我安装了用于医学图像配准的SimpleITK。它对于3D CT/CT和3D CT/MRI图像配准非常有效。现在我想实现模型/图像配准。该模型是一个球体。在ITK中有空间对象，如Box，Ellipse，可用于模型/图像配准。但我在SimpleITK中找不到这些对象。我是否应该从模型创建一个假图像</e
浏览 15提问于2016-12-03得票数 1
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我想做多模态图像配准(mri/ct)，但我没有完全对齐的图像，用simpleITK获得的非常差。即使我尝试将它们对齐，仍然糟糕得离谱。我能做些什么来解决这个问题呢？我的注册代码如下：def fusion(ct, mr):
fixed = sitk.GetImageFromArray(ct, isVector
浏览 327提问于2017-11-26得票数 0
我已经注册了两个图像，比如说固定图像和移动图像。注册后，我想测量重叠率等。SimpleITK有重叠度量过滤器，为了使用overlap_measures_filter.Execute(固定，移动)和hausdroff_measures_filter.Execute()，我们需要分割图像，我们需要在输入中使用标签。但仅使用阈值或连通分量滤波器很难分割图像。
现在的问题是，我们如何使用SimpleITK对
浏览 3提问于2017-03-19得票数 1
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SimpleITK:应用逆变换
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我最近开始使用SimpleITK进行图像配准。对于我目前的项目，我需要注册X射线图像和CT图像，然后应用逆矩阵在ROI掩膜上跟踪X射线图像。
浏览 1提问于2018-08-29得票数 2
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我正在使用simpleITK进行图像配准，这是一个很好用的工具。但不幸的是，在新的版本中，我们不能计算互信息值。我尝试过其他的计算方法，但最终发现不适用于计算图像的互信息(如sklearn包)。
浏览 38提问于2020-08-19得票数 1
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对于3D图像的配准和分割，我有一些疑问：
加载dicom图像:在DCE中有4000个切片和总共100个堆栈，所以每个堆栈中有40个.如何使用GDCM simpleITK函数将它们加载到4D数组中？配准精度: SimpleITK重叠比测量或重叠距离需要分割和标记。目前，利用区域生长或阈值分割对各种图像都是不容易的。假设我只想手动地、交互式地选择一个区域。是否有可能做到这一点？可视化和编写:需要使用
浏览 9提问于2017-03-22得票数 0
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我对医学图像配准非常陌生。我正在尝试配准两个CT卷，第一个是轴向扫描，大小为(384,384,31)，间距为(0.57,0.57,4.8)；第二个是矢状扫描，大小为(384,384,15)，间距为(0.67,0.67,2.2)，以便使用它们之间的重叠区域来创建超分辨率并获得各向同性扫描。也就是说，矢状扫描中的轴向切片只包含轴向扫描中存在的一小部分，换句话说，我需要裁剪轴向扫描中的轴向切片以匹配矢状切片的视场，依此类推，以便为simpleitk刚性配<e
浏览 4提问于2018-07-13得票数 1
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我想用这个项目作为参考/框架，用C#实现一个新的医学图像配准图形用户界面。但是，我在编译后的SimpleElastix解决方案中没有找到任何.dll文件。或者如何在新的C#项目中使用SimpleElastix作为参考/框架？
1 SimpleElastix是一个基于ITK和SimpleITK的医学图像配准项目，兼容python、C#、Java等。
浏览 3提问于2016-11-10得票数 1
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我已经从源代码中安装了SimpleITK包在Python3上。当我执行提供的注册示例时：在编写Python ImageRegistrationMethod1.py image_ref.tif image_moving.tif res.tif映像并触发以下错误之前，使用/
浏览 9提问于2020-06-01得票数 1
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我知道图像配准/对齐的基本流程或过程，但是当两个图像配准/对齐时，在像素级别会发生什么，即转换为固定图像的运动图像的相似像素保持完好，但不匹配的像素会发生什么情况，它们是平均还是其他什么？我已经实现了https://simpleitk.readthedocs.io/en/master/Examples/ImageRegistrationMethod1&#x
浏览 61提问于2019-04-29得票数 0
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我有一个关于生物医学图像分析的一般性问题。因为生物医学图像需要配准，以便在相同空间中对齐图像并更好地提取特征。我的问题是，基于深度学习的分类是否也需要训练数据集图像的图像配准？在深度学习中，架构本身定义了最佳特征，使用深度神经网络进行腹部CT扫描图像分类是否需要注册？当我们为了更好地训练数据而进行数据增强时，这种情况下还需要图像配</em
浏览 34提问于2019-06-04得票数 1
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我目前正在使用“注册估计器”应用程序进行图像注册。 基本上，该应用程序允许用户使用多种方法注册两个图像，并且输出包括变换矩阵。问题是，现在我想要配准两个大图像，这两个图像的大小分别为63744*36064和64704*35072。直接配准两个图像几乎不可能，因为它们太大了。我使用的方法是首先获得用于配准的缩放图像</em
浏览 44提问于2019-06-05得票数 0
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我试图使用复合转换(TranslationTransform + ScaleTransform)进行注册。它的概念是先与翻译相结合，再进行翻译，然后根据初始配准的求解给出的翻译的初始变换进行缩放。我想出两种方法来解决这个问题：
提出了一种在配准过程中保持一定参数不变的高阶变换方法。编辑您不允许对L类型的优化器进行SetOp
浏览 4提问于2021-04-01得票数 2
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连接图像以生成更大的图像
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我有一些图像，它们的文件名是相应的GPS数据(长/纬度)，我正在尝试使用MATLAB将它们放在一起，制作一个更大的图像！换句话说，我想通过几张航拍照片来创建一张本地地图。任何人有任何想法或知道任何软件，真正工作，以拼接一些图像，以形成一个更大的图像？
谢谢
浏览 1提问于2017-07-21得票数 0
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有一些表格，即空白-例如在调查中使用的表格。那些没有填充信息的，我将从现在开始调用图像模板。除了图像模板之外，我还有许多图像，它们本质上是充满信息的图像模板。例如，有一项调查，有两个要填写的空白-这两个是图像模板。许多人用他们的个人信息填满了空白处，这些就是图片。
图像模板以完美的形状进行扫描。但许多扫描的图像是倾斜的，或者没有正确对齐，或者可能是缩放的。因此，我有以下要求-每个图像必须被识别到它属于哪个图像
浏览 1提问于2010-07-27得票数 4
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图像1-只是一个图像。图像2-图像1的(近似)仿射变换。如果重要的话，这些图像都是空中照片，每隔50到2000毫秒拍摄一次。
浏览 3提问于2016-07-14得票数 0
因此，我使用在同一患者之间配准fMRI脑图像；然而，我在患者之间配准图像时遇到了问题。SPM在这样的注册中失败。它不能将地图集扭曲成与病人的大脑相同的大脑形状。
像这样的软件会对此有好处吗？
浏览 0提问于2011-07-21得票数 2
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在Matlab中，我有两个相似的图像，但其中一个与另一个相比有一个像素偏移。如何计算轴x和y的偏移量(像素量)？
浏览 14提问于2021-12-01得票数 0
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