HBase原生自带了对RowKey的很多种查询策略。通过这个过滤器可以在HBase中的数据的多个维度（行，列，数据版本）上进行对数据的筛选操作，也就是说过滤器最终能够筛选的数据能够细化到具体的一个存储单元格上（由行键，列明，时间戳定位）。 其API中提供的Filter大致如下： CompareFilter 是高层的抽象类，下面我们将看到他的实现类和实现类代表的各种过滤条件 RowFilter,FamliyFilter,QualifierFilter,ValueFilter 行，列组，列，值等的过滤
Burrows–Wheeler 算法是一个革命性的压缩算法，可以对 gzip 和 PKZIP 进行压缩，并且构成了 Unix 系统压缩工具 bzip2 的基础，该算法分为 3 个主要的部分：
作者：Kade Killary 机器之心编译 参与：Nurhachu Null、思源 对很多数据科学家而言，他们的数据操作经常需要使用 Pandas 或者 Tidyverse。理论上，这个说法没有任何错误，毕竟这就是这些工具存在的原因。然而，对于分隔符转换这样的简单任务而言，这些工具往往是大材小用，我们可以直接使用命令行快速处理。 命令行应该是每个开发者都希望掌握的，尤其是数据科学家。熟悉终端的来龙去脉可以毫无疑问地可以让我们变得更加有效率，因此命令行还是计算机技术中的一个很棒的历史课。例如，awk 这个
对于许多数据科学家来说，数据操作起始于Pandas或Tidyverse。从理论上看，这个概念没有错。毕竟，这是为什么这些工具首先存在的原因。然而，对于分隔符转换等简单任务来说，这些选项通常可能是过于重量级了。 有意掌握命令行应该在每个开发人员的技能链上，特别是数据科学家。学习shell中的来龙去脉无可否认地会让你更高效。除此之外，命令行还在计算方面有一次伟大的历史记录。例如，awk - 一种数据驱动的脚本语言。Awk首次出现于1977年，它是在传奇的K&R一书中的K，Brian Kernighan的帮助下出现的。在今天，大约50年之后，awk仍然与每年出现的新书保持相关联！ 因此，可以肯定的是，对命令行技术的投入不会很快贬值的。
BWA-MEM是李恒大神于2010在bioinformatics发布的一款比对软件
plink是进行连锁不平衡分析的常用工具之一，需要两个基本的输入文件，后缀分别为ped和map。ped文件格式在之前的文章中已经详细介绍过，这里只介绍map文件。
linux shell 常见的面试问题，基本是先让你随便说一些，测试一下你掌握的广度，这时候你至少要说上十个才行，但是！不要说太难的，否则很容易掉进自己的坑里，相当于提醒了面试官去问你 : find ,vi编辑器这种会让面试官出一个极复杂的命令。但是之后 面试官仍然会出一些 非常复杂的命令，本小节复习，除了基础中常见的命令之外，还有常见的复杂命令。
我们所用的linux版本是centos7，我们的linux搭建是在腾讯云服务器上搭建的，借助Xshell登录服务器，在root下进行命令行的操作。
grep （global search regular expression(RE) and print out the line，全面搜索正则表达式并把行打印出来）是一种强大的文本搜索工具，它能使用正则表达式搜索文本，并把匹配的行打印出来。用于过滤/搜索的特定字符。可使用正则表达式能配合多种命令使用，使用上十分灵活。
运算符说明示例等于 (=)用于检索列中与指定值相等的行。示例：SELECT * FROM employees WHERE department_id = 1;不等于 (<>, !=)用于检索列中与指定值不相等的行。示例：SELECT * FROM products WHERE category <> 'Electronics';大于 (>)用于检索列中大于指定值的行。示例：SELECT * FROM orders WHERE total_amount > 1000;小于 (<)用于检索列中小于指定值的行。示例：SELECT * FROM students WHERE age < 18;大于等于 (>=)用于检索列中大于或等于指定值的行。示例：SELECT * FROM employees WHERE salary >= 50000;小于等于 (<=)用于检索列中小于或等于指定值的行。示例：SELECT * FROM products WHERE price <= 50;这些比较运算符可以在WHERE子句中灵活使用，帮助过滤出满足特定条件的数据。在实际应用中，可以根据需要组合多个条件来实现更复杂的数据过滤。
如何检查Ubuntu Linux上的内存使用情况，我们可以安装并使用Smem内存报告工具来显示Ubutnu Linux系统上的内存使用情况。 Smem是一个命令行工具，用于检查Linux，每个进程的内存使用情况，百分比或图表。 Stellarium smem是一个可以在Linux系统上提供大量内存使用情况报告的工具。 与现有工具不同，smem可以报告比例集合大小（PSS），这是对虚拟内存系统中库和应用程序使用的内存量的更有意义的表示。 📷 Smem使用被称为Resident Set Size(RSS)的标准
自动化推荐系统通常用于根据现有的偏好数据为用户提供他们感兴趣的产品建议。文献中通常描述了不同类型的推荐系统。我们这篇文章将突出介绍两个主要类别，然后在第二个类别上进一步扩展：
认识索引是什么东西非常关键，一个非常恰当的比喻就是书的目录页与书的正文内容之间的关系，为了方便查找书中的内容，通过对内容建立索引形成目录。因此，首先你要明白的一点就是，索引它也是一个文件，它是要占据物理空间的。
split命令：可以将一个大文件分割成很多个小文件，有时需要将文件分割成更小的片段，比如为提高可读性，生成日志等。
背景 企业微信作为典型企业服务系统，其众多企业级应用都需要全文检索能力，包括员工通讯录、企业邮箱、审批、汇报、企业CRM、企业素材、互联圈子等。下图是一个典型的邮件检索场景。 由于过去几年业务发展迅速，后台检索架构面临挑战： 1. 系统在亿级用户，xxx万企业下，如何高效+实时地检索个人企业内数据和所在企业全局数据。 2. 业务模型众多，如何满足检索条件/功能多样化需求。 3. 数据量庞大，检索文本几十TB，如何节约成本。 业界有被广泛使用的开源全文检索引擎，比如：lucene、sphinx等。它
关于周一 Eygle 在文章《千头万绪：从一道面试题看数据库性能和安全的方方面面》讲到的 SELECT* FROM girls WHERE age BETWEEN 18 and 24 and boyfriend='no' 这个 SQL，他 从数据库 SQL优化、数据安全、SQL审核、开发规范、IN-Memory 特性方面做了深入的分析。
文本文件中，一般需要指定导出数据的行记录分隔符，不同的数据需求，有些不一样，但因为它也是非常自由的，没有像Excel或数据库或xml、json这些结构化的数据。
简介 Linux系统中grep命令是一种强大的文本搜索工具，它能使用正则表达式搜索文本，并把匹 配的行打印出来。grep全称是Global Regular Expression Print，表示全局正则表达式版本，它的使用权限是所有用户。 grep的工作方式是这样的，它在一个或多个文件中搜索字符串模板。如果模板包括空格，则必须被引用，模板后的所有字符串被看作文件名。搜索的结果被送到标准输出，不影响原文件内容。 grep可用于shell脚本，因为grep通过返回一个状态值来说明搜索的状态，如果模板搜索成功，则
第一列第一个字段：文件类型，后面9个字符是模式，其中分为三组，每一组三个字段。第一组为所属用户权限。第二组为所属组的权限。第三组为其他用户所属权限。其中r(read)代表可读，w(write)代表可写，e(execute)代表可执行。在后面的9个字符中，如果是字母说明有相应的权限，如果为"-"代表没有权限。举一个例子
Pandas作为大数据分析最流行的框架之一。用好Pandas就像大数据工程师用好SQL用好Excel一样重要。如果你打算学习 Python 中的数据分析、机器学习或数据科学工具，大概率绕不开Pandas库。Pandas 是一个用于 Python 数据操作和分析的开源库。
Flux 是一种开源数据脚本语言，旨在查询、分析和处理数据。Flux支持多种数据源类型，包括：
对一个 Java 后端程序员来说，mybatis、hibernate、data-jdbc 等都是我们常用的 ORM 框架。它们有时候很好用，比如简单的 CRUD，事务的支持都非常棒。但有时候用起来也非常繁琐，比如接下来我们要聊到的一个常见的开发需求，最后本文会给出一个比直接使用这些 ORM 开发效率至少会提高 100 倍的方法（绝无夸张）。
在使用 smem 命令时，有几个注意事项可以帮助你更有效地利用这个工具并避免潜在的误解或错误。以下是几点重要的使用注意事项：
https://github.com/mingongge/Learn-a-Linux-command-every-day
2.xlwt保存的表格后缀必须为xls,而openpyxl可保存xlsx和xls
Linux，全称GNU/Linux，是一种免费使用和自由传播的类UNIX操作系统，其内核由林纳斯·本纳第克特·托瓦兹于1991年10月5日首次发布，它主要受到Minix和Unix思想的启发，是一个基于POSIX的多用户、多任务、支持多线程和多CPU的操作系统。
即将ex3.csv中的内容提取出来，传递给变量test，生成一个数据框。后续对数据框的操作，对文件无影响。
HBase的下载与安装 (HBase是一种数据库：Hadoop数据库，它是一种NoSQL存储系统，专门设计用来快速随机读写大规模数据。本文介绍HBase的下载与安装的整个过程。) 一、HBase的下载 1.登录HBase官网http://hbase.apache.org/，可看到如图1所示的页面： 图1 登录HBase官网的页面 2.点击图1中的红色小框中的“here”，进入如图2所示的页面。 图2 下载链接 3.点击图2中的红色小框中的链接，进入如图3所示的下载页面。 图3 下载
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))：
今天我们继续聊聊麻省理工的missing smester，消失的学期，讲解那些不会在课上提及的工具和技术。
特征: 两部分, id行和序列行. - id行:以“>”开头, 有时候会包含注释信息，如 chr1、chr2 ... - 序列行:一个字母表示一个碱基/氨基酸，ATCGN 或 20种氨基酸
Apache Solr 是广泛使用的搜索引擎。有几个著名的平台使用 Solr；Netflix 和 Instagram 是其中的一些名称。我们在 tajawal 的应用程序中一直使用 Solr 和 ElasticSearch。在这篇文章中，我将为您提供一些关于如何编写优化的 Schema 文件的技巧。我们不会讨论 Solr 的基础知识，我希望您了解它的工作原理。 虽然您可以在 Schema 文件中定义字段和一些默认值，但您不会获得必要的性能提升。您必须注意某些关键配置。在这篇文章中，我将讨论这些配置，您可以使用它们在性能方面充分利用 Solr。 事不宜迟，让我们开始了解这些配置是什么。
注意：一定要经常检查数据，注意读取之后是数据框还是矩阵，取完列里面是数值还是字符，处理完是什么类型等等
原文地址：https://suzan.rbind.io/2018/02/dplyr-tutorial-3/ 作者：Suzan Baert 这是系列dplyr系列教程中的第三篇博客文章。 在这篇文章中，我们将介绍如何挑选您的数据。 除了filter的基础知识外，它还介绍了一些更好的方法，用near（）和between（）挑选数字列，或用正则表达式过滤字符串列。
工作中经常需要汇总数据而不是将它们全部检索出来（实际数据本身：返回实际数据是对时间和处理资源的浪费），这种类型的检索有以下特点：
正则表达式: 匹配一组字符: #[ns]a.\.xls //[]用于限定字符；“.”用于匹配任意字符; \.用于转义"." 匹配到s/na*.xls [nN] 匹配大小写；[0-9] 匹配0-9数字；[a-zA-Z0-9] 匹配任意字符数字 注意:"-"(连字符)是一个特殊的元字符,作为元字符只能用在[]中间 用^元字符进行取非操作，但是必须用在[]之间 #[ns]a[^0-9]\.xls 匹配n/sa*.xls *表示任意字符 使用元字符: 元字符自己使用必
两章前，在 OSEMN 数据科学模型的第一步，我们看到了从各种来源获取数据。这一章讲的都是第二步：清理数据。你看，你很少能立即继续探索甚至建模数据。您的数据首先需要清理或清理的原因有很多。
在之前的一篇博客中分享了关于权限的一些知识，这次紧接上次的进行，有需要了解上次的可以点这个 link。 话不多说，继续开始权限篇。
在之前的办公自动化系列文章中，我已经对Python操作Excel的几个常用库openpyxl、xlrd/xlwt、xlwings、xlsxwriter等进行了详细的讲解。
Gene Set Enrichment Analysis是一种富集算法，由Broad Institute研究所的科学家提出，算法核心示意如下
在SELECT语句中使用星号“”通配符查询所有字段 在SELECT语句中指定所有字段 select from TStudent;
在上一期中，还记得我们留下的那个彩蛋吗？我们在对多列标准进行筛选时，在之前我们还进行了一步非常重要的提取，也就是将每一列观察值提取出某一特定的字段，而后生成一系列变量，这些变量的观测值只可能存在三种情况：醛固酮、继发性醛固酮或者NA。
日志样子举例如下： http://youku.com 200 http://youku.com 302 http://youku.com 403 http://youku.com 502 http://baidu.com 302 http://baidu.com 404 现想使用awk命令按域名统计 返回码大于等于400的百分比，假如优酷总共有4行，大于等于400的返回码有两行，那占比就为50%
同样可以配合正则表达式来搜索文本，并将匹配的行打印输出,也可用于过滤与搜索特定字符串，使用十分灵活
pico是一个简单易用、以显示导向为主的文字编辑程序，具有pine电子邮件编写器的风格。在现代Linux系统上，nano即pico的GNU版本是默认安装的，在使用上和pico一模一样。
ClickHouse 虽然是OLAP数据库，但是它也提供了行级数据删除的功能，你可以通过 ALTER TABLE xxx DELETE WHERE xxx 来实现 。
通过GenomeStudio的methylation 模块，可以方便的对甲基化芯片数据进行分析。这个软件主要提供了定量和差异两种分析，今天先看一下如何进行定量分析。
常见错误:read.table("ex1.txt"), read.table函数默认header = F,因此会自动加列名"V1","V2"，会导致所在列数据格式变化
之前写 datamash 的使用教程 linux 极简统计分析工具 datamash 必看教程，收到了一位读者的私信，内容如上。
（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替 （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中称为数据框^_^ （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。 （8）数据类型（重点只有两个）
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