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    初试MongoDB学习之Mongoose的使用

    #Mongoose的优势 可以像操作对象一样操作数据库 可以为文档创建一个模式结构(Schema) 可以对模型中的文档/文档进行验证 数据可以通过类型转换为对象模型 可以使用中间件来应用业务逻辑挂钩 比...Node原生的MongoDB驱动更容易 #使用Mongoose 下载安装mongoose模块 cnpm install mongoose --save 引用mongoose: var mongoose...=require("mongoose"); 使用"mongoose"连接数据库: var db =mongoose.connect("mongodb://user:pass@localhost:port...}) #mongoose基本使用 #mongoose的几个新的对象 在MongoDB中,多个Document可以组成Collection(以下简称集合),多个集合又可以组成数据库。...集合 —— 由一组文档组成,如果将MongoDB中的一个文档比喻成关系型数据库中的一行,那么一个集合就相当于一张表。

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    mongoose 更新修改数据: findOneAndUpdate 的使用

    mongoose的更新数据操作: findOneAndUpdate 前言 正文 基本语法 示例 结束语 前言 在使用mongoose操作mongodb数据库时,会遇到最基本的增删改查这四个额操作,相比起来这四个操作里..., ’ 改 ’ 这个操作是最复杂的,我也用花了点时间研究了一下 findOneAndUpdate 的简单使用,接下来给大家讲解一下。...所以我们在set中设置了将我们查询到的数据的price改为10 第三个参数options,因为简单使用没用到,我就只给了个空对象 第四个参数callback, if(err) 是用于判断数据库是否发生错误...} 再查看一下数据库里的数据 可以看到数据库里的香蕉的price已经被改为10了 //假设这是我们数据库里的数据 [ goods: [ { name: '苹果', price: 5...好了 mongoose中修改数据的操作命令 findOneAndUpdate 的简单使用 就是如此,希望对大家有所帮助。

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    snakemake杂记:多个转录组比对到多个基因组得到多个bam文件然后合并

    我的需求是: 我有10个基因组,然后又12个转录组数据,然后将这个12个基因组数据分别比对到这个10个基因组,每个基因组得到12个bam文件,然后将每个基因组的12个bam文件合并 ,最终得到10个合并的...resources: mem_mb = 24000 shell: """ samtools index {input} """ 到合并的步骤最开始的写法是...64000 shell: """ samtools merge -@ {threads} {output} {input.bams} """ 这样写的问题是合并的时候每个基因组对应的是...推文记录的是自己的学习笔记,内容可能会存在错误,请大家批判着看,欢迎大家指出其中的错误 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子...;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记!

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    mongoose、koa2和redis的简单安装使用

    mongoose的介绍及使用 参考之前文章:点击这里 koa2简介 Koa 是一个新的 web 框架,由 Express 幕后的原班人马打造, 致力于成为 web 应用和 API 开发领域中的一个更小、...mongoose、koa2、redis综合案例 源代码:案例可以供参考 链接:https://pan.baidu.com/s/1IT2l-uKz7ECuUR21vUcLyw 提取码:c7xs...说明该页面被访问了20次 案例中使用mongodb数据库,koa2基本框架实现了对数据库的增删改查操作,使用redis实现了简单页面访问次数统计 测试接口的方法 使用shell操作的curl -d...命令 * 前提是使用shell操作:可以使用git的git bash here curl -d 'name=kt&age=20' http://localhost:3000/users/addPerson...:how9 postman的简单使用:参考地址

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    使用Mongoose的populate方法实现多表关联查询

    MongoDB在3.2以上的版本有类似于 join 的 $lookup 聚合操作符,其实 Mongoose 有一个更强大的替代方法,叫做populate ( ),它允许你在其他集合中引用文档,实现更简洁优雅的查询操作...定义文章分类的schema生成模型导出,文件名 aritcleCate.js // 引入自定义的数据库连接文件 var mongoose=require('....定义用户的schema生成模型导出,文件名 user.js // 引入自定义的数据库连接文件 var mongoose = require('....定义文章的 schema 生成模型导出,文件名 article.js 通过给 schema 中的关联字段添加 ref 与指定的模型建立关联 // 引入自定义的数据库连接文件 var mongoose =...执行查询操作 // 注意使用 populate 需要引入用到的 model var ArticleCateModel=require('.

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    使用scran包的MNN算法来去除多个单细胞转录组数据批次效应

    多个样本单细胞转录组数据整合算法以 mutual nearest neighbors (MNNs)和canonical correlation analysis (CCA) 最为出名,见 详细介绍多个单细胞转录组样本的数据整合之.../release/bioc/vignettes/scran/inst/doc/scran.html 首先模拟一个表达矩阵 这里简单的R矩阵使用scran包的SingleCellExperiment函数即可构建...不过本例子只使用了数据集的4种细胞类型而已,因为 scRNAseq 这个R包就提供了这些,完整的数据是 23730 features, 301 samples, 地址为https://hemberg-lab.github.io...上图中的NPC细胞,使用+表示的那些点,可以看到不同颜色的左右分很开,仅仅是因为他们的文库测序大小不一样。...在我们的全网第一个单细胞基础课程里面有介绍到,看笔记: 单细胞转录组学习笔记-1 单细胞转录组学习笔记-2 单细胞转录组上游分析之shell回顾 获取Github代码包以及准备工作 常说的表达矩阵,那得到之后呢

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    使用Seurat的v5来读取多个10x的单细胞转录组矩阵

    它虽然说是多样品,但是被作者整理成为了一个10x的样品的3文件格式, 所以很容易读取。接下来我们演示真正的Seurat的v5来读取多个10x的单细胞转录组矩阵。...Seurat流程做出来了大量的公共数据集的单细胞转录组降维聚类分群流程,100多个公共单细胞数据集全部的处理,链接:https://pan.baidu.com/s/1MzfqW07P9ZqEA_URQ6rLbA...pwd=3heo但是最近其官方版本成为了V5…… 因为现在是Seurat的V5版本,多个文件如果是分开读取后的merge函数其实并没有把每个样品的表达量矩阵merge,如下所示: 可以看到,在Seurat...Expecting barcodes.tsv.gz 这个 Read10X 函数能够接受一个或者多个合理的路径,合理的路径就是说里面有10X文件的3个标准文件,是不是很简单啊?...后面我们还会演示如何读取多个单细胞转录组样品,但是这些样品的矩阵并不是10x的3文件格式,所以会更麻烦一点!

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    Nodejs和Mongodb的连接器Mongoose

    MongoDB是一个开源的NoSQL数据库,相比MySQL那样的关系型数据库,它更显得轻巧、灵活,非常适合在数据规模很大、事务性不强的场合下使用。...使用"mongoose"连接数据库:  var db = mongoose.connect("mongodb://user:pass@localhost:port/database"); 4....在MongoDB中,多个Document可以组成Collection(以下简称集合),多个集合又可以组成数据库。...集合 —— 由一组文档组成,如果将MongoDB中的一个文档比喻成关系型数据库中的一行,那么一个集合就相当于一张表。...拥有了Model,我们也就拥有了操作数据库的金钥匙,在后面的内容中,我们就会学习使用Model来进行增删改查的具体操作,所以,一定要熟悉他的创建格式哟!

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    如何使用Mongoose创建一个数据处理的模块

    比如,在没有使用 Mongoose 的情况下,可能会在数据库中存储各种格式不一致的用户数据,而使用 Mongoose 后,所有用户数据都必须符合预定义的 Schema 结构,保证了数据的一致性。...一、使用 Mongoose 相比直接使用 MongoDB 的好处Mongoose官网Mongodb官网1、提供结构化的数据模型:定义数据结构:Mongoose 通过 Schema 定义数据结构,包括数据类型...这使得数据存储更加规范,避免了数据的随意性和混乱。数据验证:同时Mongoose 内置了丰富的数据验证功能,可以确保数据在保存到数据库前符合预期格式。...3、支持异步操作Promise 支持:Mongoose 的操作方法返回 Promise 对象,方便使用 async/await 语法进行异步操作。避免了回调地狱问题,提高了代码的可维护性。...二、如何使用Mongoose创建一个数据处理模块1、 安装 Mongoose在 Node.js 项目中,首先需要安装Mongoose。

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