pymongo的使用 首先安装： pip install pymongo 安装好了使用 import pymongo # 链接mongodb，得到一个mongoclient的客户端对象 client...= pymongo.MongoClient() # 指定数据库 db = client.test db = client["test"] # 这两种方式都可以指定数据库，如果没有该数据库的话，会自行创建...，res可以继续使用该对象里的方法，我们通过print，或者for循环这个对象，只是触发了它里面的一些内置方法。..."zhuyu"}) res_dict["age"] = 23 collection.update({"name":"zhuyu"},res_dict) # 对了，就算根据筛选条件得出的结果有多条，也只会更新其中的一条文档...# update_one,也是至少传递两个参数，具体的参数可以去看源码，他只会将参数二的给的字段的值进行更新，不会像update那样，整条数据都进行更新 # 还是继续上面那个例子：将age字段改为23
mongo_DB = client['video'] # 指定需要操作的数据库中的表 video_old = mongo_DB.video_old 二、增 一、增（插入单条，系统已经不推荐使用...，数组里面包含的插入的多个信息的_id # result2 = [ObjectId('5ee2e638c9f38c53aaf5728b'), ObjectId('5ee2e638c9f38c53aaf5728c...object at 0x7f9ad488f7f0 > # type = pymongo.cursor.Cursor'> # 注意一、返回结果是Cursor类型，相当于一个生成器...，我们需要遍历取到所有的结果，每一个结果都是字典类型。 ...= 3 可以使用该值不为0判断删除是否成功 # result16.raw_result = {'n': 3, 'ok': 1.0}
插入到集合中： 要将记录（在MongoDB中称为文档）插入到集合中，使用insert_one()方法。insert_one()方法的第一个参数是一个包含文档中每个字段的名称和值的字典。...在find()方法中不指定参数会给出与SQL中的SELECT *相同的结果。..."] mycol = mydb["customers"] for x in mycol.find(): print(x) 仅返回部分字段： 如果想仅返回部分字段，可以在find()方法的第二个参数中指定要包含在结果中的字段...例如，使用大于修饰符 $gt 可以查找 "address" 字段以字母 "S" 或更高字母（按字母顺序）开头的文档。...例如，要仅查找 "address" 字段以字母 "S" 开头的文档，可以使用正则表达式 {"$regex": "^S"}。
# 使用db数据库 # show dbs # 查看当前服务器中写在磁盘上的数据库 # show tables # 查看数据库中的collection # db # 查看当前使用的数据库...hobby 数组里的 100 改成 250 # hobby 的 100 对应的索引会在市保存在 $ 里面，hobby.$ 会根据下标找到这个值并替换 # db.user_info.updateOne({...db.user_info.updateOne({name:'张三', 'info.weight':111},{$set:{'info.$.height':250}}) 5.7 limit 、skip 、sort 的使用以及分页的实现...sort 其次优先为 skip 最低优先级 limit 6.pymongo 对 MongoDB 的增删改查 6.1创建连接 import pymongo # 根据 str 类型的 ObjectId...查询数据 from bson import ObjectId # 创建连接 mongo_conn = pymongo.MongoClient(host='localhost', port=27017)
连接MongoDB 连接MongoDB我们需要使用PyMongo库里面的MongoClient，一般来说传入MongoDB的IP及端口即可，第一个参数为地址host，第二个参数为端口port，端口如果不传默认是..._id的集合，运行结果： [ObjectId('5932a80115c2606a59e8a048'), ObjectId('5932a80115c2606a59e8a049')] 实际上在PyMongo...值得注意的是，在数据库数量非常庞大的时候，如千万、亿级别，最好不要使用大的偏移量来查询数据，很可能会导致内存溢出，可以使用类似find({'_id': {'$gt': ObjectId('593278c815c2602678bb2b8d...另外update()方法其实也是官方不推荐使用的方法，在这里也分了update_one()方法和update_many()方法，用法更加严格，第二个参数需要使用$类型操作符作为字典的键名，我们用示例感受一下...，而是需要使用{'$set': student}这样的形式，其返回结果是UpdateResult类型，然后调用matched_count和modified_count属性分别可以获得匹配的数据条数和影响的数据条数
// Pymongo的一个小坑 // 这两天遇到一个线上的问题，是关于Pymongo处理时间方面的，这里记录一下，希望对大家有帮助。...这个问题看起来似乎变的很玄乎，设置了生效时间，结果没有删除掉，根据刚才我们了解的TTL特点，它可能是以下几个问题： 1、这个字段上还有其他的索引 2、索引刚刚创建好，需要等待一段时间才可以看到被删除后的结果...简单说，就是从pymongo驱动将当前时间写入到mongodb数据库的时候，时间字段需要使用python的utcnow()函数来写入，而不能使用now()函数。...highlight=date 到这里，我们需要进一步测试验证自己的猜想，于是我自己用pymongo写了一个小脚本来写入数据，给yeyz的timetest表里面插入一条数据，看看数据的结果是多少： #...说明只有使用utcnow()的时候，pymongo才能写入正确的时间字段，否则，时间字段的转换就会出错，写入时间将是单签时间未来8小时的时间。
1.连接mongodb ######### 方法一 ########## import pymongo # MongoClient()返回一个mongodb的连接对象client client =...的第一个参数host还可以直接传MongoDB的连接字符串，以mongodb开头 client = pymongo.MongoClient(host="mongodb://127.0.0.1:27017...pymongo 3.x版本中，insert()方法官方已不推荐使用，推荐使用insert_one()和insert_many()将插入单条和多条记录分开。...例如，查询名字以 M 开头的学生数据，示例如下： results = collection.find({'name': {'$regex': '^M.*'}}) 这里使用 $regex 来指定正则匹配，...可以使用 find({'_id': {'$gt': ObjectId('593278c815c2602678bb2b8d')}}) 这样的方法来查询。
我将使用 MongoDB 驱动程序 PyMongo 建议您使用 PIP 来安装 PyMongo。PIP 很可能已经安装在您的 Python 环境中。...测试 PyMongo 为了测试安装是否成功，或者如果您已经安装了 pymongo，请创建一个包含以下内容的 Python 页面： demo_mongodb_test.py import pymongo...创建集合 要在 MongoDB 中创建集合，请使用数据库对象并指定要创建的集合的名称。如果集合不存在，MongoDB 将创建该集合。...插入集合 要将记录（在 MongoDB 中称为文档）插入集合，我们使用 insert_one() 方法。insert_one() 方法的第一个参数是一个包含文档中每个字段的名称和值的字典。...在上面的示例中，未指定 _id 字段，因此 MongoDB 为记录（文档）分配了唯一的 _id。 插入多个文档 要在 MongoDB 的集合中插入多个文档，我们使用 insert_many() 方法。
窗口操作的结果还是一个DataStream,没有保留的信息窗口的操作结果元素,没有关于窗口操作的信息被保留在结果元素中，所以如果你想保留关于窗口的元信息，你必须手动将这些信息编码到ProcessWindowFunction...的结果元素中。...连续窗口的操作 如前所述，计算加窗结果的时间戳的方式以及水印与窗口交互的方式允许将连续加窗操作串在一起。...当你想要执行两个连续的窗口操作，你想使用不同的键，但仍然希望来自相同的上游窗口的元素最终在相同的下游窗口时，这是很有用的。...[0,5)的结果也将在后续加窗操作的时间窗口[0,5)中结束。
前言： 工欲善其事必先利其器，用pymongo库之前，大家需首先对MongoDB数据库的增删改查操作有一些基础方法的了解。...我们在这里使用linux上的ipython交互环境来pymongo库的知识点系统性讲解。 一：如何用python连接MongoDB数据库?...1.1、使用MongoClient()方法建立连接 import pandas as pd from pymongo import MongoClient #实例化client,建立连接 client...接着，我们再来根据指定条件查询细分查询 在这里我们查询name为JOSIE的mygirlfriend集合数据，它的返回结果是字典类型，运行结果： result = collection.find_one...以 S 开头的文档数据在mygirlfriend集合已经删除了 在这里使用了$regex来指定正则匹配，^S.*代表以S开头的正则表达式，这样就可以查询所有符合该正则的结果。
pymongo模块是python操作mongo数据的第三方模块，记录一下常用到的简单用法。...pymongo import MongoClient conn = MongoClient('数据库所在地址', 端口号)db_name = conn.tech_stargatedb_name.authenticate...第二行代码表示创建想要连接数据库的对象。tech_stargate是想要连接的数据库名第三行代码表示连接该数据库。第四行代码表示创建想要操作的数据库表的对象。...'phoneNo':'xxxxx'},{'$set':{'想要修改的字段名':'对应的值'}})表示用phoneNo字段，也就是手机号来定位要修改该表的哪一条数据。...也可以传入一个dict作用查询条件，键是字段名，值是具体字段值，一般find()方法通过for循环使用。
count字段都是0 import pymongo handler = pymongo.MongoClient().story_project.story story = list(handler.find...此时，就要用到 pymongo 的find_one_and_update方法。它根据特定条件查询一条记录，同时更新这条记录的 count 值。...find_one_and_update的使用方法如下： import pymongo handler.find_one_and_update({}, {...第二个参数表示更新的内容，与update_one的第二个参数一致。sort表示排序方式，它的值是一个包含元组的列表，元组的第一个元素为被排序的字段名，第二个元素为1表示升序，为-1表示降序。...参考资料 [1] 官方文档: https://api.mongodb.com/python/current/api/pymongo/collection.html#pymongo.collection.Collection.find_one_and_update
platformName": "$platformName"}, "count": {"$sum": 1}}}, {"$match": {"count": {"$gt": 1}}}] #在执行的时候添加游标参数
MongoDB MongoDB是一种流行的NoSQL数据库，它将数据存储在类似JSON的文档中，使数据库非常灵活和可扩展 PyMongo Python需要一个MongoDB驱动程序来访问MongoDB数据库...在本教程中，我们将使用MongoDB驱动程序 "PyMongo"。建议使用PIP来安装 "PyMongo"，确保您的Python环境已安装PIP。...在命令行中导航到PIP的位置，然后运行以下命令来下载并安装 "PyMongo"： python -m pip install pymongo 现在，您已经成功下载并安装了MongoDB驱动程序 "PyMongo...import pymongo 现在您已经准备好开始使用Python与MongoDB进行数据库操作。...您可以通过以下方法来检查数据库是否存在： 返回系统中的所有数据库的列表: print(myclient.list_database_names()) 或者您可以按名称检查特定数据库： dblist =
第三单元第十二+十三讲：使用作者代码重复结果 课程链接在：http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?...（结果有点高）： # 计算dropout的比例 sum(expr_raw==0)/(dim(expr_raw)[1]*dim(expr_raw)[2]) # 0.8305757 读入ERCC数据 #...个细胞 根据一些指标去掉了52个细胞 作者也把这52个细胞的质控结果读入了R： cell_QC<-read.delim(paste(Path_Main,"/qc/qc_2plates.filtered_cells.txt...最后就是拿这5000多个基因做下游分析 看第三个R脚本 Dimensionality_reduction.R 这个脚本需要RPKM结果，因此需要先跑完上面第二个完整的脚本 降维主要使用tSNE，聚类使用...作为50次中效果最优的tSNE，然后主要关注tsne结果的itercosts opt_tsne <- tsne_out[[as.numeric(names(KL)[KL==min(KL)])]]$Y opt_tsne_full
DISTINCT 使用 DISTINCT 关键字可以去掉查询中某个字段的重复记录。...： username 小李 小张 小王 提示 使用 DISTINCT 关键字去掉重复记录具有较大的局限性。...可以尝试使用如下语法： SELECT DISTINCT(column),column1,column2,......FROM tb_name 该查询结果将返回列出的所有字段，但该查询往往使 column 的唯一性失效，且 column 1,column 2,… 不能放在 DISTINCT(column) 之前。...上面的例子如果要返回如下结果（这往往是期望中的）： uid username 1 小李 2 小张 3 小王 这时候就要用到 GROUP BY 关键字。
而前面我们演示了：使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化，是超几何分布检验的结果的可视化，主要是展示GO数据库的有向无环图结构。...接下来我们聊聊使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释后的结果的可视化，所以是需要大家自己提前弄清楚GSEA方法和超几何分布检验方法的区别哦！...：使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化 然后使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释 前面的DESeq2进行转录组差异分析后的表格里面有两万多个基因，需要对它们根据里面的...log2FoldChange对基因排序后的全部的基因的列表，而前面我们演示了：使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化，是超几何分布检验的结果的可视化只需要统计学显著的上下调的几百个基因即可。...clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释，和前面的 ：使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化，是超几何分布检验的结果，差异很多哦！
01 、介绍 Gin 框架为 JSON、XML 和 HTML 渲染提供了易用的API。 本文我们主要介绍 JSON 的使用方式。...02 、JSON 在 Go 项目开发中，当开发 HTTP API 时，我们通常提供 JSON 格式的返回结果。 Go 框架为 JSON 渲染提供了易用的 API。...，我们可以发现，使用 c.JSON() 方法，即可返回 JSON 格式的返回结果。...03 总结 本文我们介绍 Gin 框架为 JSON 提供的几种易于使用的 API。 gin.H 是 map[string]interface{} 的一种快捷方式。 返回结果也可以使用一个结构体。...": "hey", "Number": 123 } 阅读上面这段代码，我们使用一个结构体，输出 JSON 格式的返回结果。
在上篇文章中，我们初步探索了PHATE的使用方法，发现它在揭示一些连续分化过程中不同细胞状态之间的微小局部差异具有很好的效果，同时也能保留细胞全局的整体结构。...在本节教程中，我们将复现演示近期发表在Science Immunology期刊上的一篇文章的结果，进一步学习PHATE的相关使用方法。...，我已将其转换为TSV文件存放在我的百度云盘中，有需要的可以下载使用。...详细用法见上期 [使用PHATE进行单细胞高维数据的可视化] 使用PHATE进行低维嵌入降维可视化 ### analysis for chronic sample ### #Embedding Data...，我们将不同的cluster进行细胞类型的注释，得到以下的细胞注释结果。
在使用 Elasticsearch 进行全文搜索的时候，默认是使用 BM25 计算的 _score 字段进行降序排序的。...比如，虽然所有的结果都很匹配，但是我们也许不只单单是匹配 Final Fantasy，而且我们想把 user_score 和 critic_score 加进来（虽然你可以使用其中的一个）。...，但是它可以让我们每次进入一个网页看到不同的文档，而不是严格按照固定的匹配而得到的固定的结果。...我们的分数和之前的那个 soft_score 结果是不一样的，但是我们搜索的结果的排序是一样的。 在上面的 script 的写法中，我们使用了硬编码，也就是把10硬写入到 script 中了。...与使用 script_score 函数类似，但是它避免了脚本编写的开销。 如果用于多值字段，则在计算中仅使用该字段的第一个值。
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