物治疗的病人的治疗结果: > library(vcd) 载入需要的程辑包:grid > library(grid) > counts <-...(所以在此也不详述了) 饼图可以由下面函数创建: pie(x, labels) 直方图 直方图展示了连续型变量的分布。可以使用如下函数创建直方图: hist(x) x是一个由数据值组成的数值向量。...它通过绘制连续变量的五数总括——最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值来描述连续型变量的分布。...箱线图能够显示出可能为离群点的观测(范围正负1.5*IQR以外的值,IQR表示四分位距,上四分位数与下四分位数之间的差值)。

    1.6K30

    spss logistic回归分析结果如何分析

    在“分类”对话框中,因为性别为二分类变量,因此将其选入分类协变量中,参考类别为在分析中是以最小数值“0(第一个)”作为参考,还是将最大数值“1(最后一个)”作为参考,这里我们选择第一个“0”作为参考。...在“存放”选项框中是指将不将数据输出到编辑显示区中。...打如图2-1开频率对话框。将我们要分析的数值变量Apoba1选入到变量对话框中。 选择统计量,按照图2-2中勾选四分位数选项,其他选项按照自己需要勾选,然后点击图2-1中的确定按钮,开始运算。...在图2-3中可以读取我们的四分位数 值。图中百分数表示的是对该变量做的四分位数的百分比,25表示前25%的,50表示前50%的,75表示前75%的。...如图2-5所示,在”因变量”中选入刚才我们输入的四分位数分类变量,在因子中输入分类变量ICAS(这里一定是分类变量,可以是一个也可以是多个),在“协变量”中输入数值变量如年龄(这里一定是数值变量, 可以是一个也可以是多个

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    科研绘图你值得注意的14个点 (1)

    即使基础数据相似,小样本量时分布和四分位数也可能有显著差异。分布和四分位数只有在样本量较大时才具有实际意义。我曾进行过一项实验,多次从同一个正态分布中抽取样本,并计算每个样本的四分位数。...我发现只有当样本量超过50时,四分位数才会趋于稳定。 3. 对单向数据采用双向色阶 这是一种真正的数据可视化误区,而且这种情况相当普遍。 颜色渐变看起来很美观,但我们在使用时需要格外谨慎。...但是,为了让热图发挥其作用,我们必须考虑行和列的排序问题。 5. 在未考虑行和列重排的情况下创建热图 热图在科学出版物中十分普遍,在组学领域的论文里尤其如此。...但至少考虑对行和列进行重排是一个非常好的做法。 6. 未审视异常值的情况下创建热图 热图中的异常值可能会极大地影响我们对可视化的理解和解释。这一点在所有使用颜色来展示数值数据的图表中都是通用的。...在多因素实验中,响应变量的范围在不同因素层面之间有时会有显著变化。 这个假设性实验在两个组别(对照组与实验组)中测量了3种化合物。

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    R语言实战.3

    它显示了连续型变量age的最小值、最大值、均值和各四分位数,并显示了类别型变量diabetes和status(各水平)的频数值。 列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。...具体步骤如下: (1) 创建一个空数据框(或矩阵),其中变量名和变量的模式需与理想中的最终数据集一致; (2) 针对这个数据对象调用文本编辑器,输入你的数据,并将结果保存回此数据对象中。...在下例中,你将创建一个名为mydata的数据框,它含有三个变量:age(数值型)、gender(字符型)和weight(数值型)。然后你将调用文本编辑器,键入数据,最后保存结果。 ? ? ?...如果你不将其赋值到一个目标,你的所有修改将会全部丢失! 在Windows上调用函数edit()的结果如图我已经自主添加了一些数据。单击列的标题,你就可以用编辑器修改变量名和变量类型(数值型、字符型)。...你还可以通过单击未使用列的标题来添加新的变量。编辑器关闭后,结果会保存到之前赋值的对象中(本例中为mydata)。

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    R语言入门系列之二

    R有很多内置的示例数据集包括向量、矩阵数据框等,可以使用data()进行查看,接下来我们以R内置数据mtcars(32辆汽车在11个指标上的数据)为例进行分析,如下所示: ⑴内容添加与修改 ①添加修改新变量...函数transform()可以在数据框中创建新变量,并使用其他变量进行赋值,如下所示: mydata=transform(mtcars, sums=gear+carb,...: 缺失值是无法进行比较运算的,很多函数都有参数na.rm选项来移除缺失值,如下所示: 可以使用函数na.omit()来移除变量中缺失值或矩阵、数据框含有缺失值的行,如下所示: ②日期值 在R中,...Cyl", ylab="Mpg") 箱型图中箱子的上下界分别为25%值和75%值(也即第一四分位数和第三四分位数),中间粗横线为中位数,触须伸出箱子的最大长度可以通过range参数来设置,默认为1.5...倍箱子高度(四分位数间距),设置add=T可以讲箱形图绘制在当前图像上。

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    带你和Python与R一起玩转数据科学: 探索性数据分析(附代码)

    通过这种方法,如果我们要得到第一列,Afghanistan的相关数据,我们该这样做: ? 有个窍门可以通过列名访问数据,那就是将原始数据框中的列名和which()方法一起使用。...记住,默认的,apply作用于列数据(在我们的例子里是国家列),而我们希望它作用于每一年。如此这样,我们需要在使用数据框之前颠倒它的行列位置,或传入参数axis=1。 ? ? 但是这样做过分简单了。...R 我们已经了解到在R中我们可以用max函数作用于数据框的列上以得到列的最大值。额外的,我们还可以用which.max来得到最大值的位置(等同于在Pandas中使用argmax)。...再一次我们可以在图上看到有三部分走势,开始部分缓慢地上升,接下来第二部分上升走势,最后一个尖起的峰值明显地不同于其它部分。 这次让我们跳过1.5倍的四分位间距部分,直接来到5倍四分位间距。...在R语言中,我们要采用不同的方法。我们将使用函数quantile()来得到四分位间距从而判断离群值的临界值。

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    天意R笔记|新手必须掌握的R语言基础

    在统计分析和可视化过程中,因子是非常重要的工具,确保分类变量在模型构建、假设检验(如卡方检验)以及各种回归分析和方差分析中得到正确处理。...使用 list() 函数可以创建列表,列表中的每个元素都可以独立访问和修改。例如,可以创建一个包含字符串、数值向量和逻辑矩阵的列表,这种结构有助于管理和操作多组不同性质的数据。...(六)数据框 数据框(data frame)是R语言中特别常用的数据结构,用于存储表格形式的数据。数据框中的每一列代表一个变量,可以是不同的数据类型(如数值、字符或逻辑值),每一行表示一个观测值。...数据框可以通过 data.frame() 函数创建,各列的长度必须相同。数据框类似于电子表格,是进行统计分析和数据可视化的基础工具,能够灵活处理包含不同类型变量的数据集。...对于向量,输出包括最小值、四分位数、中位数、均值和最大值等。例如,使用 summary(data) 可以查看向量data的相关统计指标。

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    Python数据分析之数据预处理(数据清洗、数据合并、数据重塑、数据转换)学习笔记

    数值几乎全部集中在(μ-3σ,μ+3σ)]区间内,超出这个范围的可能性仅占不到0.3%.所以,凡是误差超过这个区间的就属于异常值,应予以剔除  def three_sidma(ser):# ser 为数据的列...(1)QL称为下四分位数,表示全部观察中四分之一的数据取值比它小 ​ (2)QU称为上四分位数,表示全部观察值中有四分之一的数据取值比它大 ​ (3)IQR称为四分位数间距,是上四分位数0与下四分位数则之差...例如,通过爬虫采集到的数据都是整型的数据,在使用数据时希望保留两位小数点,这时就需要将数据的类型转换成浮点型。  ​...columns:用于创建新 DataFrame对象的列索引 values:用于填充新 DataFrame对象中的值。  4....','青年','中年','中老年','老年']) 4.3 哑变量处理类别型数据  在Pandas中,可以使用get_dummies()函数对类别特征进行哑变量处理.  4.3.1 get_dummies

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    day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot()

    :所有企鹅的属性观察值:单个企鹅的所有属性tibbles:tidyverse的特殊数据框查看数据框:glimpse(penguins)(Console输出)View(penguins)(R自带交互框)palmerpenguins...::penguinglimpse(penguins)View(penguins)开始可视化使用ggplot()第一个参数:在图形中使用的数据集第二个参数:mapping:如何将数据集中的变量映射到绘图的视觉属性...,在aes()中定义使用geom_形状()定义一个几何图形,表示数据的几何对象形状:bar-条形图;line-折线图;boxplot-箱线图;point-点对于有缺失值的数据,散点图内没有显示,但有报错...&分类变量箱线图——一种用于描述分布的位置度量(百分位数)的视觉速记,也能识别潜在的异常值框上下界之间距离称为四分位距 (IQR),从分布的第 25 个百分位数延伸到第 75 个百分位数;中位数,框中间的一条线...)第二个图是通过在几何中设置 position = "fill" 创建的相对频率图,对于比较岛屿之间的物种分布更有用,因为它不受岛屿上企鹅数量不相等的影响。

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    matlab

    [num,txt,raw] = xlsread(___) 还使用先前语法中的任何输入参数,在元胞数组 txt 中返回文本字段,在元胞数组 raw 中返回数值数据和文本数据。...xlsread 函数在元胞数组 txt 中返回文本字段、在元胞数组 raw 中返回数值和文本数据,并在数组 custom 中返回 processFcn 的第二个输出。...箱子的上下底,分别是数据的上四分位数(Q3)和下四分位数(Q1),这意味着箱体包含了50%的数据。因此,箱子的高度在一定程度上反映了数据的波动程度。...上下边缘则代表了该组数据的最大值和最小值(忽略掉异常值)。有时候箱子外部会有一些点,可以理解为数据中的“异常值”。四分位数一组数据按照从小到大顺序排列后,把该组数据四等分的数,称为四分位数。...第一四分位数 (Q1)、第二四分位数 (Q2,也叫“中位数”)和第三四分位数 (Q3)分别等于该样本中所有数值由小到大排列后第25%、第50%和第75%的数字。

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    评分卡模型开发-用户数据异常值处理

    异常值是指明显偏离大多数抽样数据的数值,比如个人客户的年龄大于100时,通常认为该值为异常值。找出样本总体中的异常值,通常采用离群值检测的方法。...(1)第一种方法是单变量离群值检测,该方法的原理是通过求解单变量数值的第1个和第3个四分位数的值,将数值小于第1个四分位数和大于第3个四分位数的值定义为离群值。...图3.1 箱图表示的异常值 上述单变量离群值检测方法也可简单地应用到多变量的数据集上。下例中,我们简单地将该方法扩展到在二维数据框中检测离群值。...我们先分别在两列数据上进行离群值检测,再从检测出的离群值中抽取重叠的部分作为二位数据框的离群值点,在如3.2中用“+”表示离群值点。...图3.2 二维数据框的离群值检测结果 当然,我们可将变量x和y的离群值都作为整个数据框的离群值,如图3.3所示,离群值用“*”表示。

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