使用QICharts的grid.arrange - 腾讯云开发者社区

本文的主要目的有两个一个是学习如何在R中绘制帕累托图，另一个是如何绘制双坐标图，其中前三个例子是用绘制双坐标的方式绘制帕累托图的，其余为直接生成的帕累托图 @ 不用包 par(mar=c(5,5,4,5...@ qicharts包 library(qicharts) x <- rep(LETTERS[1:9], c(256, 128, 64, 32, 16, 8, 4, 2, 1)) paretochart

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97-R可视化26-底层绘图系统grid学习之拓展包gridExtra

Software Development in R (bookdown.org)[1] R实战：grid包 - 悦光阴 - 博客园 (cnblogs.com)[2] (11条消息) R语言grid包使用笔记...gridExtra 拓展就比较方便了，可以自动的调配区域： grid.arrange(linesGrob(), circleGrob(), roundrectGrob(), segmentsGrob...(), ncol = 2) 不过需要注意的是，grid.arrange函数在调用的时候会重新开启一个新的画布。...+ p2 + p3 + p4 类似的，在grid.arrange 里，你可以通过参数layout_matrix 进行调配： grid.arrange(rectGrob(), circleGrob(...实战：grid包 - 悦光阴 - 博客园 (cnblogs.com): https://www.cnblogs.com/ljhdo/p/4874785.html [3] (11条消息) R语言grid包使用笔记

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R语言实现SCI级别颜色搭配

depth, fill = cut)) +geom_histogram(colour= "black", binwidth = 1, position = "dodge") +theme_bw() grid.arrange...以NPG为例，我们直接看实例： p1_npg = p1 + scale_color_npg() p2_npg = p2 + scale_fill_npg() grid.arrange(p1_npg,...tron = p2 + theme_dark() + theme(panel.background= element_rect(fill = "#2D2D2D")) +scale_fill_tron() grid.arrange...reverse= TRUE)#可以实现颜色的颠倒 grid.arrange(p3_gsea, p3_gsea_inv, ncol =2) ?...当然我们也可以使用Material Design模板中19种颜色的过度，我们随便取其一种看下实例： p3+ scale_fill_material("blue") ?

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ggsci | 让你的配色Nature化

ggsci ggsci提供了一系列高质量的调色板，其灵感来自于期刊、电影等。ggsci中的调色板可用于ggplot2。...ggsci中的调色板。...JCO 创：战纪(Tron Legacy) 比较适用于使用黑暗主题。...Continuous Color Palettes GSEA GSEA调色板的灵感来自GSEA GenePattern生成的热图。...mypal 总结下表总结了所有可用的调色板。

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R可视化 | 混合多个图形

respect 参数控制着各图形内的横纵轴刻度长度的比例尺是否一样。 n 参数为欲显示的区域的序号。生成2行2列的版面，并设置宽度和高度。...gridExtra包—grid.arrange() gridExtra包让混合多个图片变得轻而易举。它提供了grid.arrange() 函数来完成这个任务。它的nrow参数允许指定如何安排布局。...，然后用grid.arrange()将各个变量名称展现出来。...当然可以使用参数arrangeGrob(),下面绘制了两行，第一行是g2，第二行是g3，g4. grid.arrange(g2, arrangeGrob(g3, g4, ncol=2), nrow =...下面绘制了两行，第一行是g2，第二行是g3，g4，g1. grid.arrange(g2, arrangeGrob(g3, g4, g1,ncol=3), nrow = 2) ?

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可视化绘制技巧｜对多图合理排版布局

包括： gridExtra包中的grid.arrange()。 cowplot包中的plot_grid()。...关键函数则是：grid.arrange()。下面的代码使用了grid.arrange函数来合并上文的三幅函数加上下面的代码新绘制的一幅直方图，如图3所示。...图4 合并多幅图形上面的代码在使用grid.arrange函数合并图形的时候，使用arrangeGrob函数首先将dp和brp这两幅图合并在一起，然后再和bxp图形合并在一起。...另外你，使用grid.arrange函数的layout_matrix参数同样可以进行这样的设置，如图5所示。...图5 合并多幅图形上面的代码将使用了grid.arrange函数合并四幅图形。参数ncol=2和nrow =2 表示将整个图形分成四个部分。

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ggplot2扩展

only marginal plot for x axis p3 <- ggMarginal(p, margins = 'x', color="purple", size=4) p3 使用...(g2, arrangeGrob(g3, g4, ncol=2), nrow = 2) grid.arrange(g1, g2, g3, nrow = 3) grid.arrange(g2, arrangeGrob...(g3, g4, ncol=2), nrow = 1) grid.arrange(g2, arrangeGrob(g3, g4, nrow=2), nrow = 1) 利用 gridExtra...写在最后：有时间我们会努力更新的。大家互动交流可以前去论坛，地址在下面，复制去浏览器即可访问，弥补下公众号没有留言功能的缺憾。...bioinfoer.com 有些板块也可以预设为大家日常趣事的分享等，欢迎大家来提建议。

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scRNA分析 | 定制美化FeaturePlot 图，你需要的都在这

，lengend等（5）批量绘制一载入R包，数据仍然使用之前注释过的sce.anno.RData数据，后台回复 anno 即可获取 library(Seurat) library(tidyverse...二 FeaturePlot 相关 1，调整FeaturePlot颜色，大小（1）Seurat 修改有以下几种方式，可以使用FeaturePlot 内置的cols参数进行修改（p2 , p3），也可以使用...如果想实现多个基因的话，将目标基因和UMAP 的坐标提取出来使用ggplot2绘制即可或者使用scCustomize 包中的多基因联合密度图，如下。...方式绘制 grid.arrange接受的是list ，可以通过 layout_matrix 调整布局。...(grobs = plot_list, layout_matrix = lay) 因为单细胞的FeaturePlot的都是样的，看不出来grid.arrange的优势，后面会介绍空转中使用该函数通过布局

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R语言ggmap空间可视化机动车交通事故地图

p=12350 ---- 在本文中，我使用ggmap可视化纽约市的交通事故。数据来自纽约市开放数据。我的数据范围是2012年至2015年。...我还解析日期变量以创建年份变量，并使用该变量创建两个数据集：一个数据集包含2013年的所有车辆事故，另一个数据集包含2014年的所有车辆事故。...我使用stat_density2d（）向该地图添加了一个二维密度层。我对2013年和2014年的数据都执行此操作，并使用gridExtra的grid.arrange（）并排放置地图。...ny_plot=ggmap(get_map('New York, New York',zoom=12, maptype='terrain'))grid.arrange(plot1, plot2,nrow...我使用stat_density2d的group参数以不同的颜色分别绘制每个自治市镇的密度层。

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R 语言柱状图示例笔记

由于微信不允许外部链接，你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文"，才能访问文章中链接。一、基础柱状图 1. barplot 命令基于barplot基础柱状图颜色、方向及分组的绘图示例。...Number of Gears", col=c("darkblue","red"),legend = rownames(counts2),beside=TRUE) 2. ggplot2 包绘制柱状图使用...ggplot2包的柱状图颜色、方向及分组的绘图示例。...x=cyl,fill=cyl)) + geom_bar(stat="count") + theme_bw() +scale_fill_grey() + coord_flip() gridExtra::grid.arrange...，其他可替代柱状图的图形包含棒棒糖图（Lollipop）、环形柱状图等未在本文中展开介绍，有兴趣的小伙伴可参考文章最后的参考资料。

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R-ggplot2

BUT, HOWEVER 组会上把精心调好的图展示出来的时候，还是有时候会觉得不太好看于是乎就有了今天这篇帖子，旨在搜罗网上比较全的颜色贴，好好滴总结一波，希望可以帮到同样是选择困难症的你。...示例数据本次演示采用“[全球sc- PDSI(干旱指数)1901-2018年的月尺度数据](https://links.jianshu.com/go?...to=https%3A%2F%2Fcrudata.uea.ac.uk%2Fcru%2Fdata%2Fdrought%2F)” 中的2018年12月的数据进行绘图示例。...\\2019-12-07\\plot\\plot_rcolor_brewer2.png',height=26,width=26,units='cm',res=1000)p_rcolor_brewer=grid.arrange...\\2019-12-07\\plot\\plot_rcolor_brewer3.png',height=15,width=26,units='cm',res=1000)p_rcolor_brewer=grid.arrange

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R语言绘制靓图--ggthemr、gsci、tvthemes主题包

1 ggthemr 一般情况下只会设置palette 参数，指定主题名称，其它均为默认参数【即每种主题的字号，磅值，图边距等均可修改】。...scale_color_npg() + ggtitle("scale_color_npg()") p2_npg = p2 + scale_fill_npg() + ggtitle("scale_fill_npg()") grid.arrange...scale_color_aaas() + ggtitle("scale_color_aaas()") p2_aaas = p2 + scale_fill_aaas() + ggtitle("scale_fill_aaas()") grid.arrange

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数据可视化的最佳解决方案：ggplot2

前言 ggplot是一个拥有一套完备语法且容易上手的绘图系统，在Python和R中都能引入并使用，在数据分析可视化领域拥有极为广泛的应用。...本篇从R的角度介绍如何使用ggplot2包，首先给几个我觉得最值得推荐的理由：采用“图层”叠加的设计方式，一方面可以增加不同的图之间的联系，另一方面也有利于学习和理解该package，photoshop...和对应的函数即可在R中找到函数说明文档和对应的实例在R和Python中均可使用，降低两门语言之间互相过度的学习成本基本概念本文采用ggplot2的自带数据集diamonds。...下面展示箱线图最长使用的一些方法： library(ggplot2) # 绘图 library(ggsci) # 使用配色 # 使用diamonds数据框, 分类变量为cut, 目标变量为depth...当研究某个连续型变量的箱线图涉及多个离散型分类变量时，我们常使用分面facetting来提高图表的可视性。

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67-R可视化11-用ggrepel更加美观的添加标记（火山图的实现）

text 文本，都可以非常理想的实现我们希望达到的效果。...title = "geom_text()") p2 <- p + geom_text_repel() + labs(title = "geom_text_repel()") gridExtra::grid.arrange...geom_point() + geom_label_repel(box.padding = 0.5) + labs(title = "max.overlaps = Inf") gridExtra::grid.arrange...direction = "y", hjust = 1, segment.size = 0.2 ) + ggtitle("hjust = 1") gridExtra::grid.arrange...position = position_nudge_repel(y = -2) ) + labs(title = "position_nudge_repel()") gridExtra::grid.arrange

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R语言ggmap空间可视化机动车交通事故地图|附代码数据

p=12350 最近我们被客户要求撰写关于空间可视化的研究报告，包括一些图形和统计输出。在本文中，我使用ggmap可视化纽约市的交通事故数据来自纽约市开放数据。...我还解析日期变量以创建年份变量，并使用该变量创建两个数据集：一个数据集包含2013年的所有车辆事故，另一个数据集包含2014年的所有车辆事故。...我使用stat_density2d（）向该地图添加了一个二维密度层。我对2013年和2014年的数据都执行此操作，并使用gridExtra的grid.arrange（）并排放置地图。...ny_plot=ggmap(get_map('New York, New York',zoom=12, maptype='terrain')) grid.arrange(plot1, plot2,...我使用stat_density2d的group参数以不同的颜色分别绘制每个自治市镇的密度层。

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ggplot2学习笔记之图形排列

gridExtra::grid.arrange() grid.arrange(bxp, dp, bp+rremove("x.text"), ncol=2, nrow=2) ?...改变排列图的行列设置面板为两行两列，其中sp占据第一行的两列，bxp以及dp置于第二行的两列 ggarrange(sp, #First row with scatter plot(sp) ggarrange...R包gridExtra gridExtra::arrangeGrop()改变行列分布下面将sp置于第一行并横跨两列，而bxp和dp分别分布于第二行两列 grid.arrange(sp, #First...也可以通过函数grid.arrange中的layout_matrix来设置复杂的图形布局 grid.arrange(bp, #bar plot spaning two columns bxp, sp...要相对grid.arrange()以及arrangeGrob()的输出进行注释，首先要利用as_ggplot()将其转化为ggplot图形，进而利用函数draw_plot_label()对其进行注释。

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mapmixture包优雅绘制个性化地图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一款新R包「mapmixture」其主要用来绘制地图并将数据以饼图的形式进行映射，非常的好用并且兼容ggplot2,更多详细内容请参考作者官方文档，有更多详细的案例...axis.title.y = element_text(size = 8, hjust = 1), axis.text.y = element_text(size = 5), ) grid.arrange..., strip.text = element_text(size = 6, vjust = 1, margin = margin(t=1.5, r=0, b=1.5, l=0)), ) grid.arrange

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神仙级的配色，为你的文章增光添彩！

一篇优秀的SCI论文，除了要有好的结果外，如何对结果进行可视化展示、如何对可视化图形进行配色都是SCI的加分项，今天小编给大家介绍的就是CNS级的文章配色，让你再也不用为文章配色而纠结...提供了一系列的调色板，目前有18种配色方案，收录了来自顶级的科学期刊的配色、数据库可视化中的配色、科幻电影中的主题配色以及电视节目中高级的配色，不论是离散型的配色还是连续型的配色统统都有，一应俱全。...GSEA Material Design 接下来就是如何使用了…… Step1.安装和加载 R包的使用方法无非包含两步：安装和加载安装方法： if (!...dodge") + theme_bw()#绘制柱状图 #NPG p1_npg <- p1 + scale_color_npg() p2_npg <- p2 + scale_fill_npg() grid.arrange...element_blank() ) #GSEA p3_gsea <- p3 + scale_fill_gsea() p3_gsea_inv <- p3 + scale_fill_gsea(reverse = TRUE) grid.arrange

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R绘图笔记 | 二维散点图与统计直方图组合

三.方法3 利用grid.arrange()函数。...library(gridExtra) #(a) 二维散点与统计直方图 # 绘制主图散点图，并将图例去除，这里point层和path层使用了不同的数据集 scatter grid.arrange(hist_top, empty, scatter, hist_right, ncol=2, nrow=2, widths=c(4,1), heights=c(1,4)) ?...# 绘制主图散点图，并将图例去除，这里point层和path层使用了不同的数据集 scatter <- ggplot() + geom_point(data=data2,aes(x=x,y=y,fill...grid.arrange(hist_top, empty, scatter, hist_right, ncol=2, nrow=2, widths=c(4,1), heights=c(1,4)) ?

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空转 | 结合scRNA完成空转spot注释（Seurat Mapping） & 彩蛋（封面的空转主图代码）

本文介绍下使用Seurat的实现Mapping结合的方式，主要是将基于scRNA的细胞亚型定位到HPRI图谱上，后续会介绍SPOTlight ，CARD 等Deconvolution 的方式。...数据来源：GSE179373 和 GSE179572 ，或者后台回复 “空转数据”即可获得本文使用的patient16数据。...grid.arrange 函数自定义空转图形的分布，参考2022年Immunity文献。...（3）lapply 得到图形的list结果，grid.arrange 来拼图，可以随意调整位置和比例，是直接FeaturePlot得不到的。...下次介绍使用SPOTlight 解卷积的方式进行空转spot的注释。

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